Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09317
- Subject:
- XM_011510415.2
- Aligned Length:
- 1088
- Identities:
- 840
- Gaps:
- 214
Alignment
Query 1 ATGTGGGTGCTTACACCTGCTGCTTTTGCTGGGAAGCTCTTGAGTGTGTTCAGGCAACCTCTGAGCTCTCTGTG 74
|||||.|.| .||.||...|.|| |||.||.|| |||.| ||| ||
Sbjct 1 ATGTGCGCG-ATAAACGGCCGGC----GCTCGGGAG--------------CAGAC---------GCT-----TG 41
Query 75 G---AGGAGCCTGGTCCCGCTGTTCTGCTGGCTGAGGGCAACCTTCTGGCTGCGAGCTACCAAGAGGAGAAAGC 145
| .||.||| ||.|.||..|.||| |.|.|||| |||||.|.|.|| |
Sbjct 42 GCCCCGGGGCC----CCAGGTGCGCGGCT--CCGCGGGC----------CTGCGCGGTCCC------------C 87
Query 146 AGCAGCTGG-TCCTGAGAGGGCCAGATGAGACCAAAGAGGAGGAA-GAGGACCCTCCTCTGCCCACCACCCCAA 217
||..||.|| |||.| |||| |||.||| ||| ||||.|||.| |||..|..||||||
Sbjct 88 AGGCGCCGGCTCCCG---GGGC----TGACACC---------GAATGAGGCCCCGC----GCCGTCGGCCCCAA 141
Query 218 CCAGCGTCAACTATCACTTCACTCGCCAGTGCAACTACAAATGCGGCTTCTGTTTCCACACAGCCAAAACATCC 291
Sbjct 142 -------------------------------------------------------------------------- 141
Query 292 TTTGTGCTGCCCCTTGAGGAAGCAAAGAGAGGATTGCTTTTGCTTAAGGAAGCTGGTATGGAGAAGATCAACTT 365
||||||||||||||||||||
Sbjct 142 ------------------------------------------------------GGTATGGAGAAGATCAACTT 161
Query 366 TTCAGGTGGAGAGCCATTTCTTCAAGACCGGGGAGAATACCTGGGCAAGTTGGTGAGGTTCTGCAAAGTAGAGT 439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 TTCAGGTGGAGAGCCATTTCTTCAAGACCGGGGAGAATACCTGGGCAAGTTGGTGAGGTTCTGCAAAGTAGAGT 235
Query 440 TGCGGCTGCCCAGCGTGAGCATCGTGAGCAATGGAAGCCTGATCCGGGAGAGGTGGTTCCAGAATTATGGTGAG 513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 TGCGGCTGCCCAGCGTGAGCATCGTGAGCAATGGAAGCCTGATCCGGGAGAGGTGGTTCCAGAATTATGGTGAG 309
Query 514 TATTTGGACATTCTCGCTATCTCCTGTGACAGCTTTGACGAGGAAGTCAATGTCCTTATTGGCCGTGGCCAAGG 587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 TATTTGGACATTCTCGCTATCTCCTGTGACAGCTTTGACGAGGAAGTCAATGTCCTTATTGGCCGTGGCCAAGG 383
Query 588 AAAGAAGAACCATGTGGAAAACCTTCAAAAGCTGAGGAGGTGGTGTAGGGATTATAGAGTCGCTTTCAAGATAA 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 AAAGAAGAACCATGTGGAAAACCTTCAAAAGCTGAGGAGGTGGTGTAGGGATTATAGAGTCGCTTTCAAGATAA 457
Query 662 ATTCTGTCATTAATCGTTTCAACGTGGAAGAGGACATGACGGAACAGATCAAAGCACTAAACCCTGTCCGCTGG 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 458 ATTCTGTCATTAATCGTTTCAACGTGGAAGAGGACATGACGGAACAGATCAAAGCACTAAACCCTGTCCGCTGG 531
Query 736 AAAGTGTTCCAGTGCCTCTTAATTGAGGGTGAGAATTGTGGAGAAGATGCTCTAAGAGAAGCAGAAAGATTTGT 809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 AAAGTGTTCCAGTGCCTCTTAATTGAGGGTGAGAATTGTGGAGAAGATGCTCTAAGAGAAGCAGAAAGATTTGT 605
Query 810 TATTGGTGATGAAGAATTTGAAAGATTCTTGGAGCGCCACAAAGAAGTGTCCTGCTTGGTGCCTGAATCTAACC 883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 TATTGGTGATGAAGAATTTGAAAGATTCTTGGAGCGCCACAAAGAAGTGTCCTGCTTGGTGCCTGAATCTAACC 679
Query 884 AGAAGATGAAAGACTCCTACCTTATTCTGGATGAATATATGCGCTTTCTGAACTGTAGAAAGGGACGGAAGGAC 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 680 AGAAGATGAAAGACTCCTACCTTATTCTGGATGAATATATGCGCTTTCTGAACTGTAGAAAGGGACGGAAGGAC 753
Query 958 CCTTCCAAGTCCATCCTGGATGTTGGTGTAGAAGAAGCTATAAAATTCAGTGGATTTGATGAAAAGATGTTTCT 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 754 CCTTCCAAGTCCATCCTGGATGTTGGTGTAGAAGAAGCTATAAAATTCAGTGGATTTGATGAAAAGATGTTTCT 827
Query 1032 GAAGCGAGGAGGAAAATACATATGGAGTAAGGCTGATCTGAAGCTGGATTGG 1083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 GAAGCGAGGAGGAAAATACATATGGAGTAAGGCTGATCTGAAGCTGGATTGG 879