Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09448
• Subject: XM_024446326.1
• Aligned Length: 1246
• Identities: 862
• Gaps: 371

Alignment

Query    1  ATGGTTGTGCAAAACAGCGCAGATGCCGGGGACATGAGGGCAGGCGTGCAGCTGGAGCCCTTCCTGCACCAGGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGGGGGGCACATGAGCGTGATGAAGTATGACGAGCATACGGTGTGCAAGCCCCTCGTCTCCCGGGAGCAGAGGT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCTATGAATCCCTGCCACTGGCCATGAAGCGGTTCACCCCACAGTACAAAGGTACCGTCACAGTGCACCTCTGG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AAAGACAGCACAGGCCATCTCAGCTTGGTTGCCAACCCAGTGAAGGAGAGCCAGGAGCCCTTCAAGGTCTCCAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGAGTCGGCGGCGGTGGCCATATGGCAGACGCTCC-AGCAGACCACCGGCAGCAATGGCAGCGACTGCACCCTT  369
                                 |||.||    |||| ||.|       ||.||.|.|    .||| ||||...|.
Sbjct    1  ---------------------ATGTCA----CTCCTAGAA-------GGGAGGATT----ACGA-TGCATTTTA  37

Query  370  GCCCAG----TGGCCGCATGCCCAGCTGGCACGCTCACCCAAGGAGAG-----------CCCGGCCAAGGCTCT  428
            .|||||    ||     ||||.|||                 |.||||           |||||||||||||||
Sbjct   38  TCCCAGAAGTTG-----ATGCACAG-----------------GCAGAGTTGTCTACTGACCCGGCCAAGGCTCT  89

Query  429  TCTGAGGTCCGAGCCCCACCTCAACACTCCAGCCTTCTCGCTGGTGGAAGACACCAACGGAAACCAGGTTGAGA  502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   90  TCTGAGGTCCGAGCCCCACCTCAACACTCCAGCCTTCTCGCTGGTGGAAGACACCAACGGAAACCAGGTTGAGA  163

Query  503  GGAAGAGCTTCAACCCGTGGGGCCTGCAATGCCACCAGGCCCACCTGACCCGCCTGTGCTCCGAGTACCCAGAG  576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  164  GGAAGAGCTTCAACCCGTGGGGCCTGCAATGCCACCAGGCCCACCTGACCCGCCTGTGCTCCGAGTACCCAGAG  237

Query  577  AACAAGCGGCATCGGTTCTTGTTGCTGGAAAATGTAGTGTCACAGTACACGCATCCCTGTGTCCTGGATCTGAA  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  238  AACAAGCGGCATCGGTTCTTGTTGCTGGAAAATGTAGTGTCACAGTACACGCATCCCTGTGTCCTGGATCTGAA  311

Query  651  GATGGGGACCCGGCAGCACGGCGATGATGCATCGGAGGAGAAGAAGGCCCGCCACATGAGGAAGTGTGCGCAGA  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  312  GATGGGGACCCGGCAGCACGGCGATGATGCATCGGAGGAGAAGAAGGCCCGCCACATGAGGAAGTGTGCGCAGA  385

Query  725  GCACCTCAGCCTGCCTGGGTGTGCGCATCTGCGGCATGCAGGTTTATCAAACAGATAAGAAGTACTTTCTCTGC  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  386  GCACCTCAGCCTGCCTGGGTGTGCGCATCTGCGGCATGCAGGTTTATCAAACAGATAAGAAGTACTTTCTCTGC  459

Query  799  AAAGACAAGTACTATGGAAGAAAACTCTCAGTGGAGGGGTTCAGACAAGCCCTCTATCAGTTCCTACATAATGG  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  460  AAAGACAAGTACTATGGAAGAAAACTCTCAGTGGAGGGGTTCAGACAAGCCCTCTATCAGTTCCTACATAATGG  533

Query  873  AAGCCACCTCCGGAGGGAGCTCCTGGAGCCCATCCTGCACCAGCTCCGGGCCCTCCTCTCTGTCATTAGGAGCC  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  534  AAGCCACCTCCGGAGGGAGCTCCTGGAGCCCATCCTGCACCAGCTCCGGGCCCTCCTCTCTGTCATTAGGAGCC  607

Query  947  AGAGTTCATACCGCTTCTATTCCAGCTCTCTCCTTGTCATCTATGATGGGCAGGAACCACCAGAAAGAGCCCCA  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  608  AGAGTTCATACCGCTTCTATTCCAGCTCTCTCCTTGTCATCTATGATGGGCAGGAACCACCAGAAAGAGCCCCA  681

Query 1021  GGCAGCCCGCATCCTCACGAGGCTCCCCAGGCAGCCCACGGTAGCTCTCCCGGTGGTCTCACCAAGGTTGACAT  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  682  GGCAGCCCGCATCCTCACGAGGCTCCCCAGGCAGCCCACGGTAGCTCTCCCGGTGGTCTCACCAAGGTTGACAT  755

Query 1095  CCGCATGATTGACTTTGCTCATACCACATACAAGGGCTACTGGAATGAGCACACCACCTACGATGGACCAGACC  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  756  CCGCATGATTGACTTTGCTCATACCACATACAAGGGCTACTGGAATGAGCACACCACCTACGATGGACCAGACC  829

Query 1169  CTGGCTATATTTTTGGCCTGGAAAACCTCATCAGGATCCTGCAGGATATCCAAGAGGGAGAA  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  830  CTGGCTATATTTTTGGCCTGGAAAACCTCATCAGGATCCTGCAGGATATCCAAGAGGGAGAA  891