Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09483
- Subject:
- XM_006534431.2
- Aligned Length:
- 1150
- Identities:
- 918
- Gaps:
- 182
Alignment
Query 1 ATGGANGCAAATGGGAGCCAAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT 74
|||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGCAAATGGGAGCCCAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT 74
Query 75 CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT 148
Query 149 GTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTCGCAGACCCAGCAAGT 222
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTATGGTCATGAGAGATCCCACAACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACCTTCGCAGACCCAGCAAGT 222
Query 223 GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAAAGTTGCATTTCCTCG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCAAAAGTTGCATTTCCTCG 296
Query 297 TCGAGCGCAACC-------------------------------------------------------------- 308
||||||||||||
Sbjct 297 TCGAGCGCAACCTAAGAGTCAAGAGCAGGGAGGCTCCTGGAAACGCACATGGACCACGGTCCAAGCTCGGGCTG 370
Query 309 ----------CAAGATGGTCACGAGAACAAAGAAAATATTTGTAGGCGGGTTATCTGCGAACACAGTAGTGGAA 372
|.||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 CCTCAGGTGACCAGATGGTCACAAGAACAAAGAAAATCTTCGTAGGAGGATTGTCTGCAAACACAGTAGTGGAA 444
Query 373 GATGTAAAGCAATATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTTGATAAAACTACCAACAG 446
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 445 GATGTAAAGCAGTATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTAGAGGATGCGATGCTGATGTTCGACAAAACCACCAACAG 518
Query 447 GCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCATG 520
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACCTTTGAGAATGAAGACGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCATG 592
Query 521 AAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAGGC 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAGGC 666
Query 595 CGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGATATCCCAACTTCGT 668
|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 667 CGGGCCCGGGGGCTGCCATACACCATGGATGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGCTACCCCAACTTTGT 740
Query 669 GGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCCAG--------------- 727
|||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 741 GGCAACCTATGGCAGAGGCTACCCCGGATTTGCTCCTAGCTATGGCTACCAGTTCCCAGCCCTATTACCATATT 814
Query 728 ---------GCTTCCCAGCAGCGGCTTATGGACCAGTGGCAGCAGCGGCGGTGGCGGCAGCAAGAGGAT----- 787
|||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||..||||||
Sbjct 815 TAAATGCAAGCTTCCCGGCGGCAGCTTATGGACCAGTGGCAGCGGCAGCTGTGGCAGCGGCTCGAGGATCAGTC 888
Query 788 -------------------------------------------------CAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGG 812
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGAATAGCTACAGTGCTCAACCGAATTTTGGCGCGCCCGCTTCCCCGGCAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGG 962
Query 813 AGGCTTCCCGGGGGCCAACAGCCCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGG 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGGCTTCCCGGGGGCCAACAGCCCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGG 1036
Query 887 GGAATTACATAAGTGCGGCCAGCCCACAGCCGGGCTCGGGCTTCGGCCACGGCATAGCTGG---ACCTTTGAT- 956
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.| ||| |.|||
Sbjct 1037 GGAATTACATAAGCGCGGCCAGCCCACAGCCGGGCTCCGGCTTCGGCCACGGCATAGCTAGCATACC-TGGATG 1109
Query 957 ----TGCAACGGCCT--------TTACAAATGGATACCAT 984
.|||| |.|| ||.|
Sbjct 1110 TCCAGGCAA--GACTGGGCGAAGTTTC------------- 1134