Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09332
- Subject:
- XM_006520091.4
- Aligned Length:
- 2086
- Identities:
- 1861
- Gaps:
- 5
Alignment
Query 1 ATGAGTGGTGCAGCTTTGGGACTTGAGATTGTTTTTGTCTTTTTTCTGGCATTATTTCTGCTTCATCGATATGG 74
|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 1 ATGAGTGGTGCGGCTTTAGGACTTGAGATTGTTTTTGTCTTTTTTCTGGCATTGTTCCTCCTGCATCGCTATGG 74
Query 75 AGACTTTAAGAAACAGCATAGACTTGTGATTATTGGAACACTGCTTGCTTGGTATCTCTGCTTTCTTATTGTCT 148
||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 AGACTTTAAGAAACAGCACAGACTGGTAATCATCGGCACACTGCTTGCTTGGTATCTCTGCTTTCTCATTGTCT 148
Query 149 TCATACTGCCTCTGGATGTTAGTACGACAATATACAACCGGTGCAAGCATGCTGCTGCAAATTCAAGCCCTCCT 222
||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||.||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 TCATACTGCCGCTGGATGTCAGTACGACAATATATAACCGATGCAGGCATGCTGCTGCAAATTCCAGCCCTCCT 222
Query 223 GAGAATAGCAACATTACAGGATTGTACGCAACTGCTAAC-CCTGTTCCAAGCCAGCATCCTTGTTTCAAGCCAT 295
||.||||.||||.||||.|||.||.|.|||.||| |.|| ||.|.||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 223 GAAAATACCAACGTTACGGGACTGGATGCATCTG-TCACTCCAGCTCCAAGACAGCATCCATGTTTCAAGCCGT 295
Query 296 GGAGTTACATTCCTGATGGAATCATGCCAATTTTCTGGAGGGTAGTGTATTGGACGTCACAATTTTTAACATGG 369
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 296 GGAGTTACATTCCAGATGGAATCATGCCAATTTTCTGGAGGGTAGTTTATTGGACATCACAGTTTTTGACGTGG 369
Query 370 ATTCTCTTACCTTTTATGCAGTCATATGCAAGATCAGGAGGGTTTTCCATCACTGGAAAGATCAAAACTGCACT 443
||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 370 ATCCTGTTACCTTTTATGCAGTCATATGCAAGATCTGGAGGTTTCTCCATCACCGGCAAGATCAAAACAGCCCT 443
Query 444 AATTGAGAATGCAATCTACTATGGCACCTATTTGCTGATTTTTGGAGCATTTTTAATTTATGTAGCTGTAAACC 517
.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||||||
Sbjct 444 GATTGAGAATGCCATCTATTACGGCACTTACTTGCTGATATTTGGAGCATTTCTGATTTACGTAGCTGTAAACC 517
Query 518 CACATTTACATTTAGAATGGAACCAGCTTCAGACAATTGGGATAGCTGCTGCAAATACATGGGGTCTGTTTCTT 591
|||.|||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 518 CACGTTTGCATTTAGAATGGAACCAACTTCAGACGATTGGGATAGCTGCTGCCAACACATGGGGTCTGTTTCTC 591
Query 592 CTTGTGTTGTTGTTGGGGTATGGCTTGGTGGAAATTCCTCGATCATACTGGAATGGAGCAAAAAGGGGTTATCT 665
||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 592 CTTGTGTTATTATTGGGGTATGGATTGGTGGAAATTCCTCGGTCATACTGGAATGGAGCCAAAAGGGGTTATCT 665
Query 666 ACTTATGAAAACGTATTTTAAGGCAGCCAAACTGATGACAGAGAAAGCAGATGCAGAAGAGAATTTGGAAGATG 739
.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 666 TCTTATGAAGACTTACTTTAAGGCAGCCAAACTGATGACAGAGAAGGCAGATGCAGAAGAGAATTTGGAGGATG 739
Query 740 CCATGGAGGAGGTTCGTAAAGTGAATGAAAGCATCAAGTATAATCACCCATTGAGAAAATGTGTTGATACAATA 813
..||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||.||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 740 TAATGGAGGAGGTTCGTAAAGTAAATGAGAGCATCAAGTACAACCACCCACTGAGGAAGTGTGTAGACACAATA 813
Query 814 CTTAAAAAGTGCCCTACAGAGTATCAGGAAAAAATGGGTAGGAACATGGATGATTATGAAGATTTTGATGAAAA 887
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 814 CTTAAAAAGTGCCCTACAGATTATCAGGAAAAGATGGGTAGGAATATGGATGACTATGAAGATTTTGACGAAAA 887
Query 888 GCATAGTATCTATCCAAGTGAAAAAAGTCTGGTAAAACTTCATAAACAGGTGATTTATTCAGTTCAGAGACACC 961
||..|.||.|||.|||||||||||||||.||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 888 GCGCAATACCTACCCAAGTGAAAAAAGTTTGGTAAAATTGCATAAACAGGTGATTTATTCAGTTCAAAGGCACC 961
Query 962 GTCGAACTCAAGTACAATGGCAGATTCTTTTGGAACAAGCATTTTATCTAGAAGATGTAGCAAAAAATGAAACT 1035
||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 GTCGGACTCAAGTGCAATGGCAGATTCTTTTGGAACAGGCATTCTATCTAGAAGATGTAGCAAAAAATGAAACT 1035
