Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09342
• Subject: XM_006718058.4
• Aligned Length: 1084
• Identities: 1032
• Gaps: 50

Alignment

Query    1  ------------------------ATGG------AGC-CCCAGAGAATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCAC  43
                                    ||.|      |.| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTCACAGGAGTTTGTTGTACATAGTATTACATCACCCAGA-AATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCAC  73

Query   44  CTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCATTGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGA  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  CTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCATTGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGA  147

Query  118  CCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCTCGATTGAAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATAC  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  CCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCTCGATTGAAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATAC  221

Query  192  GGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGTCTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCA  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGTCTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCA  295

Query  266  GCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCACTCGTCTCAGTGTCTACAACCA------------------GAGAG  321
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||
Sbjct  296  GCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCACTCGTCTCAGTGTCTACAACCAGTAGCATTTGGCTTGGAGGAGAG  369

Query  322  CCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATGATGAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGG  395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  CCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATGATGAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGG  443

Query  396  AGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACCGCTCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACA  469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  AGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACCGCTCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACA  517

Query  470  CCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACGTGAATCTGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTA  543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  CCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACGTGAATCTGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTA  591

Query  544  ATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATCTCCGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAG  617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  ATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATCTCCGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAG  665

Query  618  AGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGAGGCCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAA  691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  AGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGAGGCCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAA  739

Query  692  AGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATGGACCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCG  765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATGGACCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCG  813

Query  766  GGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCAATGTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGAC  839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCAATGTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGAC  887

Query  840  GCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTTCAGTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAA  913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTTCAGTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAA  961

Query  914  GTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAGAGTTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTA  987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  GTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAGAGTTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTA  1035

Query  988  TTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTGTCTGC  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  TTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTGTCTGC  1083