Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09527
- Subject:
- XM_011239108.2
- Aligned Length:
- 1479
- Identities:
- 1144
- Gaps:
- 150
Alignment
Query 1 ATGACCCGGGCGCTCTGCTCAGCGCTCCGCCAGGCTCTCCTGCTGCTCGCAGCGGCCGCCGAGCTCTCGCCAGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACTGAAGTGTGTATGTCTTTTGTGTGATTCTTCAAACTTTACCTGCCAAACAGAAGGAGCATGTTGGGCATCAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGTCTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTC 222
|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1 --ATGCTAACCAACGGGAAAGAGCAGGTGATCAAATCGTGTGTGTCCCTCCCGGAACTAAATGCTCAGGTCTTC 72
Query 223 TGTCATAGTTCCAACAATGTTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTGCACCT 296
|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 73 TGTCACAGTTCCAACAACGTGACCAAAACCGAATGTTGCTTCACAGACTTCTGCAACAATATCACACTGCACCT 146
Query 297 TCCAACAGCATCACCAAATGCCCCAAAACTTGGACCCATGGAGCTGGCCATCATTATTACTGTGCCTGTTTGCC 370
|||.||||||||.|||||||||||...||||||.||||..||||||.|..|..||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 147 TCCCACAGCATCGCCAAATGCCCCTCGACTTGGTCCCACAGAGCTGACGGTTGTTATCACCGTGCCGGTTTGCC 220
Query 371 TCCTGTCCATAGCTGCGATGCTGACAGTATGGGCATGCCAGGGTCGACAGTGCTCCTACAGGAAGAAAAAGAGA 444
|||||||||||||.||.|||||.|||.|||||||.|||||||..||.||||||.|.||||||||||..||||||
Sbjct 221 TCCTGTCCATAGCCGCCATGCTAACAATATGGGCGTGCCAGGACCGCCAGTGCACATACAGGAAGACTAAGAGA 294
Query 445 CCAAATGTGGAGGAACCACTCTCTGAGTGCAATCTGGTAAATGCTGGAAAAACTCTGAAAGATCTGATTTATGA 518
|..||.|||||||||.|.||..||||||.||..||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct 295 CACAACGTGGAGGAAGCGCTGGCTGAGTACAGCCTTGTGAATGCAGGAAAAACACTCAAGGATCTGATCTACGA 368
Query 519 TGTGACCGCCTCTGGATCTGGCTCTGGTCTACCTCTGTTGGTTCAAAGGACAATTGCAAGGACGATTGTGCTTC 592
||..||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 369 TGCTACTGCCTCTGGCTCAGGCTCTGGTCTGCCTCTCTTGGTTCAAAGAACAATCGCAAGGACAATTGTACTTC 442
Query 593 AGGAAATAGTAGGAAAAGGTAGATTTGGTGAGGTGTGGCATGGAAGATGGTGTGGGGAAGATGTGGCTGTGAAA 666
|.|||||.||||||||||||.|.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 443 AAGAAATCGTAGGAAAAGGTCGGTTTGGGGAAGTGTGGCACGGAAGATGGTGTGGAGAAGATGTGGCTGTGAAA 516
Query 667 ATATTCTCCTCCAGAGATGAAAGATATTGGTTTCGTGAGGCAGAAATTTACCAGACGGTCATGCTGCGACATGA 740
||||||||||||||.|||||.||||.||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||.||
Sbjct 517 ATATTCTCCTCCAGGGATGAGAGATCTTGGTTCCGTGAGGCGGAAATTTATCAGACGGTGATGCTGAGACACGA 590
Query 741 AAACATCCTTGGTTTCATTGCTGCTGACAACAAAGATAATGGAACTTGGACTCAACTTTGGCTGGTATCTGAAT 814
.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 591 GAACATCCTCGGTTTCATCGCAGCTGACAACAAAGATAATGGAACTTGGACACAACTCTGGCTTGTGTCAGAGT 664
Query 815 ATCATGAACAGGGCTCCTTATATGACTATTTGAATAGAAATATAGTGACCATGGCTGGAATGATCAAGCTGGCG 888
||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||..|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 665 ATCACGAGCAGGGCTCCTTGTATGACTATTTGAACAGAAACATAGTGACTGTGGCTGGAATGGTCAAGCTGGCG 738
Query 889 CTCTCAATTGCTAGTGGTCTGGCACACCTTCATATGGAGATTGTTGGTACACAAGGTAAACCTGCTATTGCTCA 962
||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 739 CTTTCCATAGCGAGTGGTCTGGCTCACCTGCACATGGAGATCGTGGGTACTCAAGGTAAGCCTGCTATTGCTCA 812
Query 963 TCGAGACATAAAATCAAAGAATATCTTAGTAAAAAAGTGTGAAACTTGTGCCATAGCGGACTTAGGGTTGGCTG 1036
.|||||.|||||.||||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 813 CCGAGATATAAAGTCAAAGAATATCCTAGTCAAAAAATGTGACACTTGTGCCATAGCTGACTTAGGGCTGGCTG 886
Query 1037 TGAAGCATGATTCAATACTGAACACTATCGACATACCTCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTATATGGCT 1110
|||||||.|||||.||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 887 TGAAGCACGATTCTATCATGAACACTATAGACATACCCCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTACATGGCT 960
Query 1111 CCTGAAATGCTTGATGATACAATGAATGTGAATATCTTTGAGTCCTTCAAACGAGCTGACATCTATTCTGTTGG 1184
||.|||||||||||||||||||||||..|||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 961 CCCGAAATGCTTGATGATACAATGAACCTGAGCATCTTTGAGTCCTTCAAGCGAGCTGACATCTATTCGGTGGG 1034
Query 1185 TCTGGTTTACTGGGAAATAGCCCGGAGGTGTTCAGTCGGAGGAATTGTTGAGGAGTACCAATTGCCTTATTATG 1258
.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1035 GCTGGTTTACTGGGAAATAGCTCGAAGGTGTTCAGTTGGAGGAGTTGTTGAGGAGTACCAGTTGCCTTACTATG 1108
Query 1259 ACATGGTGCCTTCAGATCCCTCGATAGAGGAAATGAGAAAGGTTGTTTGTGACCAGAAGTTTCGACCAAGTATC 1332
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||||.|.||
Sbjct 1109 ACATGGTGCCTTCAGATCCTTCGATAGAAGAAATGAGGAAGGTTGTCTGTGATCAGAAACTCCGACCAAATCTC 1182
Query 1333 CCAAACCAGTGGCAAAGTTGTGAAGCACTCCGAGTCATGGGGAGAATAATGCGTGAGTGTTGGTATGCCAACGG 1406
|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1183 CCAAACCAGTGGCAAAGCTGTGAAGCGCTGCGGGTCATGGGAAGAATAATGCGTGAGTGCTGGTACGCCAACGG 1256
Query 1407 AGCGGCCCGCCTAACTGCTCTTCGTATTAAGAAGACTATATCTCAACTTTGTGTCAAAGAAGACTGCAAAGCC 1479
.||.||.|||||.||.||.||.||..|.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1257 GGCAGCACGCCTGACAGCCCTGCGCGTGAAGAAGACCATCTCCCAGCTGTGTGTCAAGGAAGACTGTAAAGCT 1329