Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09257
• Subject: XM_017018460.2
• Aligned Length: 1075
• Identities: 865
• Gaps: 167

Alignment

Query    1  ATGGCTTCTGGAATCCTGGTTAATGTAAAGGAGGAGGTGACCTGCCCCATCTGCCTGGAACTCCTGACACAACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCTGGAATCCTGGTTAATGTAAAGGAGGAGGTGACCTGCCCCATCTGCCTGGAACTCCTGACACAACC  74

Query   75  CCTGAGCCTGGACTGCGGCCACAGCTTCTGCCAAGCATGCCTCACTGCAAACCACAAGAAGTCCATGCTAGACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGAGCCTGGACTGCGGCCACAGCTTCTGCCAAGCATGCCTCACTGCAAACCACAAGAAGTCCATGCTAGACA  148

Query  149  AAGGAGAGAGTAGCTGCCCTGTGTGCCGGATCAGTTACCAGCCTGAGAACATACGGCCTAATCGGCATGTAGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGGAGAGAGTAGCTGCCCTGTGTGCCGGATCAGTTACCAGCCTGAGAACATACGGCCTAATCGGCATGTAGCC  222

Query  223  AACATAGTGGAGAAGCTCAGGGAGGTCAAGTTGAGCCCAGAGGGGCAGAAAGTTGATCATTGTGCACGCCATGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACATAGTGGAGAAGCTCAGGGAGGTCAAGTTGAGCCCAGAGGGGCAGAAAGTTGATCATTGTGCACGCCATGG  296

Query  297  AGAGAAACTTCTACTCTTCTGTCAGGAGGACGGGAAGGTCATTTGCTGGCTTTGTGAGCGGTCTCAGGAGCACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGAAACTTCTACTCTTCTGTCAGGAGGACGGGAAGGTCATTTGCTGGCTTTGTGAGCGGTCTCAGGAGCACC  370

Query  371  GTGGTCACCACACGTTCCTCACAGAGGAGGTTGCCCGGGAGTACCAAGTGAAGCTCCAGGCAGCTCTGGAGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGGTCACCACACGTTCCTCACAGAGGAGGTTGCCCGGGAGTACCAAGTGAAGCTCCAGGCAGCTCTGGAGATG  444

Query  445  CTGAGGCAGAAGCAGCAGGAAGCTGAAGAGTTGGAAGCTGACATCAGAGAAGAGAAAGCTTCCTGGAAGACTCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAGGCAGAAGCAGCAGGAAGCTGAAGAGTTAGAAGCTGACATCAGAGAAGAGAAAGCTTCCTGGAAGACTCA  518

Query  519  AATACAGTATGACAAAACCAACGTCTTGGCAGATTTTGAGCAACTGAGAGACATCCTGGACTGGGAGGAGAGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATACAGTATGACAAAACCAACGTCTTGGCAGATTTTGAGCAACTGAGAGACATCCTGGACTGGGAGGAGAGCA  592

Query  593  ATGAGCTGCAAAACCTGGAGAAGGAGGAGGAAGACATTCTGAAAAGCCTTACGAACTCTGAAACTGAGATGGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGAGCTGCAAAACCTGGAGAAGGAGGAGGAAGACATTCTGAAAAGCCTTACGAACTCTGAAACTGAGATGGTG  666

Query  667  CAGCAGACCCAGTCCCTGAGAGAGCTCATCTCAGATCTGGAGCATCGGCTGCAGGGGTCAGTGATGGAGCTGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCAGACCCAGTCCCTGAGAGAGCTCATCTCAGATCTGGAGCATCGGCTGCAGGGGTCAGTGATGGAGCTGCT  740

Query  741  TCAGGGTGTGGATGGCGTCATAAAAAGGACGGAG-AACGTGACCTTGAAGAAGCCAGAAACT---TTTCCAAAA  810
            ||||     .||||..|||||            | .|.||..|||      ||.|.|.|..|   |||  ||.|
Sbjct  741  TCAG-----AGATGCGGTCAT------------GCTATGTTGCCT------AGGCTGTACATCTGTTT--AATA  789

Query  811  AATCAAAGGAGAGTGTTTCGAGCTCCTGATCTGAAAGGAATGCTAGAAGTGTTTA------------GAGAGCT  872
            ||||||||                          |||.|.|     ||.|.||||            |||||| 
Sbjct  790  AATCAAAG--------------------------AAGCACT-----AATTATTTAAATCATTTCATGGAGAGC-  831

Query  873  GACAGATGTCCGACGCTACTGGGGTAAGGAGAAGTCACATTATCATAAGCCACCCTGCGGCTTATCATTATTAT  946
              ||.||     |||.|  |||    ||.|.||  ||.|||.||   ||.|||                     
Sbjct  832  --CATAT-----ACGTT--TGG----AGAAAAA--CAAATTGTC---AGTCAC---------------------  866

Query  947  TATCTTTATCTTTTAGAATTTTATGT----TCT-------CTATTAGGCTCATGTTTTAAGATTTATGA-----  1004
             .|||||..|||.||.|    .||||    |||       |.|..||.|||    ||..|.|...||||     
Sbjct  867  -TTCTTTTCCTTCTAAA----CATGTCCCATCTGCAGAAACCAGGAGCCTC----TTCCACAGGGATGAAAGCT  931

Query 1005  --TTCTCCTTCCAAGACACACATAACTTACCCCTCCTTA  1041
              ||||.|||.                            
Sbjct  932  ATTTCTACTTT----------------------------  942