Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09520
- Subject:
- XM_011529871.3
- Aligned Length:
- 1397
- Identities:
- 1209
- Gaps:
- 163
Alignment
Query 1 ATGGGCGGCCCGCGGGCTTGGGCGCTGCTCTGCCTCGGGCTCCTGCTCCCGGGAGGCGGCGCTGCGTGGAGCAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGCGGCCCGCGGGCTTGGGCGCTGCTCTGCCTCGGGCTCCTGCTCCCGGGAGGCGGCGCTGCGTGGAGCAT 74
Query 75 CGGGGCAGCTCCGTTCTCCGGACGCAGGAACTGGTGCTCCTATGTGGTGACCCGCACCATCTCATGCCATGTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGGGCAGCTCCGTTCTCCGGACGCAGGAACTGGTGCTCCTATGTGGTGACCCGCACCATCTCATGCCATGTGC 148
Query 149 AGAATGGCACCTACCTTCAGCGAGTGCTGCAGAACTGCCCCTGGCCCATGAGCTGTCCGGGGAGCAGCTACAGA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAATGGCACCTACCTTCAGCGAGTGCTGCAGAACTGCCCCTGGCCCATGAGCTGTCCGGGGAGCAGCTACAGA 222
Query 223 ACTGTGGTGAGACCCACATACAAGGTGATGTACAAGATAGTGACCGCCCGTGAGTGGAGGTGCTGCCCTGGGCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACTGTGGTGAGACCCACATACAAGGTGATGTACAAGATAGTGACCGCCCGTGAGTGGAGGTGCTGCCCTGGGCA 296
Query 297 CTCAGGAGTGAGCTGCGAGGAAGTTGCAGGTTCCTCTGCCTCCTTGGAGCCCATGTGGTCGGGCAGTACCATGC 370
|||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTCAGGAGTGAGCTGCGAGGA----------------------------------------------------- 317
Query 371 GGCGGATGGCGCTTCGGCCCACAGCCTTCTCAGGTTGTCTCAACTGCAGCAAAGTGTCAGAGCTGACAGAGCGG 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 318 -------------------------------AGGTTGTCTCAACTGCAGCAAAGTGTCAGAGCTGACAGAGCGG 360
Query 445 CTGAAGGTGCTGGAGGCCAAGATGACCATGCTGACTGTCATAGAGCAGCCAGTACCTCCAACACCAGCTACCCC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CTGAAGGTGCTGGAGGCCAAGATGACCATGCTGACTGTCATAGAGCAGCCAGTACCTCCAACACCAGCTACCCC 434
Query 519 TGAGGACCCTGCCCCGCTCTGGGGTCCCCCTCCTGCCCAGGGCAGCCCCGGAGATGGAGGCCTCCAG------- 585
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 TGAGGACCCTGCCCCGCTCTGGGGTCCCCCTCCTGCCCAGGGCAGCCCCGGAGATGGAGGCCTCCAGGGGCTGC 508
Query 586 --------------------------------------------GACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGG 615
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 509 CAGGAGCCATAGAGAGTGTGAGGGTCCCGCTGCTTCCCCGAAATGACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGG 582
Query 616 CCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGGGGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCC 689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 CCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGGGGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCC 656
Query 690 CCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGGCACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTC 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 CCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGGCACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTC 730
Query 764 CTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGCCACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTG 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 731 CTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGCCACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTG 804
Query 838 TCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGGCCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCAT 911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 TCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGGCCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCAT 878
Query 912 GGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGTCCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTG 985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 GGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGTCCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTG 952
Query 986 GACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGAAGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGC 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 GACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGAAGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGC 1026
Query 1060 TCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAGGGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGG---------GGGA 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ...|
Sbjct 1027 TCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAGGGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGGCTCCTAGCTTACA 1100
Query 1125 GGGGT---TGCACCAGCTACGCGAGGCT---TTGAAGATTTTAGCTGAGA-GGGTTTTAATCTTGGAAACAATG 1191
|.|.| ||||.|||| ||||| .||.||.|..|.|| .||| ||||.....||.|||||.|.||.
Sbjct 1101 GAGCTTCCTGCAGCAGC------AGGCTCAGCTGGAGCTCCTGGC-CAGACGGGTCACCCTCCTGGAAGCCATC 1167
Query 1192 AT-TGGGCTCTATGAGCCAGAGCTGGGGTCTGGGGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGG 1264
|| |||.| .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168 ATCTGGCC----AGAACCAGAGCTGGGGTCTGGGGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGG 1237
Query 1265 GCAAGAGGGGCGGACATGCAACCAACTACCGGATCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC 1329
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238 GCAAGAGGGGCGGACATGCAACCAACTACCGGATCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC 1302