Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09483
• Subject: NM_170721.2
• Aligned Length: 1017
• Identities: 702
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGGANGCAAATGGGAGCCAAGGCACCTCGGGCA---GCGCCAAC------------GACTCCCAGCACGACCC  59
                      |||   |||.|      ||.|.||   |.||..||            ..||||        |.|
Sbjct    1  ----------ATG---GCCGA------TCTGACATCGGTGCTCACTTCTGTTATGTTTTCTCC--------CTC  47

Query   60  CGGTAAAATGTTTATCGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTG  133
            ..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   48  TAGTAAAATGTTTATCGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTG  121

Query  134  GAGAAATTAGAGAATGTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTC  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  GAGAAATTAGAGAATGTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTC  195

Query  208  GCAGACCCAGCAAGTGTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAA  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  GCAGACCCAGCAAGTGTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAA  269

Query  282  AGTTGCATTTCCTCGTCGAGCGCAACCCAAGATGGTCACGAGAACAAAGAAAATATTTGTAGGCGGGTTATCTG  355
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  AGTTGCATTTCCTCGTCGAGCGCAACCCAAGATGGTCACAAGAACAAAGAAAATATTTGTAGGCGGGTTATCTG  343

Query  356  CGAACACAGTAGTGGAAGATGTAAAGCAATATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTT  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  CGAACACAGTAGTGGAAGATGTAAAGCAATATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTT  417

Query  430  GATAAAACTACCAACAGGCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTG  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  GATAAAACTACCAACAGGCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTG  491

Query  504  TGAGATTCATTTCCATGAAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCC  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  TGAGATTCATTTCCATGAAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCC  565

Query  578  CACCTGGGACAAGAGGCCGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTG  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  CACCTGGGACAAGAGGCCGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTG  639

Query  652  GGATATCCCAACTTCGTGGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCC  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  GGATATCCCAACTTCGTGGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCC  713

Query  726  A-----------GGCTTCCCAGCAGCGGC-------TTATGGACCAGTGGCAGCAGCGGCGGTGGCGGCAGCAA  781
            |           ||.|||.||    .|.|       ||||..||                              
Sbjct  714  AGACTATTTGCCGGTTTCACA----AGACATAATTTTTATCAAC------------------------------  753

Query  782  GAGGATCAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGCTTCCCGGGGGCCAACAGCCCAGGACCTGTCGCCGATCTC  855
                                                                                      
Sbjct  754  --------------------------------------------------------------------------  753

Query  856  TACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAATTACATAAGTGCGGCCAGCCCACAGCCGGGCTCGGGCTT  929
                                                                                      
Sbjct  754  --------------------------------------------------------------------------  753

Query  930  CGGCCACGGCATAGCTGGACCTTTGATTGCAACGGCCTTTACAAATGGATACCAT  984
                                                                   
Sbjct  754  -------------------------------------------------------  753