Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09288
• Subject: NM_001077188.2
• Aligned Length: 1935
• Identities: 1814
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGGCACTTCCTGCGTGTGCAGTCCGGGAGTTCGAGCCGCCGCGGCAACCGGAGCGAGGAGCGCCCGTCCGCAC  74
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCACTGCCTGCGTGTGCAGTCCGGGAGTTCGAGCCGCCGCGGCAACCGGAGCGAGGAGCGCCCGTCCGCAC  74

Query   75  CACCTGTCCCCGCCGGCATTCCAGAGTAGAGGCCGAATTGGCAGCGAGCCGGCCCGGGTCGGTCGCCGCCTCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACCTGTCCCCGCCGGCATTCCAGAGTAGAGGCCGAATTGGCAGCGAGCCGGCCCGGGTCGGTCGCCGCCTCAG  148

Query  149  TTCGCGCGGGCCCTCCTAGGGGTGTGTCTCACGGATTCCACACCCGGCCGCTCCTGGACAAGCCCCGAAAGGCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCGCGCGGGCCCTCCTAGGGGTGTGTCTCACGGATTCCACACCCGGCCGCTCCTGGACAAGCCCCGAAAGGCG  222

Query  223  TCTTCTTCCCTGGCGGGAGCCGCGTGCGCCCCGCTTTTCGCGCTGCTGTCCCGGGGCCGCCGCAGGCGGATGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTTCTTCCCTGGCGGGAGCCGCGTGCGCCCCGCTTTTCGCGCTGCTGTCCCGGGGCCGCCGCAGGCGGATGCA  296

Query  297  CGTCCTCAGGCGACGCTGGGACCTGGGCTCCCTCTGCCGGGCCCTGCTCACTCGGGGCCTGGCCGCCCTGGGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGTCCTCAGGCGACGCTGGGACCTGGGCTCCCTCTGCCGGGCCCTGCTCACTCGGGGCCTGGCCGCCCTGGGCC  370

Query  371  ACTCGCTGAAGCACGTGCTCGGTGCGATCTTCTCCAAGATTTTCGGCCCCATGGCCAGCGTCGGGAACATGGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTCGCTGAAGCACGTGCTCGGTGCGATCTTCTCCAAGATTTTCGGCCCCATGGCCAGCGTCGGGAACATGGAT  444

Query  445  GAGAAATCCAACAAGCTGCTGCTAGCTTTGGTGATGCTCTTCCTATTTGCCGTGATCGTCCTCCAATACGTGTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGAAATCCAACAAGCTGCTGCTAGCTTTGGTGATGCTCTTCCTATTTGCCGTGATCGTCCTCCAATACGTGTG  518

Query  519  CCCCGGCACAGAATGCCAGCTCCTCCGCCTGCAGGCGTTCAGCTCCCCGGTGCCGGACCCGTACCGCTCGGAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCCGGCACAGAATGCCAGCTCCTCCGCCTGCAGGCGTTCAGCTCCCCGGTGCCGGACCCGTACCGCTCGGAGG  592

Query  593  ATGAGAGCTCCGCCAGGTTCGTGCCCCGCTACAATTTCACCCGCGGCGACCTCCTGCGCAAGGTAGACTTCGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGAGAGCTCCGCCAGGTTCGTGCCCCGCTACAATTTCACCCGCGGCGACCTCCTGCGCAAGGTAGACTTCGAC  666

Query  667  ATCAAGGGCGATGACCTGATCGTGTTCCTGCACATCCAGAAGACCGGGGGCACCACTTTCGGCCGCCACTTGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCAAGGGCGATGACCTGATCGTGTTCCTGCACATCCAGAAGACCGGGGGCACCACTTTCGGCCGCCACTTGGT  740

Query  741  GCGTAACATCCAGCTGGAGCAGCCGTGCGAGTGCCGCGTGGGTCAGAAGAAATGCACTTGCCACCGGCCGGGTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCGTAACATCCAGCTGGAGCAGCCGTGCGAGTGCCGCGTGGGTCAGAAGAAATGCACTTGCCACCGGCCGGGTA  814

Query  815  AGCGGGAAACCTGGCTCTTCTCCAGGTTCTCCACGGGCTGGAGCTGCGGGTTGCACGCCGACTGGACCGAGCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCGGGAAACCTGGCTCTTCTCCAGGTTCTCCACGGGCTGGAGCTGCGGGTTGCACGCCGACTGGACCGAGCTC  888

Query  889  ACCAGCTGTGTGCCCTCCGTGGTGGACGGCAAGCGCGACGCCAGGCTGAGACCGTCCAG---------------  947
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct  889  ACCAGCTGTGTGCCCTCCGTGGTGGACGGCAAGCGCGACGCCAGGCTGAGACCGTCCAGGTGGAGGATTTTTCA  962

