Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09342
• Subject: NM_025850.2
• Aligned Length: 1036
• Identities: 888
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCCAGAGAATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCACCTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCAT  74
            |||||||||||.|.|.||.||||||.|||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCCCCACAAAGTCGTGCCACTCTCAAAGCCGCATCCTCCTGTTGTGGGCAAGGTGACTCATCACAGCAT  74

Query   75  TGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGACCTCAAGAGCAGTGG-TTCAGGTTCTCGATT  147
            .|||||.|||||||||||||||.||||||..|||||.||||||||.||.||||||||| ||| |||||||.|||
Sbjct   75  CGAATTGTACTGGGATCTGGAACAGAAAGAGAAACGGCAAGGACCACAGGAGCAGTGGCTTC-GGTTCTCCATT  147

Query  148  GAAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATACGGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGG  221
            ||.||.||.||||||||.|||||||..||.|||.|||||||.|||||.||||||||.|.||||||.||||||||
Sbjct  148  GAGGAGGAGGACCCCAAGATGCACAGCTACGGTGTCATTTACACGGGTTATGCAACAAGGCATGTGGTTGAAGG  221

Query  222  TCTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCAGCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCAC  295
            .||.|||||||||||.||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|.|||||||||||||.
Sbjct  222  CCTAGAACCAAGGACACTATACAAATTTCGACTGAAGGTCACCAGCCCCTCTGGAGAATATGAGTACAGCCCAG  295

Query  296  TCGTCTCAGTGTCTACAACCAGAGAGCCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATGATGAA  369
            |||||||.|||.||||.|||.|.||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  296  TCGTCTCGGTGGCTACGACCCGGGAGCCCATAAGTAGCGAACACTTTCATCGTGCTGTCAGTGTGAACGATGAA  369

Query  370  GATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACCGCTCT  443
            |||.|.|||.|.|||||..|..|||||||||.|||.|.|.||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  370  GATCTCCTGCTTCGAATTTTGGAAGGAGGCCATGTCATGATTGACGTGCCCAACAAATTTGGCTTTACCGCTCT  443

Query  444  GATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACACCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACGTGAATCTGA  517
            .|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  444  CATGGTTGCTGCTCAGAAAGGTTACACCAGGCTTGTGAAGATCCTAGTTTCCAATGGCACAGATGTGAATCTGA  517

Query  518  AGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTAATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATCTCCGA  591
            ||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct  518  AGAACGGAAGTGGCAAGGACAGTCTCATGCTTGCATGCTACGCGGGGCACCTAGATGTTGTCAAATACCTCCGG  591

Query  592  AGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGAGGCCA  665
            |||||.||.|||||||||.|||||.|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  AGACACGGAGCTTCTTGGGAGGCTCGAGACCTCGGAGGCTGCACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGAGGCCA  665

Query  666  CTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATGGACCC  739
            .|||..|||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  666  TTGCTCTGTGATTGACTGGATGATAAAGGACGGTTGTGAGGTAGATGTTGTAGACACTGGTTCAGGATGGACGC  739

Query  740  CACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCAATGTG  813
            ||||||||||||||||.||.|||.|.||||..||||.|||||||||.||.||.||.||.||||||||..|.|||
Sbjct  740  CACTCATGAGAGTCTCCGCTGTGACAGGAAGCCAGAAGGTGGCCTCACTCCTCATCGAGGCTGGGGCTGACGTG  813

Query  814  AATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTTCAGTT  887
            ||..|.|||||||.|.|||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||.||.||||||||.|
Sbjct  814  AACATCAAGGACAAAGATGGAAAGACGCCTCTCATGGTCGCTGTCTTAAATAATCACGAACAGCTAGTTCAGCT  887

Query  888  ACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAGAGTTT  961
            |||||||||.||||||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  ACTTCTTGATAAAGGGGCAGATGCAACTGTGAAAAATGAGTTTGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAGAGTTT  961

Query  962  TTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTGTCTGC  1035
            ||||||||||||.||||.|.||||||.|.|||||||.||||||||   |||.|||||.||||||.|.||||..|
Sbjct  962  TTGACAGACAGAATGTACTTTCCTTACTGGAAGAAAAGAAAAAAA---AGATGCCAAGGAAGTCCTCTGTCCAC  1032