Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09350
• Subject: XM_017322044.1
• Aligned Length: 2124
• Identities: 1662
• Gaps: 186

Alignment

Query    1  ATGGCAGCAGCGGCTACTGCAGCCGAGGGGGTCCCCAGTCGGGGGCCTCCCGGGGAAGTCATCCATCTGAATGT  74
            |||||.|..|||.|.|||||||..|||||||||||.||||||||..|.|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCCGTCGCGACGACTGCAGTGGAGGGGGTCCCGAGTCGGGGAGCACCCGGGGAAGTGATTCATCTGAACGT  74

Query   75  GGGAGGCAAGAGATTCAGTACCTCTCGCCAGACTCTCACCTGGATCCCAGACTCCTTCTTCTCCAGTCTTCTGA  148
            .||.||||||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct   75  AGGGGGCAAGCGGTTCAGTACCTCTCGCCAGACGCTTACCTGGATCCCAGACTCCTTCTTTTCCAGTCTTTTGA  148

Query  149  GCGGACGCATCTCGACGCTGAAAGATGAGACCGGAGCAATCTTCATCGACAGGGACCCTACAGTCTTCGCCCCC  222
            |||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  149  GCGGACGCATCTCAACCCTGAAAGATGAGACCGGAGCTATCTTCATCGACCGGGACCCCACCGTCTTTGCCCCC  222

Query  223  ATCCTCAACTTCCTGCGCACCAAAGAGTTGGATCCCAGGGGTGTCCACGGTTCCAGCCTCCTCCATGAAGCCCA  296
            |||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCCTTAATTTCCTGCGGACCAAAGAGTTAGATCCCAGGGGTGTCCATGGTTCCAGCCTCCTCCATGAAGCCCA  296

Query  297  GTTCTATGGGCTCACTCCTCTGGTTCGTCGCCTGCAGCTTCGAGAGGAGTTGGATCGATCTTCTTGTGGAAACG  370
            .|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|..|.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  297  ATTCTACGGACTCACTCCACTGGTTCGTCGCCTGCAGGTGAGGGAAGAGTTGGATCGATCTTCCTGCGGAAATG  370

Query  371  TCCTCTTCAATGGTTACCTGCCGCCACCAGTGTTCCCAGTGAAGCGGCGGAACCGGCACAGCCTAGTGGGGCCT  444
            ||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  TCCTCTTCAATGGTTATCTACCTCCTCCAGTGTTCCCAGTGAAGCGGCGAAACCGGCACAGCCTGGTGGGGCCC  444

Query  445  CAGCAGCTAGGAGGACGGCCAGCCCCTGTCCGACGGAGCAACACGATGCCCCCCAACCTTGGCAATGCAGGGCT  518
            |||||..||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||
Sbjct  445  CAGCAAATAGGGGGACGCCCAGCCCCTGTTCGACGGAGCAACACGATGCCCCCCAACTTGGGTAATGCAGGGCT  518

Query  519  GCTGGGCCGAATGCTGGATGAGAAAACCCCTCCCTCACCCTCAGGACAACCTGAGGAGCCGGGGATGGTGCGCC  592
            |||||||||||||.|.|||||||.|.|.|||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGGCCGAATGTTAGATGAGAGAGCACCTCCATCCCCATCAGGCCAACCAGAGGAGCCAGGGATGGTGCGCC  592

Query  593  TGGTGTGTGGACACCATAATTGGATCGCTGTGGCCTATACCCAGTTTCTAGTCTGCTACAGGTTGAAGGAAGCC  666
            ||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  593  TGGTGTGTGGTCACCACAACTGGATTGCTGTGGCATATACCCACTTTCTCGTCTGTTATAGGTTGAAGGAAGCC  666

Query  667  TCTGGCTGGCAGCTGGTGTTTTCCAGCCCCCGCCTGGACTGGCCCATCGAACGACTGGCGCTCACAGCCCGGGT  740
            ||.|||||||||||.|..||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||..|.||.|||||
Sbjct  667  TCGGGCTGGCAGCTTGCATTCTCCAGCCCGCGCCTGGACTGGCCCATCGAGCGCCTGGCTCTTGCGGCTCGGGT  740

