Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09342
• Subject: XM_017016917.2
• Aligned Length: 1113
• Identities: 1017
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCCAGAGAATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCACCTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCAT  74
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------ATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCACCTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCAT  56

Query   75  TGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGACCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCTCGATTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   57  TGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGACCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCTCGATTG  130

Query  149  AAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATACGGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  131  AAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATACGGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGT  204

Query  223  CTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCAGCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCACT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  205  CTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCAGCCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCCCACT  278

Query  297  CGTCTCAGTGTCTACAACCA------------------------------------------------------  316
            ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct  279  CGTCTCAGTGTCTACAACCAGGCCATCTCTGAGCAAGAGCCTTGTAAAAATTAGGATGGTCACAAGTGTTCTCC  352

Query  317  ------------------------GAGAGCCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATGAT  366
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  353  ACGGCCCACCCACTGAAAACACAGGAGAGCCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATGAT  426

Query  367  GAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACCGC  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427  GAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACCGC  500

Query  441  TCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACACCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACGTGAATC  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  TCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACACCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACGTGAATC  574

Query  515  TGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTAATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATCTC  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  575  TGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTAATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATCTC  648

Query  589  CGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGAGG  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  649  CGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGAGG  722

Query  663  CCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATGGA  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  CCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATGGA  796

Query  737  CCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCAAT  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  797  CCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCAAT  870

Query  811  GTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTTCA  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  871  GTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTTCA  944

Query  885  GTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAGAG  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  945  GTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAGAG  1018

Query  959  TTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTGTC  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019  TTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTGTC  1092

Query 1033  TGC  1035
            |||
Sbjct 1093  TGC  1095