Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09312
• Subject: XM_006538187.2
• Aligned Length: 825
• Identities: 714
• Gaps: 0

Alignment

Query   1  ATGCAAAACAACGAAATTATAAAGCCTGCCAAATACTTCTCAGAATTGGAAAAGAGCATCCTGCTGGCTTTAGT  74
           |||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||..||||.|||||||||.||||.||.||.||
Sbjct   1  ATGCAAAACAACGAAATCATTAAACCTGCCAAGTACTTCTCGGAGCTGGAGAAGAGCATCTTGCTTGCCTTGGT  74

Query  75  AGAAAAGTATAAATATGTGCTGGAATGTAAGAAAAGTGATGCGCGAACTATTGCCCTTAAGCAGCGTACCTGGC  148
           |||.|||||.||.||||||.|||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  75  AGAGAAGTACAAGTATGTGTTGGAATGCAAGAAGAGCGACGCGCGGACTATTGCTCTCAAGCAGCGGACCTGGC  148

Query 149  AGGCGCTGGCCCACGAATACAACTCTCAGCCCAGCGTGTCCCTGCGGGATTTCAAACAGCTGAAGAAGTGCTGG  222
           ||||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149  AGGCCTTGGCCCACGAGTACAACTCGCAGCCCAGCGTGTCGCTGCGGGACTTCAAACAGCTCAAGAAGTGCTGG  222

Query 223  GAGAACATCAAGGCTCGGACCAAAAAAATTATGGCCCATGAAAGGAGAGAGAAAGTGAAACGGAGCGTCAGCCC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|.|||||.|||||.||.||||..|||||
Sbjct 223  GAGAACATCAAGGCTCGGACCAAAAAAATTATGGCCCACGAGAGGCGGGAGAAGGTGAAGCGCAGCGGGAGCCC  296

Query 297  TCTCCTGAGTACCCACGTCCTAGGGAAGGAGAAGATCGCCAGCATGCTGCCGGAGCAGCTCTACTTCCTGCAGA  370
           ..|.|||||.|.|||||||||.|..||||||||||||..||||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 297  GTTGCTGAGCAGCCACGTCCTGGACAAGGAGAAGATCAGCAGCATGCTGCCGGAGCAACTGTACTTCCTTCAGA  370

Query 371  GCCCCCCGGAGGAGGAGCCCGAATACCACCCCGACGCCTCAGCCCAAGAATCATTTGCTGTTTCAAATAGAGAA  444
           ||||.|||||||||||||||||||||||||..||.||..|.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 371  GCCCACCGGAGGAGGAGCCCGAATACCACCAGGATGCGGCCGCCCAAGAGTCCTTTGCTGTTTCAAATCGAGAA  444

Query 445  CTGTGCGATGATGAGAAAGAGTTCATACATTTTCCAGTATGTGAGGGGACCTCTCAACCTGAACCCTCGTGTTC  518
           ||||||||.|||||||||||||||...|..|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||
Sbjct 445  CTGTGCGAGGATGAGAAAGAGTTCGGGCCCTTTCCGGTCTGTGAGGGGACCTCACAACCCGAACCTTCATGCTC  518

Query 519  AGCTGTCAGAATAACAGCCAATAAAAACTACAGGAGCAAAACCTCTCAGGAAGGTGCTTTAAAAAAGATGCATG  592
           |||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 519  AGCCGTCAGGATAACCGCCAATAAAAACTACAGGAGCAAAACCCCTCAGGAAGGTGCTTTAAAGAAAATGCACG  592

Query 593  AGGAAGAACACCATCAACAAATGTCCATCTTACAACTGCAACTGATACAAATGAATGAGGTGCATGTGGCCAAA  666
           ||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 593  AGGAGGAGCACCATCAGCAGATGTCCATCTTACAGCTGCAGCTGATCCAAATGAACGAGGTGCACGTGGCCAAA  666

Query 667  ATCCAGCAGATAGAGCGAGAGTGTGAGATGGCAGAGGAGGAACACAGGATAAAAATGGAAGTTCTCAATAAAAA  740
           |||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667  ATCCAGCAGATCGAGCGCGAGTGCGAGATGGCCGAGGAGGAGCACCGGATCAAAATGGAAGTCCTCAATAAAAA  740

Query 741  GAAGATGTATTGGGAAAGAAAACTACAAACTTTTACCAAGGAATGGCCTGTTTCCTCATTTAACCGGCCCTTTC  814
           |||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 741  GAAGATGTACTGGGAGAGGAAACTGCAGACTTTTACCAAGGAGTGGCCCGTCTCCTCGTTTAACCGGCCCTTTC  814

Query 815  CCAANTCGCCC  825
           ||||.||.|||
Sbjct 815  CCAATTCACCC  825