Query 1036 AGTGCTACTCATCAGTTTGTTCACACCTTTCAATCGCCAGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAATATTTTTATAA 1109
||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 AGCGCAACTCACCAGTTTGTTCACACCTTTCAGTCACCTGAGCCAGAAAATCGATTTATCCAATATTTTTATAA 1109
Query 1110 TCCTACATTTGAATGGTACTGGGAATGTCTTTTGCGACCATGGTTTTACAAGATACTTGCTGTGGTTCTGTCCA 1183
||||||..||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||.||..||||||||||||.||||.|
Sbjct 1110 TCCTACTGTTGAGTGGTACTGGGAATGCCTTTTGCGTCCATGGTTTCACAGGACCCTTGCTGTGGTTTTGTCTA 1183
Query 1184 TCTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGCACATTCTTTAGCACTACTCCTGTCTTATCCCTCTTTGCGGTC 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1184 TCTTCTCTGTGATTGTTGTGTGGTCAGAGTGTACCTTCTTTAGCACAACTCCTGTCTTATCCCTTTTTGCAGTA 1257
Query 1258 TTCATACAGCTGGCAGAAAAAACATATAATTATATTTATATCGAGATTGCCTGCTTCCTTTCCATCTTCTTCCT 1331
|||||||||||||||||||.||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1258 TTCATACAGCTGGCAGAAAGAACATACAATTACATTTATATTGAGATTGCTTGCTTCCTTTCCATCTTCTTCTT 1331
Query 1332 AAGTATCTGTGTTTATTCTACTGTGTTCAGGATTCGTGTATTTAACTATTATTATTTGGCCTCACATCACCAGA 1405
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||..||||||||||.||.||||
Sbjct 1332 AAGCATCTGTGTTTACTCTACTGTGTTCAGGATCCGCGTGTTTAACTACTACTACCTGGCCTCACACCATCAGA 1405
Query 1406 CTGATGCTTATAGCCTTCTTTTCAGTGGCATGCTATTTTGCCGTTTGACACCTCCTTTATGTCTTAATTTCTTG 1479
|.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1406 CCGATGCTTATAGCCTTCTGTTCAGTGGCATGTTATTTTGCCGTTTGACTCCTCCTTTATGTCTTAACTTCTTG 1479
Query 1480 GGTTTGACCCATATGGATTCATCTATCTCTCACAAGAATACTCAACCAACTGCTTATACATCTATTATGGGTTC 1553
||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1480 GGATTGACCCATATGGATTCATCCATCTCCCACCAGAATACCCAGCCAACTGCATATACATCTATCATGGGTTC 1553
Query 1554 CATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTGGTAATTCTCTGCATTG 1627
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1554 CATGAAAGTTTTATCCTTTATTGCAGATGGATTCTATATATATTATCCTATGTTGGTAGTAATTCTCTGCATCG 1627
Query 1628 CTACTTATTTTAGTTTGGGAACCCGTTGTTTGAATCTGCTCGGTTTCCAGCAGTTTATGGGAGATGATGATATG 1701
||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||
Sbjct 1628 CTACGTATTTTAGTTTGGGCACCCGTTGTTTGAATCTGCTTGGTTTCCAGCAGTTCATGGGAGATAATGATATG 1701
Query 1702 ACATCAGACTTAGTTAATGAAGGAAAAGAATTAATCAGAAAAGAGAAGAGAAAAAGGCAAAGGCAAGAAGAAGG 1775
||||||||..|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1702 ACATCAGATCTAGTTGATGAAGGAAAAGAATTAATCAGACGAGAGAAAAGAAAAAGGCAAAGACAAGAGGAAGG 1775
Query 1776 TGAAAATCGAAGAAGAGAATGGAAAGAACGTTATGGACACAATAGAGAAGATTCCACTAGGAACAGAAATATTC 1849
|||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||..|.|
Sbjct 1776 TGAAAATAGAAGAAGAGAGTGGAAAGAACGTTATGGACACAACAGAGAGGATTCCACTCGGAACAGAAACGTCC 1849
Query 1850 ATACTGACCCCAAAGAGTCAAACTTCTCAGATGTTAATACCAACCGTTCTGCATTCAAATATACCAGGGCTAAT 1923
||.|||||||||||||||||||.||||||||....|.|||||||.|.| |||.||||||.||||||||||||
Sbjct 1850 ATCCTGACCCCAAAGAGTCAAATTTCTCAGACACGACTACCAACTGGT---CATCCAAATACACCAGGGCTAAT 1920
Query 1924 AACAGGACTGAAAGGGACCGGATAGAACTTCTCCAAGATGCAGAACCTTTGGATTTTAATGCAGAAACATTCAC 1997
||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1921 AACAGGACTGAAAGAGACCGAATAGAACTTCTCCAGGATGCTGAGCCTCTGGATTTTAATGCAGAAACGTTTAC 1994
Query 1998 TGATGATCCTCTTGAATCTGAATCAGGAAGGTATCAGCCTGGTGGACGATATCTCTCGATGTCTCGCAGTGACA 2071
.|||||..||||.|||.||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||..||||...|
Sbjct 1995 GGATGAATCTCTGGAACCTGAGTCAGGAAGGTATCAACCTGGTGGGCGATATCTCTCCATGTCTTCCAGTATAA 2068
Query 2072 TATTTAATGATGTT 2085
|||||.|.|||.|.
Sbjct 2069 TATTTGAAGATATC 2082