Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09438
- Subject:
- XM_011540609.2
- Aligned Length:
- 2532
- Identities:
- 2402
- Gaps:
- 129
Alignment
Query 1 ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCGCGCTTCAGGGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGA 74
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Sbjct 1 ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCGCGCTTCAGGGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGA 74
Query 75 CGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCAGTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCT 148
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Sbjct 75 CGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCAGTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCT 148
Query 149 ACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC 222
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Sbjct 149 ACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC 222
Query 223 TC------------------------------GGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGT 266
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Sbjct 223 TCGGTGAGGGGCCGACTGACCTCTGACCTCAAGGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGT 296
Query 267 GAACTACCACATGAACCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGG 340
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Sbjct 297 GAACTACCACATGATCCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGG 370
Query 341 ATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGG 414
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Sbjct 371 ATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGG 444
Query 415 AACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTG 488
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Sbjct 445 AACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTG 518
Query 489 CTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCTCCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGG 562
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Sbjct 519 CTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCTCCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGG 592
Query 563 ACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGAC 636
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Sbjct 593 ACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGAC 666
Query 637 CCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTGGACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGA 710
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Sbjct 667 CCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTGGACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGA 740
Query 711 GCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTG 784
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Sbjct 741 GCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTG 814
Query 785 ACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGGAGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGG 858
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Sbjct 815 ACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGGAGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGG 888
Query 859 AACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGT 932
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Sbjct 889 AACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGT 962
Query 933 GGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGT 1006
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Sbjct 963 GGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGT 1036
Query 1007 CACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTGACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCC 1080
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Sbjct 1037 CACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTGACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCC 1110
Query 1081 AGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTC 1154
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Sbjct 1111 AGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTC 1184
Query 1155 CACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGC 1228
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Sbjct 1185 CACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGC 1258
Query 1229 AGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGC 1302
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Sbjct 1259 AGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGC 1332
Query 1303 GTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATCCACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGAC 1376
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Sbjct 1333 GTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATCCACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGAC 1406
Query 1377 GCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATG 1450
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Sbjct 1407 GCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATG 1480
Query 1451 AGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATC 1524
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Sbjct 1481 AGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATC 1554
Query 1525 AAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTGCGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTG 1598
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Sbjct 1555 AAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTGCGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTG 1628
Query 1599 GAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGC 1672
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Sbjct 1629 GAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGC 1702
Query 1673 CCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCTCAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTC 1746
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Sbjct 1703 CCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCTCAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTC 1776
Query 1747 TGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAG 1820
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Sbjct 1777 TGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCA------- 1843
Query 1821 TAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGATGGCAGCTCGGACGTCCTGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGG 1894
Sbjct 1844 -------------------------------------------------------------------------- 1843
Query 1895 ACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGTCGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAG 1968
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Sbjct 1844 ------------------AGGGTGCAGAGTCGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAG 1899
Query 1969 GCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCT 2042
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Sbjct 1900 GCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCT 1973
Query 2043 TCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGC 2116
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Sbjct 1974 TCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGC 2047
Query 2117 CGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAAC 2190
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Sbjct 2048 CGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAAC 2121
Query 2191 CAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTT 2264
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Sbjct 2122 CAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTT 2195
Query 2265 CCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGG 2338
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Sbjct 2196 CCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGG 2269
Query 2339 CCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCT 2412
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Sbjct 2270 CCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCT 2343
Query 2413 GGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCT 2486
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Sbjct 2344 GGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCT 2417
Query 2487 CCACCTGGAAGAGAGC 2502
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Sbjct 2418 CCACCTGGAAGAGAGC 2433