Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09520
• Subject: XM_011529874.2
• Aligned Length: 1397
• Identities: 1097
• Gaps: 274

Alignment

Query    1  ATGGGCGGCCCGCGGGCTTGGGCGCTGCTCTGCCTCGGGCTCCTGCTCCCGGGAGGCGGCGCTGCGTGGAGCAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGGGGCAGCTCCGTTCTCCGGACGCAGGAACTGGTGCTCCTATGTGGTGACCCGCACCATCTCATGCCATGTGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGAATGGCACCTACCTTCAGCGAGTGCTGCAGAACTGCCCCTGGCCCATGAGCTGTCCGGGGAGCAGCTACAGA  222
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------ATGAGCTGTCCGGGGAGCAGCTACAGA  27

Query  223  ACTGTGGTGAGACCCACATACAAGGTGATGTACAAGATAGTGACCGCCCGTGAGTGGAGGTGCTGCCCTGGGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   28  ACTGTGGTGAGACCCACATACAAGGTGATGTACAAGATAGTGACCGCCCGTGAGTGGAGGTGCTGCCCTGGGCA  101

Query  297  CTCAGGAGTGAGCTGCGAGGAAGTTGCAGGTTCCTCTGCCTCCTTGGAGCCCATGTGGTCGGGCAGTACCATGC  370
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  102  CTCAGGAGTGAGCTGCGAGGAAGTTGCAGCTTCCTCTGCCTCCTTGGAGCCCATGTGGTCGGGCAGTACCATGC  175

Query  371  GGCGGATGGCGCTTCGGCCCACAGCCTTCTCAGGTTGTCTCAACTGCAGCAAAGTGTCAGAGCTGACAGAGCGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  176  GGCGGATGGCGCTTCGGCCCACAGCCTTCTCAGGTTGTCTCAACTGCAGCAAAGTGTCAGAGCTGACAGAGCGG  249

Query  445  CTGAAGGTGCTGGAGGCCAAGATGACCATGCTGACTGTCATAGAGCAGCCAGTACCTCCAACACCAGCTACCCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  250  CTGAAGGTGCTGGAGGCCAAGATGACCATGCTGACTGTCATAGAGCAGCCAGTACCTCCAACACCAGCTACCCC  323

Query  519  TGAGGACCCTGCCCCGCTCTGGGGTCCCCCTCCTGCCCAGGGCAGCCCCGGAGATGGAGGCCTCCAG-------  585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  324  TGAGGACCCTGCCCCGCTCTGGGGTCCCCCTCCTGCCCAGGGCAGCCCCGGAGATGGAGGCCTCCAGGGGCTGC  397

Query  586  --------------------------------------------GACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGG  615
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  398  CAGGAGCCATAGAGAGTGTGAGGGTCCCGCTGCTTCCCCGAAATGACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGG  471

Query  616  CCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGGGGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCC  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  472  CCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGGGGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCC  545

Query  690  CCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGGCACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTC  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  546  CCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGGCACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTC  619

Query  764  CTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGCCACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTG  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  620  CTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGCCACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTG  693

Query  838  TCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGGCCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCAT  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  694  TCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGGCCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCAT  767

Query  912  GGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGTCCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTG  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  768  GGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGTCCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTG  841

Query  986  GACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGAAGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGC  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  GACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGAAGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGC  915

Query 1060  TCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAGGGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGG---------GGGA  1124
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ...|
Sbjct  916  TCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAGGGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGGCTCCTAGCTTACA  989

Query 1125  GGGGT---TGCACCAGCTACGCGAGGCT---TTGAAGATTTTAGCTGAGA-GGGTTTTAATCTTGGAAACAATG  1191
            |.|.|   ||||.||||      |||||   .||.||.|..|.|| .||| ||||.....||.|||||.|.||.
Sbjct  990  GAGCTTCCTGCAGCAGC------AGGCTCAGCTGGAGCTCCTGGC-CAGACGGGTCACCCTCCTGGAAGCCATC  1056

Query 1192  AT-TGGGCTCTATGAGCCAGAGCTGGGGTCTGGGGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGG  1264
            || |||.|    .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057  ATCTGGCC----AGAACCAGAGCTGGGGTCTGGGGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGG  1126

Query 1265  GCAAGAGGGGCGGACATGCAACCAACTACCGGATCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC  1329
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127  GCAAGAGGGGCGGACATGCAACCAACTACCGGATCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC  1191