Query  741  GCATGGTGGGGCTTTGGGTGAACATGACAAGATGGTGGCAGCAGCCACCGGCAGCGAGATCCTGCTATGGGCTC  814
            ||.|||.||.|||..||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  741  GCTTGGCGGTGCTCCGGGTGAGCATGACAAGATGGTGGCTGCAGCTACTGGCAGCGAGATCCTTCTGTGGGCCC  814

Query  815  TGCAGGCGGAAGGCGGTGGCTCCGAGATAGGGGTCTTTCATCTGGGGGTGCCTGTGGAGGCCTTGTTCTTCGTC  888
            |.||.||..||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct  815  TACAAGCACAAGGTGGTGGCTCTGAGATAGGTGTCTTCCACCTGGGTGTGCCAGTGGAGGCCTTGTTCTTTGTT  888

Query  889  GGGAACCAGCTCATTGCTACAAGCCACACAGGGCGCATCGGGGTGTGGAATGCCGTCACCAAGCACTGGCAGGT  962
            |||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGAATCAGCTCATTGCCACAAGTCACACAGGGCGCATCGGTGTCTGGAACGCTGTGACCAAGCACTGGCAGGT  962

Query  963  CCAGGAGGTGCAGCCCATCACCAGTTATGACGCGGCAGGCTCCTTCCTCCTCCTGGGCTGCAACAACGGCTCCA  1036
            |||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct  963  CCAGGAGGTCCAGCCTATCACGAGCTATGATGCAGCCGGCTCCTTCCTCCTCCTGGGCTGCAGCAATGGCTCCA  1036

Query 1037  TTTACTACGTGGATGTGCAGAAGTTCCCCTTGCGCATGAAAGACAACGACCTCCTTGTCAGCGAGCTCTATCGG  1110
            |.||.||.||.|||||||||||.||||||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1037  TCTATTATGTAGATGTGCAGAAATTCCCCCTGCGGATGAAGGACAACGATCTCCTTGTCAGTGAGCTCTACCGA  1110

Query 1111  GACCCAGCGGAGGATGGGGTCACCGCCCTCAGTGTCTACCTCACCCCCAAGACCAGTGACAGTGGGAACTGGAT  1184
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||                   
Sbjct 1111  GACCCAGCAGAGGATGGGGTCACCGCCCTCAGCGTCTACCTCACCCCCAAGACCA-------------------  1165

Query 1185  CGAGATCGCCTATGGCACCAGCTCAGGGGGCGTGCGGGTCATCGTGCAGCACCCGGAGACTGTGGGCTCGGGGC  1258
                                                                                      
Sbjct 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165

Query 1259  CTCAGCTCTTCCAGACCTTCACTGTGCACCGCAGCCCTGTCACCAAGATCATGCTGTCGGAGAAGCACCTCATC  1332
                                                                                      
Sbjct 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165

Query 1333  TCAGTCTGTGCCGACAACAACCACGTGCGGACATGGTCTGTGACTCGCTTCCGCGGCATGATTTCCACCCAGCC  1406
                |.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1166  ----TGTGTGCCGACAACAACCATGTTCGGACGTGGTCTGTGACCCGCTTTCGAGGCATGATCTCCACCCAGCC  1235

Query 1407  CGGCTCCACCCCACTCGCTTCCTTTAAGATCCTGGCTCTGGAGTCGGCAGATGGGCATGGCGGCTGCAGTGCTG  1480
            .||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|..|||||||..||.|||||||||||||
Sbjct 1236  TGGTTCCACTCCGCTGGCATCCTTCAAGATCCTGGCGCTGGAATCTGTTGATGGGCTCGGTGGCTGCAGTGCTG  1309

