Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09280
- Subject:
- NM_001320318.1
- Aligned Length:
- 2301
- Identities:
- 1923
- Gaps:
- 378
Alignment
Query 1 ATGAGCCACGCAGTAACTATCGAGGAGCCCCAGGCCCAGCAGCAGGTGTCTCAAACTCGGTACCGGGAGAGGTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCGGGCTGGGAGCCACATCTCCTCCAATCGAGCGTATGATTTTCTGTACGATCCATTGTTTATTGTGTCAAGTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAAAGACCATACACAGGCAAATATCCAAGCTACCCTGATTCGCAGCAGACTGAGAAAAGTTCCCAGGTTTAGA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ACCATGTTCAGTAACCTGATCCATTATCCAAGATATTCTCTATATTGGAGCAAGTCAGATCCTGTCCCACCATT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TATCAGTCGGGAATGGAAGGGACATAAGGAGAAACACAGAGAAGCCCTCCGGCAGCTCACCACAACTGACGCTT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTTTTCAGATGCCTAAAGAAGTTTATGAAGATCCTGAAGTTACTGGAAAGAATCGCTATAAATACTTTGAAAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------ATGCCTAAAGAAGTTTATGAAGATCCTGAAGTTACTGGAAAGAATCGCTATAAATACTTTGAAAGG 66
Query 445 CCTTTTCTCCCATTTTTTCAGCAGATGCCATTCAATGTTGTTTATGCCGTATCCAAGGCAGAACCATACACTTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 CCTTTTCTCCCATTTTTTCAGCAGATGCCATTCAATGTTGTTTATGCCGTATCCAAGGCAGAACCATACACTTT 140
Query 519 TCCTCCTACTTCTACTAAGCACCTATCCATCCCTTCAAAGTCTACTGTGGGCACTCAGACTGATTATCGGGATG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 141 TCCTCCTACTTCTACTAAGCACCTATCCATCCCTTCAAAGTCTACTGTGGGCACTCAGACTGATTATCGGGATG 214
Query 593 CTGACGTTCAAACAGATCCATACTCTCCAGAATATGTAGTATGTCAGGACTCAATCCCTGAGCTCTTGACCCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 215 CTGACGTTCAAACAGATCCATACTCTCCAGAATATGTAGTATGTCAGGACTCAATCCCTGAGCTCTTGACCCTG 288
Query 667 GCTACGCTTACTTGGGGTCGGGGTCTCCCAGCAGGACAAGCTGAGGTGGAGATGATAGAAAGAGCCCGCGAGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 GCTACGCTTACTTGGGGTCGGGGTCTCCCAGCAGGACAAGCTGAGGTGGAGATGATAGAAAGAGCCCGCGAGAA 362
Query 741 GCGTGCTTGGGAAGCCTCTCTCCCCGCTCTGAGTGACACCTCCCAGTTTGAGAAGAGGAGGAAAATGATGAATG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 GCGTGCTTGGGAAGCCTCTCTCCCCGCTCTGAGTGACACCTCCCAGTTTGAGAAGAGGAGGAAAATGATGAATG 436
Query 815 AAATGGAGAGGAAGGAGTGGGCCTTCAGAGAGCAGGAGATTGAAAAACTGCAGGAGATTCGCCTGGAAGTTCTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 AAATGGAGAGGAAGGAGTGGGCCTTCAGAGAGCAGGAGATTGAAAAACTGCAGGAGATTCGCCTGGAAGTTCTA 510
Query 889 AAAGAGCTGTTGAGGAAGCGTGAAGAGAATCAGAATGAAGTGAATATGAAGCACTTGAATGCCCGGTGGTCTAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 AAAGAGCTGTTGAGGAAGCGTGAAGAGAATCAGAATGAAGTGAATATGAAGCACTTGAATGCCCGGTGGTCTAA 584
Query 963 ACTGCAGGAGGGAAAAGAGGCAAAAATGGCAAAAATTCAGCGCACGCATGTATCAACAATCAGAAAACTTGTAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 ACTGCAGGAGGGAAAAGAGGCAAAAATGGCAAAAATTCAGCGCACGCATGTATCAACAATCAGAAAACTTGTAG 658
Query 1037 GAAAGAGAAAGAATATAGAAGGGAAGTTGGAGAGAAGAAATATCATCAAGGATTATTCTGATTATGCATCACAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 GAAAGAGAAAGAATATAGAAGGGAAGTTGGAGAGAAGAAATATCATCAAGGATTATTCTGATTATGCATCACAG 732
Query 1111 GTCTATGGACCTCTGTCTCGTCTTGGGTGTTTCCCAGACAACAACTCAGAGGACTTTGTAGTAAAAAACTACTA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 GTCTATGGACCTCTGTCTCGTCTTGGGTGTTTCCCAGACAACAACTCAGAGGACTTTGTAGTAAAAAACTACTA 806
