Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09257
- Subject:
- XM_017018461.2
- Aligned Length:
- 1096
- Identities:
- 856
- Gaps:
- 221
Alignment
Query 1 ATGGCTTCTGGAATCCTGGTTAATGTAAAGGAGGAGGTGACCTGCCCCATCTGCCTGGAACTCCTGACACAACC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCTGGAATCCTGGTTAATGTAAAGGAGGAGGTGACCTGCCCCATCTGCCTGGAACTCCTGACACAACC 74
Query 75 CCTGAGCCTGGACTGCGGCCACAGCTTCTGCCAAGCATGCCTCACTGCAAACCACAAGAAGTCCATGCTAGACA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTGAGCCTGGACTGCGGCCACAGCTTCTGCCAAGCATGCCTCACTGCAAACCACAAGAAGTCCATGCTAGACA 148
Query 149 AAGGAGAGAGTAGCTGCCCTGTGTGCCGGATCAGTTACCAGCCTGAGAACATACGGCCTAATCGGCATGTAGCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGGAGAGAGTAGCTGCCCTGTGTGCCGGATCAGTTACCAGCCTGAGAACATACGGCCTAATCGGCATGTAGCC 222
Query 223 AACATAGTGGAGAAGCTCAGGGAGGTCAAGTTGAGCCCAGAGGGGCAGAAAGTTGATCATTGTGCACGCCATGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACATAGTGGAGAAGCTCAGGGAGGTCAAGTTGAGCCCAGAGGGGCAGAAAGTTGATCATTGTGCACGCCATGG 296
Query 297 AGAGAAACTTCTACTCTTCTGTCAGGAGGACGGGAAGGTCATTTGCTGGCTTTGTGAGCGGTCTCAGGAGCACC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGAAACTTCTACTCTTCTGTCAGGAGGACGGGAAGGTCATTTGCTGGCTTTGTGAGCGGTCTCAGGAGCACC 370
Query 371 GTGGTCACCACACGTTCCTCACAGAGGAGGTTGCCCGGGAGTACCAAGTGAAGCTCCAGGCAGCTCTGGAGATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GTGGTCACCACACGTTCCTCACAGAGGAGGTTGCCCGGGAGTACCAAGTGAAGCTCCAGGCAGCTCTGGAGATG 444
Query 445 CTGAGGCAGAAGCAGCAGGAAGCTGAAGAGTTGGAAGCTGACATCAGAGAAGAGAAAGCTTCCTGGAAGACTCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGAGGCAGAAGCAGCAGGAAGCTGAAGAGTTAGAAGCTGACATCAGAGAAGAGAAAGCTTCCTGGAAGACTCA 518
Query 519 AATACAGTATGACAAAACCAACGTCTTGGCAGATTTTGAGCAACTGAGAGACATCCTGGACTGGGAGGAGAGCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATACAGTATGACAAAACCAACGTCTTGGCAGATTTTGAGCAACTGAGAGACATCCTGGACTGGGAGGAGAGCA 592
Query 593 ATGAGCTGCAAAACCTGGAGAAGGAGGAGGAAGACATTCTGAAAAGCCTTACGAACTCTGAAACTGAGATGGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGAGCTGCAAAACCTGGAGAAGGAGGAGGAAGACATTCTGAAAAGCCTTACGAACTCTGAAACTGAGATGGTG 666
Query 667 CAGCAGACCCAGTCCCTGAGAGAGCTCATCTCAGATCTGGAGCATCGGCTGCAGGGGTCAGTGATGGAGCTGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGCAGACCCAGTCCCTGAGAGAGCTCATCTCAGATCTGGAGCATCGGCTGCAGGGGTCAGTGATGGAGCTGCT 740
Query 741 TCAGGGTGTGGATGGCGTCATAAAAAGGACGGAGAACGTGACCTTGAAGAAGCCAGAAACTTTTCCAAAAAATC 814
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCAGGGTGTGGATGGCGTCATAAAA------------------------------------------------- 765
Query 815 AAAGGAGAGTGTTTCGAGCTCCTGATCTGAAAGGAATGCTAGAAGTGTTTAGAGAGCTGACAGATGTCCGACGC 888
||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 ----------------------------------------------------AGAGCTGACAGATGTCCGACGC 787
Query 889 TACTGGGG-TAAGGAGAAGTCACATTATCATAAGCCACCCTGCGGCTTATCATTATTATTATCTTTATCTTTTA 961
|||||||| | |||| |||
Sbjct 788 TACTGGGGCT--GGAG------------------------TGC------------------------------- 804
Query 962 GAATTTTATGTTCTCTATTAGGCTCA-TG----------TTTTAAGATTTATG--ATTCTCCTTCC-AAGACAC 1021
|||...|.|.|||| ||.||| || .|.|.|||||.|.| ||||||||.|| .||.|.|
Sbjct 805 -AATGGCACGATCTC-----GGTTCACTGCAACCTCCACCTCTCAGATTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTC 872
Query 1022 ACA--TAAC-----TTAC-----CCCTCCTTA---------------------------- 1041
.|| ||.| |||| |||.|| |
Sbjct 873 CCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACC--ACCACCCCTGGCTAAATTTGTATTTTCAG 930