Query 1481  GCAATGACATTGGCCCCTACGGTGAGCGGGACGACCAGCTAGTGTTCATCCAGAAGGTGGTGCCCAGTGCCAGC  1554
            |||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||..||||||||||||||.||||||||.|.||||||.
Sbjct 1310  GCAATGACATTGGTCCCTATGGTGAACGGGATGACCAGCAGGTGTTCATCCAGAAAGTGGTGCCAAATGCCAGT  1383

Query 1555  CAGCTCTTCGTGCGTCTCTCATCTACTGGGCAGCGGGTGTGCTCCGTGCGCTCCGTGGACGGCTCACCCACGAC  1628
            |||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 1384  CAGCTATTTGTGCGTCTCTCTTCCACTGGGCAGCGGGTGTGTTCTGTGCGCTCGGTGGATGGGTCTCCCACGAC  1457

Query 1629  GGCCTTCACAGTGCTGGAGTGCGAGGGCTCCCGGCGGCTCGGCTCTCGGCCCCGGCGCTACCTGCTCACTGGCC  1702
            .||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||.|||||..|.|||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1458  TGCCTTCACAGTGTTGGAGTGTGAGGGCTCCAGGCGGCTGGGCTCCAGACCCCGACGTTACCTGCTCACTGGTC  1531

Query 1703  AGGCCAACGGCAGCTTGGCCATGTGGGACCTAACCACCGCCATGGACGGCCTCGGCCAGGCCCCTGCAGGTGGC  1776
            ||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||..|.||||||||.|||
Sbjct 1532  AGGCCAACGGCAGCCTGGCCATGTGGGACCTGACCACTGCCATGGATGGCCTGGGCCAAACTCCTGCAGGCGGC  1605

Query 1777  CTGACGGAGCAAGAGCTGATGGAACAGCTGGAACACTGTGAGCTG-GCCCCGCCGGCTCCTTCAGCTCCCTCAT  1849
            |||||.||..|||||||||||||.||.|||||.||.||||||||| ||          ||.|..|||.||||..
Sbjct 1606  CTGACAGAAGAAGAGCTGATGGACCAACTGGAGCAATGTGAGCTGAGC----------CCATTGGCTTCCTCTC  1669

Query 1850  GGGGCTGTCTCCCCAGCCCCTCACCCCGCATCTCCCTCACCAGCCTCCACTCAGCCTCCAGCAACACCTCCTTG  1923
            ||||||.|.|||||||||||||||||.|.|.|||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1670  GGGGCTCTTTCCCCAGCCCCTCACCCAGGACCTCTCTTACCAGTCTCCACTCAGCCTCCAGCAACACCTCCCTG  1743

Query 1924  TCTGGCCACCGTGGGAGCCCAAGCCCCCCGCAGGCTGAGGCCCGGCGCCGTGGTGGGGGCAGCTTTGTGGAACG  1997
            |.|||||.|.|.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|..||.|||||.|||||.||
Sbjct 1744  TATGGCCCCAGAGGGAGCCCCAGCCCACCACAGGCAGAGGCCCGTCGCCGCGGGGCAGGAAGCTTCGTGGATCG  1817

Query 1998  CTGCCAGGAACTGGTGCGGAGTGGGCCAGACCTCCGACGGCCACCCACACCAGCCCCGTGGCCCTCCAGCGGTC  2071
            .||.||||||||||...||.|||.||||||.|||.||.||||.||.|||||||||||..|.|||||||.|.|||
Sbjct 1818  GTGTCAGGAACTGGCAAGGGGTGCGCCAGAGCTCAGATGGCCGCCAACACCAGCCCCTCGACCCTCCACCAGTC  1891

Query 2072  TCGGCACTCCCCTCACACCTCCCAAGATGAAGCTC--AATGAAACTTCCTTT  2121
            |.||.|.||||||.|||.|||.|||||  ||.|||  ||.||||||||||||
Sbjct 1892  TTGGGAATCCCCTGACAGCTCTCAAGA--AAACTCTTAACGAAACTTCCTTT  1941