Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09438
- Subject:
- NM_207223.1
- Aligned Length:
- 2505
- Identities:
- 2149
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCGCGCTTCAGGGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGA 74
|||||.||.|||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1 ATGACGGTAGAGTTCGAGGAATGCATCAAGGACTCGCCGCGCTTCAGGGCAACTATTGATGAGGTAGAAACAGA 74
Query 75 CGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCAGTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCT 148
.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||.||.||||
Sbjct 75 TGTGGTTGAGATCGAGGCTAAACTGGACAAGCTGGTCAAACTGTGCAGTGGTATGATTGAAGCCGGCAAAGCCT 148
Query 149 ACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC 222
||||||.|||||.||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACGTCACCACCAACAGGCTCTTTGTGAGCGGTGTCCGAGACCTGTCTCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC 222
Query 223 TCGGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTGAACTACCACATGAACCTGTTTGACCAGGC 296
||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||.||||.|||||.||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 223 TCGGAATGTCTGCAGAGGTTTGGAGACAGCCTACAGGAGATGGTCAACTATCACACGATCCTGTTTGACCAGGC 296
Query 297 CCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGC 370
||||||.||.|||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 CCAGAGATCGGTGCGGCAGCAGCTCCACAACTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAAGAGACAAAGAAGC 370
Query 371 AGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGGAACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCAC 444
||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 371 AGTTTGACAAAGTGCGGGAGGACATGGAGTTGTCCTTGGTGAGGAATGCCCAAGCCCCAAGGCACCGGCCCCAT 444
Query 445 GAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCT 518
||.||.|||||.|||||.||.||||||||..|||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 445 GAAGTAGAGGAGGCCACAGGTGCCCTCACTGTCACCCGGAAGTGCTTCCGCCACTTGGCGCTGGACTATGTGCT 518
Query 519 CCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGT 592
.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 GCAGATCAATGTCCTCCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAAATCTTAGATTCTATGCTGTCCTTCATGCATGCCCAGT 592
Query 593 CCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTG 666
.||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 593 ACAGCTTCTTCCAGCAGGGGTATAGCCTCCTACATCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCTGAGTTG 666
Query 667 GACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGAC 740
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 667 GACCAGCTTGTGATCGACTCTGCAGTGGAAAAGCGAGAGATGGAGCGCAAGCATGCTGCCATCCAGCAACGGAC 740
Query 741 GCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGG 814
.||.|||||||||||.|||||.|||||..||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 741 ACTCCTGCAGGACTTTTCCTATGATGAACCCAAAGTGGAGTTTGATGTGGATGCACCAAGTGGTGTGGTAATGG 814
Query 815 AGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGC 888
|||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 AGGGCTATCTCTTCAAGAGAGCCAGCAATGCCTTCAAGACATGGAACCGACGGTGGTTCTCCATTCAAAACAGC 888
Query 889 CAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGTGGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAA 962
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 889 CAGCTGGTCTACCAGAAGAAACTCAAGGATGCACTCACTGTGGTGGTAGATGACCTTCGCCTATGCTCTGTGAA 962
Query 963 GCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGTCACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTG 1036
.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||..|||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 ACCATGTGAGGACATTGAACGGAGGTTCTGCTTTGAAGTCGTGTCACCTACCAAGAGCTGTATGCTGCAGGCTG 1036
Query 1037 ACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCT 1110
||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1037 ACTCGGAGAAGCTGCGACAGGCTTGGGTTCAAGCTGTGCAGGCTAGCATCGCCTCTGCCTACCGGGAAAGTCCA 1110
Query 1111 GACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACAC 1184
||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||.|||.||||.|||.|
Sbjct 1111 GATAGCTGCTACAGTGAGAGGCTGGACCGTACAGCGTCGCCATCAACAAGTAGCATTGATTCCACCACGGACTC 1184
Query 1185 TCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCG 1258
||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1185 TCGGGAGCGTGGAGTCAAGGGCGAGAGCGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCTGGCAACAGCCAGTGTGGCG 1258
Query 1259 ACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATC 1332
