Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09342
- Subject:
- XM_017016924.1
- Aligned Length:
- 1041
- Identities:
- 749
- Gaps:
- 285
Alignment
Query 1 ATGGAGCCCCAGAGAATCATGCCACCCTCAAAGCCTCATCCACCTGTCGTGGGCAAAGTGACTCATCACAGCAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGAATTATACTGGGATCTGGAAAAGAAAGCCAAACGCCAAGGACCTCAAGAGCAGTGGTTCAGGTTCTCGATTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AAGAAGAAGACCCCAAAATGCACACTTATGGTATCATTTATACGGGATATGCAACGAAGCATGTTGTTGAAGGT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTGGAACCAAGGACGCTGTACAGATTTCGCCTGAAGGTCACCAG----CCCCTCTGGGGAGTGTGAGTACAGCC 292
|.||||||.|| |.|| ||.|||
Sbjct 1 ---------------------------------ATGGTCACAAGTGTTCTCC----------------ACGGCC 25
Query 293 CACTCGTCTCAGTGTCTACAAC-CA-GAGAGCCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATG 364
|| |.||.|| |.||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26 CA-----CCCACTG---AAAACACAGGAGAGCCCATAAGTAGTGAGCACTTGCACCGGGCTGTCAGTGTGAATG 91
Query 365 ATGAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACC 438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 ATGAAGATTTGCTGGTCCGAATACTTCAAGGAGGCCGTGTTAAGGTTGATGTTCCCAATAAGTTTGGCTTTACC 165
Query 439 GCTCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACACCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACGTGAA 512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 GCTCTGATGGTTGCTGCCCAGAAAGGATACACCAGGCTTGTGAAAATCCTAGTTTCTAATGGCACAGACGTGAA 239
Query 513 TCTGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTAATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATC 586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TCTGAAGAATGGAAGTGGCAAGGACAGTCTAATGCTGGCGTGCTATGCGGGACACCTAGATGTTGTGAAATATC 313
Query 587 TCCGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 314 TCCGAAGACATGGCGCTTCTTGGCAGGCTAGAGACCTGGGAGGCTGTACAGCTCTGCACTGGGCTGCAGATGGA 387
Query 661 GGCCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATG 734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 388 GGCCACTGCAGTGTGATTGAGTGGATGATAAAGGATGGCTGTGAGGTAGACGTCGTGGACACTGGTTCAGGATG 461
Query 735 GACCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCA 808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 GACCCCACTCATGAGAGTCTCTGCGGTGTCGGGAAATCAGAGGGTGGCCTCTCTTCTAATTGATGCTGGGGCCA 535
Query 809 ATGTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTT 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 ATGTGAATGTGAAGGACAGAAATGGAAAGACGCCCCTTATGGTGGCTGTGTTAAATAATCATGAAGAGTTAGTT 609
Query 883 CAGTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAG 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 CAGTTACTTCTTGACAAAGGGGCAGATGCAAGTGTAAAAAATGAGTTCGGCAAAGGTGTCCTAGAAATGGCCAG 683
Query 957 AGTTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTG 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 684 AGTTTTTGACAGACAGAGTGTAGTCTCCTTATTAGAAGAAAGGAAAAAAAAGCAGAGGCCAAAGAAGTCTTGTG 757
Query 1031 TCTGC 1035
|||||
Sbjct 758 TCTGC 762