Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09284
- Subject:
- NM_001331219.1
- Aligned Length:
- 1070
- Identities:
- 793
- Gaps:
- 229
Alignment
Query 1 MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFLCRSRLQRDIRREIDDFFKADDPESTKRSAL 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCRSILSSMDAENEPKVWYVSLACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQL 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 KPEILQDSRLITLYLTMLVTFTDTSTWKILRGKGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLTRGLARPRP 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CLSKGTLTAAFSLALRPVIAAQFSDNLIRPFLIHIMSVPALVTHLSTVTPERLTVLESHDMLRKFIIFLRDQDR 296
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Sbjct 1 -----MLTAAFSLALRPVVAAQFSDNLMRPFIIHVMSVPALVAHLSTVAPERLGVLESHDMLRKFIVFLRDRDR 69
Query 297 CRDVCESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPRVLEEETDGFVSLLTQTLCYCQKYVSQKKSNLTHWHPVLGWFSQSV 370
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Sbjct 70 CRDACESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSLRLLEEEMDGFVSALTQMLCYCQKYVAQKKSNLTHWHPVLGWFSQPV 143
Query 371 DYGLNESMHLITKQLQFLWGVPLIRIFFCDILSKKLLESQEPA--HAQPASPQNVLPVKSLLKRAFQKSASVRN 442
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Sbjct 144 DYGLNDSMYLITKQLQFLWAVPLIRILFSDILSRKLLEHAEPAPVQPQPSSPQTVLPVKSLLKRAFQKSASVRN 217
Query 443 ILRPVGGKRVDSAEVQKVCNICVLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPHGGLKLFLECLN 516
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Sbjct 218 ILRPVGGRRVDSAEVRKVCNICVLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPHGGLKLFLECLN 291
Query 517 NDTEESKQLLAMLMLFCDCSRHLITILDDIEVYEEQISFKLEELVTISSFLNSFVFKMIWDGIVENAKGETLEL 590
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Sbjct 292 NDTGESKQLLAMLMLFCDCSRHLITILDDIEVYEEQISFKLEELVTISSFLNSFVFKMIWDGIVENAKGETLEL 365
Query 591 FQSVHGWLMVLYERDCRRRFTPEDHWLRKDLKPSVLFQELDRDRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFRTMVTKE 664
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Sbjct 366 FQSVHGWLMVLYERDCRRRFAPEDHWLRRDLKPGVLFQELDKDRRRAQLVLQHIPHVVPHKNRVLLFRNMVIKE 439
Query 665 KEKLGLVETSSASPHVTHITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDEAGIDQDGVFKEFLEEI 738
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Sbjct 440 KEKLGLVETSSASPHVTHITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDEAGIDQDGVFKEFLEEI 513
Query 739 IKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSYIHENYLQLFEFVGKMLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVF 812
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Sbjct 514 IKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSYIHENYLQLFEFVGKMLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQMLGHHHSVF 587
Query 813 YSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDITDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHF 886
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Sbjct 588 YSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDIADLGLTLSYDEDVMGQLVCHELVPGGKTIPVTDENKISYIHLMAHF 661
Query 887 RMHTQIKNQTAALISGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL 960
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Sbjct 662 RMHTQIKNQTAALISGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL 735
Query 961 ASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFTIRKREPGGRLPTSS 1034
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Sbjct 736 ASDFTPEERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFTIRKREPGGRLPTSS 809
Query 1035 TCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMNTGFELS 1068
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Sbjct 810 TCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMNTGFELS 843