Query  948  --------------------------------------------------------------------------  947
                                                                                      
Sbjct  963  GATTCTAGATGCAGCAAGTAAGGATAAACGGGGTTCTCCAAACACTAACGCAGGCGCCAACTCTCCGTCATCCA  1036

Query  948  -------------------------------GAACTTCCACTACATCACCATCCTCCGAGACCCAGTGTCCCGG  990
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAAGACCCGGAACACATCTAAGAGTGGGAAGAACTTCCACTACATCACCATCCTCCGAGACCCAGTGTCCCGG  1110

Query  991  TACTTGAGTGAGTGGAGGCATGTCCAGAGAGGGGCAACATGGAAAGCATCCCTGCATGTCTGCGATGGAAGGCC  1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACTTGAGTGAGTGGAGGCATGTCCAGAGAGGGGCAACATGGAAAGCATCCCTGCATGTCTGCGATGGAAGGCC  1184

Query 1065  TCCAACCTCCGAAGAGCTGCCCAGCTGCTACACTGGCGATGACTGGTCTGGCTGCCCCCTCAAAGAGTTTATGG  1138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCCAACCTCCGAAGAGCTGCCCAGCTGCTACACTGGCGATGACTGGTCTGGCTGCCCCCTCAAAGAGTTTATGG  1258

Query 1139  ACTGTCCCTACAATCTAGCCAACAACCGCCAGGTGCGCATGCTCTCCGACCTGACCCTGGTAGGCTGCTACAAC  1212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTGTCCCTACAATCTAGCCAACAACCGCCAGGTGCGCATGCTCTCCGACCTGACCCTGGTAGGCTGCTACAAC  1332

Query 1213  CTCTCTGTCATGCCTGAAAAGCAAAGAAACAAGGTCCTTCTGGAAAGTGCCAAGTCAAATCTGAAGCACATGGC  1286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCTCTGTCATGCCTGAAAAGCAAAGAAACAAGGTCCTTCTGGAAAGTGCCAAGTCAAATCTGAAGCACATGGC  1406

Query 1287  GTTCTTCGGCCTCACTGAGTTTCAGCGGAAGACCCAATATCTGTTTGAGAAAACCTTCAACATGAACTTTATTT  1360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTCTTCGGCCTCACTGAGTTTCAGCGGAAGACCCAATATCTGTTTGAGAAAACCTTCAACATGAACTTTATTT  1480

Query 1361  CGCCATTTACCCAGTATAATACCACTAGGGCCTCTAGTGTAGAGATCAATGAGGAAATTCAAAAGCGTATTGAG  1434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CGCCATTTACCCAGTATAATACCACTAGGGCCTCTAGTGTAGAGATCAATGAGGAAATTCAAAAGCGTATTGAG  1554

Query 1435  GGACTGAATTTTCTGGATATGGAGTTGTACAGCTATGCCAAAGACCTTTTTTTGCAGAGGTATCAGTTTATGAG  1508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGACTGAATTTTCTGGATATGGAGTTGTACAGCTATGCCAAAGACCTTTTTTTGCAGAGGTATCAGTTTATGAG  1628

Query 1509  GCAGAAAGAGCATCAGGAGGCCAGGCGAAAGCGTCAGGAACAACGCAAATTTCTGAAGGGAAGGCTCCTTCAGA  1582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCAGAAAGAGCATCAGGAGGCCAGGCGAAAGCGTCAGGAACAACGCAAATTTCTGAAGGGAAGGCTCCTTCAGA  1702

Query 1583  CCCATTTCCAGAGCCAGGGTCAGGGCCAGAGCCAGAATCCGAATCAGAATCAGAGTCAGAACCCAAATCCGAAT  1656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCCATTTCCAGAGCCAGGGTCAGGGCCAGAGCCAGAATCCGAATCAGAATCAGAGTCAGAACCCAAATCCGAAT  1776

Query 1657  GCCAATCAGAACCTGACTCAGAATCTGATGCAGAATCTGACTCAGAGTTTGAGCCAGAAGGAGAACCGGGAAAG  1730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCAATCAGAACCTGACTCAGAATCTGATGCAGAATCTGACTCAGAGTTTGAGCCAGAAGGAGAACCGGGAAAG  1850

Query 1731  CCCGAAGCAGAACTCAGGCAAGGAGCAGAATGATAACACCAGCAATGGCACCAACGACTACATAGGCAGTGTAG  1804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCCGAAGCAGAACTCAGGCAAGGAGCAGAATGATAACACCAGCAATGGCACCAACGACTACATAGGCAGTGTAG  1924

Query 1805  AGAAATGGCGT  1815
            |||||||||||
Sbjct 1925  AGAAATGGCGT  1935