Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09280
• Subject: XM_011513277.1
• Aligned Length: 2301
• Identities: 1922
• Gaps: 378

Alignment

Query    1  ATGAGCCACGCAGTAACTATCGAGGAGCCCCAGGCCCAGCAGCAGGTGTCTCAAACTCGGTACCGGGAGAGGTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCGGGCTGGGAGCCACATCTCCTCCAATCGAGCGTATGATTTTCTGTACGATCCATTGTTTATTGTGTCAAGTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGAAAGACCATACACAGGCAAATATCCAAGCTACCCTGATTCGCAGCAGACTGAGAAAAGTTCCCAGGTTTAGA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ACCATGTTCAGTAACCTGATCCATTATCCAAGATATTCTCTATATTGGAGCAAGTCAGATCCTGTCCCACCATT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TATCAGTCGGGAATGGAAGGGACATAAGGAGAAACACAGAGAAGCCCTCCGGCAGCTCACCACAACTGACGCTT  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTTTTCAGATGCCTAAAGAAGTTTATGAAGATCCTGAAGTTACTGGAAAGAATCGCTATAAATACTTTGAAAGG  444
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------ATGCCTAAAGAAGTTTATGAAGATCCTGAAGTTACTGGAAAGAATCGCTATAAATACTTTGAAAGG  66

Query  445  CCTTTTCTCCCATTTTTTCAGCAGATGCCATTCAATGTTGTTTATGCCGTATCCAAGGCAGAACCATACACTTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  CCTTTTCTCCCATTTTTTCAGCAGATGCCATTCAATGTTGTTTATGCCGTATCCAAGGCAGAACCATACACTTT  140

Query  519  TCCTCCTACTTCTACTAAGCACCTATCCATCCCTTCAAAGTCTACTGTGGGCACTCAGACTGATTATCGGGATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  TCCTCCTACTTCTACTAAGCACCTATCCATCCCTTCAAAGTCTACTGTGGGCACTCAGACTGATTATCGGGATG  214

Query  593  CTGACGTTCAAACAGATCCATACTCTCCAGAATATGTAGTATGTCAGGACTCAATCCCTGAGCTCTTGACCCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  CTGACGTTCAAACAGATCCATACTCTGCAGAATATGTAGTATGTCAGGACTCAATCCCTGAGCTCTTGACCCTG  288

Query  667  GCTACGCTTACTTGGGGTCGGGGTCTCCCAGCAGGACAAGCTGAGGTGGAGATGATAGAAAGAGCCCGCGAGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  GCTACGCTTACTTGGGGTCGGGGTCTCCCAGCAGGACAAGCTGAGGTGGAGATGATAGAAAGAGCCCGCGAGAA  362

Query  741  GCGTGCTTGGGAAGCCTCTCTCCCCGCTCTGAGTGACACCTCCCAGTTTGAGAAGAGGAGGAAAATGATGAATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  GCGTGCTTGGGAAGCCTCTCTCCCCGCTCTGAGTGACACCTCCCAGTTTGAGAAGAGGAGGAAAATGATGAATG  436

Query  815  AAATGGAGAGGAAGGAGTGGGCCTTCAGAGAGCAGGAGATTGAAAAACTGCAGGAGATTCGCCTGGAAGTTCTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  AAATGGAGAGGAAGGAGTGGGCCTTCAGAGAGCAGGAGATTGAAAAACTGCAGGAGATTCGCCTGGAAGTTCTA  510

Query  889  AAAGAGCTGTTGAGGAAGCGTGAAGAGAATCAGAATGAAGTGAATATGAAGCACTTGAATGCCCGGTGGTCTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  AAAGAGCTGTTGAGGAAGCGTGAAGAGAATCAGAATGAAGTGAATATGAAGCACTTGAATGCCCGGTGGTCTAA  584

Query  963  ACTGCAGGAGGGAAAAGAGGCAAAAATGGCAAAAATTCAGCGCACGCATGTATCAACAATCAGAAAACTTGTAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  ACTGCAGGAGGGAAAAGAGGCAAAAATGGCAAAAATTCAGCGCACGCATGTATCAACAATCAGAAAACTTGTAG  658

Query 1037  GAAAGAGAAAGAATATAGAAGGGAAGTTGGAGAGAAGAAATATCATCAAGGATTATTCTGATTATGCATCACAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  GAAAGAGAAAGAATATAGAAGGGAAGTTGGAGAGAAGAAATATCATCAAGGATTATTCTGATTATGCATCACAG  732

Query 1111  GTCTATGGACCTCTGTCTCGTCTTGGGTGTTTCCCAGACAACAACTCAGAGGACTTTGTAGTAAAAAACTACTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  GTCTATGGACCTCTGTCTCGTCTTGGGTGTTTCCCAGACAACAACTCAGAGGACTTTGTAGTAAAAAACTACTA  806

Query 1185  TCTCAACACCTATGAAGGATTAGTGGAACTTGAGTCATGTCTCCCAGATTTTGTGACACAACCCCAAATCAGAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  TCTCAACACCTATGAAGGATTAGTGGAACTTGAGTCATGTCTCCCAGATTTTGTGACACAACCCCAAATCAGAG  880

