Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09438
• Subject: XM_005244715.2
• Aligned Length: 2502
• Identities: 2402
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCGCGCTTCAGGGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGA  74
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Sbjct    1  ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCGCGCTTCAGGGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGA  74

Query   75  CGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCAGTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCT  148
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Sbjct   75  CGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCAGTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCT  148

Query  149  ACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC  222

Query  223  TCGGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTGAACTACCACATGAACCTGTTTGACCAGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  223  TCGGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTGAACTACCACATGATCCTGTTTGACCAGGC  296

Query  297  CCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGC  370
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Sbjct  297  CCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGC  370

Query  371  AGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGGAACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGGAACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCAC  444

Query  445  GAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCT  518
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Sbjct  445  GAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCT  518

Query  519  CCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGT  592
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Sbjct  519  CCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGT  592

Query  593  CCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTG  666
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Sbjct  593  CCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTG  666

Query  667  GACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGAC  740
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Sbjct  667  GACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGAC  740

Query  741  GCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGG  814
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Sbjct  741  GCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGG  814

Query  815  AGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGC  888
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Sbjct  815  AGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGC  888

Query  889  CAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGTGGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAA  962
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Sbjct  889  CAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGTGGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAA  962

Query  963  GCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGTCACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTG  1036
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Sbjct  963  GCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGTCACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTG  1036

Query 1037  ACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCT  1110
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Sbjct 1037  ACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCT  1110

Query 1111  GACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACAC  1184
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Sbjct 1111  GACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACAC  1184

Query 1185  TCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCG  1258
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Sbjct 1185  TCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCG  1258

Query 1259  ACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATC  1332
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Sbjct 1259  ACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATC  1332

Query 1333  CACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGACGCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGACGCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAA  1406

Query 1407  GCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGA  1480
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Sbjct 1407  GCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGA  1480

Query 1481  AACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTG  1554
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Sbjct 1481  AACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTG  1554

Query 1555  CGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAG  1628
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Sbjct 1555  CGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAG  1628

Query 1629  CTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCT  1702
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Sbjct 1629  CTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCT  1702

Query 1703  CAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCC  1776
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Sbjct 1703  CAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCC  1776

Query 1777  TACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAGTAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGA  1850
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct 1777  TACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCA-------------------------------------  1813

Query 1851  TGGCAGCTCGGACGTCCTGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGGACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGT  1924
                                                                          ||||||||||||
Sbjct 1814  --------------------------------------------------------------AGGGTGCAGAGT  1825

Query 1925  CGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTG  1998
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Sbjct 1826  CGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTG  1899

Query 1999  CACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCTTCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGG  2072
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Sbjct 1900  CACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCTTCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGG  1973

Query 2073  GGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCT  2146
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Sbjct 1974  GGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCT  2047

Query 2147  TGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTG  2220
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Sbjct 2048  TGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTG  2121

Query 2221  CACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTTCCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCT  2294
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Sbjct 2122  CACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTTCCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCT  2195

Query 2295  GGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTC  2368
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Sbjct 2196  GGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTC  2269

Query 2369  TGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCTGGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCC  2442
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Sbjct 2270  TGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCTGGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCC  2343

Query 2443  ACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCACCTGGAAGAGAGC  2502
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Sbjct 2344  ACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCACCTGGAAGAGAGC  2403