Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09549
Subject:
NM_001205301.2
Aligned Length:
1017
Identities:
1007
Gaps:
8

Alignment

Query    1  MDLIRGVLLRLLLLASSLGPGAVSLRAAIRKPGKVGPPLDIKLGALNCTAFSIQWKMPRHPGSPILGYTVFYSE  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MDLIRGVLLRLLLLASSLGPGAVSLRAAIRKPGKVGPPLDIKLGALNCTAFSIQWKMPRHPGSPILGYTVFYSE  74

Query   75  VGADKSLQEQLHSVPLSRDIPTTEEVIGDLKPGTEYRVSIAAYSQAGKGRLSSPRHVTTLSQDSCLPPAAPQQP  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  VGADKSLQEQLHSVPLSRDIPTTEEVIGDLKPGTEYRVSIAAYSQAGKGRLSSPRHVTTLSQDSCLPPAAPQQP  148

Query  149  HVIVVSDSEVALSWKPGASEGSAPIQYYSVEFIRPDFDKKWTSIHERIQMDSMVIKGLDPDTNYQFAVRAMNSH  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  HVIVVSDSEVALSWKPGASEGSAPIQYYSVEFIRPDFDKKWTSIHERIQMDSMVIKGLDPDTNYQFAVRAMNSH  222

Query  223  GPSPRSWPSDIIRTLCPEEAGSGRYGPRYITDMGAGEDDEGFEDDLDLDISFEEVKPLPATKGGNKKFLVESKK  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GPSPRSWPSDIIRTLCPEEAGSGRYGPRYITDMGAGEDDEGFEDDLDLDISFEEVKPLPATKGGNKKFLVESKK  296

Query  297  MSISNPKTISRLIPPTSASLPVTTVAPQPIPIQRKGKNGVAIMSRLFDMPCDETLCSADSFCVNDYTWGGSRCQ  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  MSISNPKTISRLIPPTSASLPVTTVAPQPIPIQRKGKNGVAIMSRLFDMPCDETLCSADSFCVNDYTWGGSRCQ  370

Query  371  CTLGKGGESCSEDIVIQYPQFFGHSYVTFEPLKNSYQAFQITLEFRAEAEDGLLLYCGENEHGRGDFMSLAIIR  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTLGKGGESCSEDIVIQYPQFFGHSYVTFEPLKNSYQAFQITLEFRAEAEDGLLLYCGENEHGRGDFMSLAIIR  444

Query  445  RSLQFRFNCGTGVAIIVSETKIKLGGWHMVMLYRDGLNGLLQLNNGTPVTGQSQGQYSKITFRTPLYLGGAPSA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  RSLQFRFNCGTGVAIIVSETKIKLGGWHTVMLYRDGLNGLLQLNNGTPVTGQSQGQYSKITFRTPLYLGGAPSA  518

Query  519  YWLVRATGTNRGFQGCVQSLAVNGRRIDMRPWPLGKALSGADVGECSSGICDEASCIHGGTCTAIKADSYICLC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  YWLVRATGTNRGFQGCVQSLAVNGRRIDMRPWPLGKALSGADVGECSSGICDEASCIHGGTCTAIKADSYICLC  592

Query  593  PLGFKGRHCEDAFTLTIPQFRESLRSYAATPWPLEPQHYLSFMEFEITFRPDSGDGVLLYSYDTGSKDFLSINL  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  PLGFKGRHCEDAFTLTIPQFRESLRSYAATPWPLEPQHYLSFMEFEITFRPDSGDGVLLYSYDTGSKDFLSINL  666

Query  667  AGGHVEFRFDCGSGTGVLRSEDPLTLGNWHELRVSRTAKNGILQVDKQKIVEGMAEGGFTQIKCNTDIFIGGVP  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGHVEFRFDCGSGTGVLRSEDPLTLGNWHELRVSRTAKNGILQVDKQKIVEGMAEGGFTQIKCNTDIFIGGVP  740

Query  741  NYDDVKKNSGVLKPFSGSIQKIILNDRTIHVKHDFTSGVNVENAAHPCVRAPCAHGGSCRPRKEGYDCDCPLGF  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  NYDDVKKNSGVLKPFSGSIQKIILNDRTIHVKHDFTSGVNVENAAHPCVRAPCAHGGSCRPRKEGYDCDCPLGF  814

Query  815  EGLHCQK--------AIIEAIEIPQFIGRSYLTYDNPDILKRVSGSRSNVFMRFKTTAKDGLLLWRGDSPMRPN  880
            |||||||        .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  EGLHCQKECGNYCLNTIIEAIEIPQFIGRSYLTYDNPDILKRVSGSRSNVFMRFKTTAKDGLLLWRGDSPMRPN  888

Query  881  SDFISLGLRDGALVFSYNLGSGVASIMVNGSFNDGRWHRVKAVRDGQSGKITVDDYGARTGKSPGMMRQLNING  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  SDFISLGLRDGALVFSYNLGSGVASIMVNGSFNDGRWHRVKAVRDGQSGKITVDDYGARTGKSPGMMRQLNING  962

Query  955  ALYVGGMKEIALHTNRQYMRGLVGCISHFTLSTDYHISLVEDAVDGKNINTCGAK  1009
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ALYVGGMKEIALHTNRQYMRGLVGCISHFTLSTDYHISLVEDAVDGKNINTCGAK  1017