Query 1259  CTCCAAAACCTAAAGTCATTACCACCAAAGCTGGTTTTCTGAAGAGGGCAGCAAGGTTGGACTATGAGTTGGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  CTCCAAAACCTAAAGTCATTACCACCAAAGCTGGTTTTCTGAAGAGGGCAGCAAGGTTGGACTATGAGTTGGCA  954

Query 1333  GAGGTTCATAAGGCACTGTTGGATAAGAAGAATAAAGTTCTTGAAGTAAAGAAACCCCCTCGCTTCCTTCAAAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  GAGGTTCATAAGGCACTGTTGGATAAGAAGAATAAAGTTCTTGAAGTAAAGAAACCCCCTCGCTTCCTTCAAAG  1028

Query 1407  AAACCCAATACCTCAACCTCGGCTTCCAACTCCAACCTTGGAAATGACGTCCAATGAAGAAGAAGAAATGGAAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  AAACCCAATACCTCAACCTCGGCTTCCAACTCCAACCTTGGAAATGACGTCCAATGAAGAAGAAGAAATGGAAA  1102

Query 1481  TGGCTGTGATCTACCTTCAAAAGTTACTCCGGGGCAGAGTCGTTCAGAACATGATGTTTGAAGGGAAAGAAAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103  TGGCTGTGATCTACCTTCAAAAGTTACTCCGGGGCAGAGTCGTTCAGAACATGATGTTTGAAGGGAAAGAAAAG  1176

Query 1555  CGACTGGAGTTGATCCAGGAGTTGCGCACCTGCCACGCACTACAAGAAGATGAAAAGCTGGTGAAAAAAGCCGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177  CGACTGGAGTTGATCCAGGAGTTGCGCACCTGCCACGCACTACAAGAAGATGAAAAGCTGGTGAAAAAAGCCGA  1250

Query 1629  GAAGCAAGTGACCCTGGCCTTACAGCGGCAGAGGAACTTGCATGAGCACAAGGTGTCACTGGTTGAAAACCATT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251  GAAGCAAGTGACCCTGGCCTTACAGCGGCAGAGGAACTTGCATGAGCACAAGGTGTCACTGGTTGAAAACCATT  1324

Query 1703  TGGCCGGACTGGAAGGAAGGGCACTAGCAGACATGTTTGACTTCCTGTCCAAAGAGCTGGTGAGACTGCAGGAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325  TGGCCGGACTGGAAGGAAGGGCACTAGCAGACATGTTTGACTTCCTGTCCAAAGAGCTGGTGAGACTGCAGGAG  1398

Query 1777  GAGAGGAGGATCCATGCCTTTGTCATGCTGGCTGAGCGCCAGCGGCGGGTACGAGAGGCTGAAGAGAGTGGTCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399  GAGAGGAGGATCCATGCCTTTGTCATGCTGGCTGAGCGCCAGCGGCGGGTACGAGAGGCTGAAGAGAGTGGTCG  1472

Query 1851  GCGCCAGGTGGAAAAACAGCGCCTGCGGGAGGAGGACGAGATATTTAAGGAGGTGGTTAAAGTTCACCATAGTA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473  GCGCCAGGTGGAAAAACAGCGCCTGCGGGAGGAGGACGAGATATTTAAGGAGGTGGTTAAAGTTCACCATAGTA  1546

Query 1925  CTATAAGCTCCTACCTAGAAGACATAATACTGAATACCGAAGCGAATACTGCAGAAGAACAAGCCAGGGCAGAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547  CTATAAGCTCCTACCTAGAAGACATAATACTGAATACCGAAGCGAATACTGCAGAAGAACAAGCCAGGGCAGAA  1620

Query 1999  ATAGAGAAGATGGCTGAGAAAATCAATGACATTGCTTATGAAATGGAAAGCCGCCGAACCTATCTTCAGTCAGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621  ATAGAGAAGATGGCTGAGAAAATCAATGACATTGCTTATGAAATGGAAAGCCGCCGAACCTATCTTCAGTCAGA  1694

Query 2073  GGAGATTGTTGCTGAGTTGGTTTATAGTTTTCTGATCCCAGAGGTGCAAAAATACTTTGTCAAAGAAAAAGTGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695  GGAGATTGTTGCTGAGTTGGTTTATAGTTTTCTGATCCCAGAGGTGCAAAAATACTTTGTCAAAGAAAAAGTGA  1768

Query 2147  GGAACGCACAGCGGAAACATATTCTTGCAGCCCATCAGATCATCCACAGTTACACGGAAAGCATGGTTCAAAAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769  GGAACGCACAGCGGAAACATATTCTTGCAGCCCATCAGATCATCCACAGTTACACGGAAAGCATGGTTCAAAAG  1842

Query 2221  AAATTAACTGAGGGAGAGCAAGATGAGGCCTCAAATGCTGCCATGTTACTTGAGAAAGAAACTCAAAATGAGAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843  AAATTAACTGAGGGAGAGCAAGATGAGGCCTCAAATGCTGCCATGTTACTTGAGAAAGAAACTCAAAATGAGAA  1916

Query 2295  CAACAGC  2301
            |||||||
Sbjct 1917  CAACAGC  1923