Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09428
• Subject: NM_001276327.1
• Aligned Length: 1659
• Identities: 1332
• Gaps: 324

Alignment

Query    1  ATGGCATTTTCTGAACTCCTGGACCTCGTGGGTGGCCTGGGCAGGTTCCAGGTTCTCCAGACGATGGCTCTGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCATTTTCTGAACTCCTGGACCTCGTGGGTGGCCTGGGCAGGTTCCAGGTTCTCCAGACGATGGCTCTGAT  74

Query   75  GGTCTCCATCATGTGGCTGTGTACCCAGAGCATGCTGGAGAACTTCTCGGCCGCCGTGCCCAGCCACCGCTGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTCTCCATCATGTGGCTGTGTACCCAGAGCATGCTGGAGAACTTCTCGGCCGCCGTGCCCAGCCACCGCTGCT  148

Query  149  GGGCACCCCTCCTGGACAACAGCACGGCTCAGGCCAGCATCCTAGGGAGCTTGAGTCCTGAGGCCCTCCTGGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGCACCCCTCCTGGACAACAGCACGGCTCAGGCCAGCATCCTAGGGAGCTTGAGTCCTGAGGCCCTCCTGGCT  222

Query  223  ATTTCCATCCCGCCGGGCCCCAACCAGAGGCCCCATCAGTGCCGCCGCTTCCGCCAGCCACAGTGGCAGCTCTT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTTCCATCCCGCCGGGCCCCAACCAGAGGCCCCACCAGTGCCGCCGCTTCCGCCAGCCACAGTGGCAGCTCTT  296

Query  297  GGACCCCAATGCCACGGCCACCAGCTGGAGCGAGGCCGACACGGAGCCGTGTGTGGATGGCTGGGTCTATGACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACCCCAATGCCACGGCCACCAGCTGGAGCGAGGCCGACACGGAGCCGTGTGTGGATGGCTGGGTCTATGACC  370

Query  371  GCAGCATCTTCACCTCCACAATCGTGGCCAAGTGGAACCTCGTGTGTGACTCTCACGCTCTGAAGCCCATGGCC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCAGCATCTTCACCTCCACAATCGTGGCCAAGTGGAACCTCGTGTGTGACTCTCATGCTCTGAAGCCCATGGCC  444

Query  445  CAGTCCATCTACCTGGCTGGGATTCTGGTGGGAGCTGCTGCGTGCGGCCCTGCCTCAGACAGGTTTGGGCGCAG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct  445  CAGTCCATCTACCTGGCTGGGATTCTGGTGGGAGCTGCTGCGTGCGGCCCTGCCTCAGACA-------------  505

Query  519  GCTGGTGCTAACCTGGAGCTACCTTCAGATGGCTGTGATGGGTACGGCAGCTGCCTTCGCCCCTGCCTTCCCCG  592
                                                                                      
Sbjct  506  --------------------------------------------------------------------------  505

Query  593  TGTACTGCCTGTTCCGCTTCCTGTTGGCCTTTGCCGTGGCAGGCGTCATGATGAACACGGGCACTCTCCTGATG  666
                                                                                      
Sbjct  506  --------------------------------------------------------------------------  505

Query  667  GAGTGGACGGCGGCACGGGCCCGACCCTTGGTGATGACCTTGAACTCTCTGGGCTTCAGCTTCGGCCATGGCCT  740
                                                                                      
Sbjct  506  --------------------------------------------------------------------------  505

Query  741  GACAGCTGCAGTGGCCTACGGTGTGCGGGACTGGACACTGCTGCAGCTGGTGGTCTCGGTCCCCTTCTTCCTCT  814
                                                                                      
Sbjct  506  --------------------------------------------------------------------------  505

Query  815  GCTTTTTGTACTCCTGGTGGCTGGCAGAGTCGGCACGATGGCTCCTCACCACAGGCAGGCTGGATTGGGGCCTG  888
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  ---------------GGTGGCTGGCAGAGTCGGCACGATGGCTCCTCACCACAGGCAGGCTGGATTGGGGCCTG  564