||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1259 ACTGTGGCCAGCCAGATCCCCGCTGGGCCAGCATCAACTTGGGTGTGCTGCTCTGTATTGAGTGCTCAGGCATC 1332
Query 1333 CACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGACGCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAA 1406
|||||||||.||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333 CACAGGAGCTTGGGCGTCCACTGCTCTAAGGTACGATCTCTGACACTGGACTCCTGGGAGCCAGAGCTGCTAAA 1406
Query 1407 GCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGA 1480
|||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||||...||||
Sbjct 1407 GCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCACCGTGAACCAGATCTATGAAGCCCAGTGTGAGGGCCCAGGCGTTAGGA 1480
Query 1481 AACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTG 1554
||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1481 AACCCACAGCCAGCAGTTCCAGGCAGGACAAAGAGGCATGGATCAAGGACAAATACGTTGAAAAGAAGTTTCTA 1554
Query 1555 CGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAG 1628
||||||..|.|....||||||||||.|||..||||||||||||||||||..||||||||||.|||.||.|||||
Sbjct 1555 CGGAAGTTGACTTCTGCACCAGCCCGGGAACCCCCAAGACGCTGGAGGGCACAGAAGTGCCAGCGCCCTCACAG 1628
Query 1629 CTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCT 1702
|||.||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||.|||.||||||
Sbjct 1629 CTCCCCCCACGCCCCCACTACCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTCCTGCCCTCCGTTGCTGCTTTGTCCT 1702
Query 1703 CAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCC 1776
|||..|..||..||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1703 CAGCTGCTACTATGGAGCGCAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGCCCTGATGAGCTGGACTCCCTCTTCTCT 1776
Query 1777 TACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAGTAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGA 1850
|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1777 TACTTTGATGCAGGGGCTGCTGGGGCTGGTCCACGCAGTCTAAGCAGTGACAGTGGTCTAGGAGGCAGCTCTGA 1850
Query 1851 TGGCAGCTCGGACGTCCTGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGGACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGT 1924
||||||.||.||.||.||.||.||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 1851 TGGCAGTTCAGATGTTCTTGCCTTCGGCACAGGCTCAGTGGTGGACAGTGTCACCGAGGAAGAGGGTGCCGAGT 1924
Query 1925 CGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTG 1998
|.||||||||||||.||||||..||.|| .||.||.|||||||||.||.||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1925 CCGAGGAGTCCAGCAGTGAGGTCGATGG------AGAAGCAGAGGCCTGGAGCTTGGCAGATGTGCGTGAGCTG 1992
Query 1999 CACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCTTCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGG 2072
||.||.|||||..||||.||.|..|||||.|||.||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1993 CATCCTGGGCTGCTGGCACATCAGGCAGCTCGTACCCGTGACCTCCCAGCACTGGCTGCAGCGCTGGCCCATGG 2066
Query 2073 GGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCT 2146
.||.||.|||||||||||.||.||.|..||||||||||||||.||..||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 2067 AGCTGAAGTCAACTGGGCCGATGCAGCAGATGAGGGCAAGACCCCATTGGTGCAGGCTGTACTAGGGGGTTCCT 2140
Query 2147 TGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTG 2220
||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..||||||||.|||.||
Sbjct 2141 TGATTGTCTGTGAGTTCCTTCTGCAAAACGGAGCTGATGTGAACCAAAGAGACAGCCTTGGCCGGGCCCCCTTG 2214
Query 2221 CACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTTCCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCT 2294
|||||.||.||.||..|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 2215 CACCATGCTACACTCTTGGGCCGTACCGGCCAGGTCTGTCTGTTCCTGAAGCGGGGGGCTGACCAGCATGCCCT 2288
Query 2295 GGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTC 2368
||||||.|||||.|.||||||..||.||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.|||.||||.||.|
Sbjct 2289 GGACCAGGAGCAACAGGACCCACTGACCATCGCAGTTCAAGCAGCGAATGCTGACATTGTCACATTGCTTCGCC 2362
Query 2369 TGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCTGGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGC--- 2439
||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||.|||||..|||||||||..|||||..|||||.||||||||
Sbjct 2363 TGGCCCGCATGGCTGAGGAGATGAGAGAAGCTGAGGCGCCCCCTGGTCAGCCGGGACCCCTGCCGGGCAGCAGT 2436
Query 2440 CCCACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCACCTGGAAGAGAGC 2502
||.||.|||||.||||.|||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||.||.|||
Sbjct 2437 CCTACAGAGCTGCAGTACCGCAGGTGCATCCAGGAGTTCATTGGCCTCCACCTGGAGGAAAGC 2499