Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09342
• Subject: XM_011540349.3
• Aligned Length: 1119
• Identities: 1029
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCCAGAG------AATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCACCTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCA  68
            |||.|..|   |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAATC---GAGTGAACAAATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCACCTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCA  71

Query   69  CAGCATTGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGACCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCT  142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  CAGCATTGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGACCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCT  145

Query  143  CGATTGAAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATACGGGATATGCAACGAAGCATGTTGTT  216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  CGATTGAAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATACGGGATATGCAACGAAGCATGTTGTT  219

Query  217  GAAGGTCTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCAGCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAG  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  GAAGGTCTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCAGCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAG  293

Query  291  CCCACTCGTCTCAGTGTCTACAACCA------------------------------------------------  316
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct  294  CCCACTCGTCTCAGTGTCTACAACCAGGCCATCTCTGAGCAAGAGCCTTGTAAAAATTAGGATGGTCACAAGTG  367

Query  317  ------------------------------GAGAGCCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTG  360
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  TTCTCCACGGCCCACCCACTGAAAACACAGGAGAGCCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTG  441

Query  361  AATGATGAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTT  434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  AATGATGAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTT  515

Query  435  TACCGCTCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACACCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACG  508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  TACCGCTCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACACCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACG  589

Query  509  TGAATCTGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTAATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAA  582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  TGAATCTGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTAATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAA  663

Query  583  TATCTCCGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGA  656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  TATCTCCGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGA  737

Query  657  TGGAGGCCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAG  730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  TGGAGGCCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAG  811

Query  731  GATGGACCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGG  804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  GATGGACCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGG  885

Query  805  GCCAATGTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTT  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  GCCAATGTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTT  959

Query  879  AGTTCAGTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGG  952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  AGTTCAGTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGG  1033

Query  953  CCAGAGTTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCT  1026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  CCAGAGTTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCT  1107

Query 1027  TGTGTCTGC  1035
            |||||||||
Sbjct 1108  TGTGTCTGC  1116