Query  889  CAGGAGCTGTGGAGGGTGGCTGCCATCAACGGAAAGGGGGCAGTGCAGGACACCCTGACCCCTGAGGTCTTGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  CAGGAGCTGTGGAGGGTGGCTGCCATCAACGGAAAGGGGGCAGTGCAGGACACCCTGACCCCTGAGGTCTTGCT  638

Query  963  TTCAGCCATGCGGGAGGAGCTGAGCATGGGCCAGCCTCCTGCCAGCCTGGGCACCCTGCTCCGCATGCCCGGAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  TTCAGCCATGCGGGAGGAGCTGAGCATGGGCCAGCCTCCTGCCAGCCTGGGCACCCTGCTCCGCATGCCCGGAC  712

Query 1037  TGCGCTTCCGGACCTGTATCTCCACGTTGTGCTGGTTCGCCTTTGGCTTCACCTTCTTCGGCCTGGCCCTGGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  TGCGCTTCCGGACCTGTATCTCCACGTTGTGCTGGTTCGCCTTTGGCTTCACCTTCTTCGGCCTGGCCCTGGAC  786

Query 1111  CTGCAGGCCCTGGGCAGCAACATCTTCCTGCTCCAAATGTTCATTGGTGTCGTGGACATCCCAGCCAAGATGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  CTGCAGGCCCTGGGCAGCAACATCTTCCTGCTCCAAATGTTCATTGGTGTCGTGGACATCCCAGCCAAGATGGG  860

Query 1185  CGCCCTGCTGCTGCTGAGCCACCTGGGCCGCCGCCCCACGCTGGCCGCATCCCTGTTGCTGGCGGGGCTCTGCA  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  861  CGCCCTGCTGCTGCTGAGCCACCTGGGCCGCCGCCCCACGCTGGCCGCATCCCTGTTGCTGGCAGGGCTCTGCA  934

Query 1259  TTCTGGCCAACACGCTGGTGCCCCACGAAATGGGGGCTCTGCGCTCAGCCTTGGCCGTGCTGGGGCTGGGCGGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  TTCTGGCCAACACGCTGGTGCCCCACGAAATGGGGGCTCTGCGCTCAGCCTTGGCCGTGCTGGGGCTGGGCGGG  1008

Query 1333  GTGGGGGCTGCCTTCACCTGCATCACCATCTACAGCAGCGAGCTCTTCCCCACTGTGCTCAGGATGACGGCAGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  GTGGGGGCTGCCTTCACCTGCATCACCATCTACAGCAGCGAGCTCTTCCCCACTGTGCTCAGGATGACGGCAGT  1082

Query 1407  GGGCTTGGGCCAGATGGCAGCCCGTGGAGGAGCCATCCTGGGGCCTCTGGTCCGGCTGCTGGGTGTCCATGGCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  GGGCTTGGGCCAGATGGCAGCCCGTGGAGGAGCCATCCTGGGGCCTCTGGTCCGGCTGCTGGGTGTCCATGGCC  1156

Query 1481  CCTGGCTGCCCTTGCTGGTGTATGGGACGGTGCCAGTGCTGAGTGGCCTGGCCGCACTGCTTCTGCCCGAGACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  CCTGGCTGCCCTTGCTGGTGTATGGGACGGTGCCAGTGCTGAGTGGCCTGGCCGCACTGCTTCTGCCCGAGACC  1230

Query 1555  CAGAGCTTGCCGCTGCCCGACACCATCCAAGATGTGCAGAACCAGGCAGTAAAGAAGGCAACACATGGCACGCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  CAGAGCTTGCCGCTGCCCGACACCATCCAAGATGTGCAGAACCAGGCAGTAAAGAAGGCAACACATGGCACGCT  1304

Query 1629  GGGGAACTCTGTCCTAAAATCCACACAGTTT  1659
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305  GGGGAACTCTGTCCTAAAATCCACACAGTTT  1335