Query 1185 TCTCAACACCTATGAAGGATTAGTGGAACTTGAGTCATGTCTCCCAGATTTTGTGACACAACCCCAAATCAGAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 TCTCAACACCTATGAAGGATTAGTGGAACTTGAGTCATGTCTCCCAGATTTTGTGACACAACCCCAAATCAGAG 880
Query 1259 CTCCAAAACCTAAAGTCATTACCACCAAAGCTGGTTTTCTGAAGAGGGCAGCAAGGTTGGACTATGAGTTGGCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 CTCCAAAACCTAAAGTCATTACCACCAAAGCTGGTTTTCTGAAGAGGGCAGCAAGGTTGGACTATGAGTTGGCA 954
Query 1333 GAGGTTCATAAGGCACTGTTGGATAAGAAGAATAAAGTTCTTGAAGTAAAGAAACCCCCTCGCTTCCTTCAAAG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 GAGGTTCATAAGGCACTGTTGGATAAGAAGAATAAAGTTCTTGAAGTAAAGAAACCCCCTCGCTTCCTTCAAAG 1028
Query 1407 AAACCCAATACCTCAACCTCGGCTTCCAACTCCAACCTTGGAAATGACGTCCAATGAAGAAGAAGAAATGGAAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 AAACCCAATACCTCAACCTCGGCTTCCAACTCCAACCTTGGAAATGACGTCCAATGAAGAAGAAGAAATGGAAA 1102
Query 1481 TGGCTGTGATCTACCTTCAAAAGTTACTCCGGGGCAGAGTCGTTCAGAACATGATGTTTGAAGGGAAAGAAAAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 TGGCTGTGATCTACCTTCAAAAGTTACTCCGGGGCAGAGTCGTTCAGAACATGATGTTTGAAGGGAAAGAAAAG 1176
Query 1555 CGACTGGAGTTGATCCAGGAGTTGCGCACCTGCCACGCACTACAAGAAGATGAAAAGCTGGTGAAAAAAGCCGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 CGACTGGAGTTGATCCAGGAGTTGCGCACCTGCCACGCACTACAAGAAGATGAAAAGCTGGTGAAAAAAGCCGA 1250
Query 1629 GAAGCAAGTGACCCTGGCCTTACAGCGGCAGAGGAACTTGCATGAGCACAAGGTGTCACTGGTTGAAAACCATT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 GAAGCAAGTGACCCTGGCCTTACAGCGGCAGAGGAACTTGCATGAGCACAAGGTGTCACTGGTTGAAAACCATT 1324
Query 1703 TGGCCGGACTGGAAGGAAGGGCACTAGCAGACATGTTTGACTTCCTGTCCAAAGAGCTGGTGAGACTGCAGGAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 TGGCCGGACTGGAAGGAAGGGCACTAGCAGACATGTTTGACTTCCTGTCCAAAGAGCTGGTGAGACTGCAGGAG 1398
Query 1777 GAGAGGAGGATCCATGCCTTTGTCATGCTGGCTGAGCGCCAGCGGCGGGTACGAGAGGCTGAAGAGAGTGGTCG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 GAGAGGAGGATCCATGCCTTTGTCATGCTGGCTGAGCGCCAGCGGCGGGTACGAGAGGCTGAAGAGAGTGGTCG 1472
Query 1851 GCGCCAGGTGGAAAAACAGCGCCTGCGGGAGGAGGACGAGATATTTAAGGAGGTGGTTAAAGTTCACCATAGTA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 GCGCCAGGTGGAAAAACAGCGCCTGCGGGAGGAGGACGAGATATTTAAGGAGGTGGTTAAAGTTCACCATAGTA 1546
Query 1925 CTATAAGCTCCTACCTAGAAGACATAATACTGAATACCGAAGCGAATACTGCAGAAGAACAAGCCAGGGCAGAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 CTATAAGCTCCTACCTAGAAGACATAATACTGAATACCGAAGCGAATACTGCAGAAGAACAAGCCAGGGCAGAA 1620
Query 1999 ATAGAGAAGATGGCTGAGAAAATCAATGACATTGCTTATGAAATGGAAAGCCGCCGAACCTATCTTCAGTCAGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 ATAGAGAAGATGGCTGAGAAAATCAATGACATTGCTTATGAAATGGAAAGCCGCCGAACCTATCTTCAGTCAGA 1694
Query 2073 GGAGATTGTTGCTGAGTTGGTTTATAGTTTTCTGATCCCAGAGGTGCAAAAATACTTTGTCAAAGAAAAAGTGA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695 GGAGATTGTTGCTGAGTTGGTTTATAGTTTTCTGATCCCAGAGGTGCAAAAATACTTTGTCAAAGAAAAAGTGA 1768
Query 2147 GGAACGCACAGCGGAAACATATTCTTGCAGCCCATCAGATCATCCACAGTTACACGGAAAGCATGGTTCAAAAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769 GGAACGCACAGCGGAAACATATTCTTGCAGCCCATCAGATCATCCACAGTTACACGGAAAGCATGGTTCAAAAG 1842
Query 2221 AAATTAACTGAGGGAGAGCAAGATGAGGCCTCAAATGCTGCCATGTTACTTGAGAAAGAAACTCAAAATGAGAA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 AAATTAACTGAGGGAGAGCAAGATGAGGCCTCAAATGCTGCCATGTTACTTGAGAAAGAAACTCAAAATGAGAA 1916
Query 2295 CAACAGC 2301
|||||||
Sbjct 1917 CAACAGC 1923