Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09586
• Subject: NM_001202403.1
• Aligned Length: 1263
• Identities: 1174
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGCCGTTCCTGCACGGCTTCCGGAGGATCATCTTCGAGTACCAGCCGCTGGTGGATGCGATTCTGGGCTCCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGTTCCTGCACGGCTTCCGGAGGATCATCTTCGAGTACCAGCCGCTGGTGGATGCGATTCTGGGCTCCCT  74

Query   75  GGGGATCCAGGACCCCGAGCGGCAGGAGTCTCTGGACCGGCCCAGTTATGTCGCCAGCGAGGAGAGCCGAATCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGGATCCAGGACCCCGAGCGGCAGGAGTCTCTGGACCGGCCCAGTTATGTCGCCAGCGAGGAGAGCCGAATCC  148

Query  149  TTGTTCTCACTGAGCTGCTGGAGAGGAAAGCCCACTCTCCCTTTTACCAGGAAGGCGTCAGCAACGCCCTGCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  TTGTTCTCACTGAGCTGCTGGAGAGGAAAGCCCACTCTCCCTTTTACCAGGAAGGCGTGAGCAACGCCCTGCTC  222

Query  223  AAGATGGCTGAGCTGGGGCTGACGCGGGCGGCCGACGTTCTCTTGCGGCATGGGGCCAATCTCAACTTTGAAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGATGGCTGAGCTGGGGCTGACGCGGGCGGCCGACGTTCTCTTGCGGCATGGGGCCAATCTCAACTTTGAAGA  296

Query  297  CCCAGTCACCTACTACACGGCCTTGCACATCGCCGTCCTGCGGAACCAGCCGGACATGGTGGAGCTGCTGGTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCAGTCACCTACTACACGGCCTTGCACATCGCCGTCCTGCGGAACCAGCCGGACATGGTGGAGCTGCTGGTGC  370

Query  371  ATCACGGGGCCGACGTTAATCGGAGGGACCGGATCCACGAGAGTAGCCCCTTGGACCTGGCCAGCGAGGAGCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCACGGGGCCGACGTTAATCGGAGGGACCGGATCCACGAGAGTAGCCCCTTGGACCTGGCCAGCGAGGAGCCT  444

Query  445  GAGCGCCTGCCCTGCCTGCAGCGCCTCCTGGACCTTGGAGCTGATGTCAATGCCGCTGACAAGCATGGAAAAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  445  GAGCGCCTGCCCTGCCTGCAGCGCCTCCTGGACCTTGGAGCTGATGTCAATGCCGCTGACAAGCAT--------  510

Query  519  TGCTCTGCTCCATGCTCTGGCCAGCAGCGACGGGGTGCAGATCCACAATACTGAGAACATTCGTCTCTTACTGG  592
                                                                                      
Sbjct  511  --------------------------------------------------------------------------  510

Query  593  AAGGAGGGGCAGACGTCAAGGCCACCACCAAAGATGGGGACACAGTGTTCACCTGCATCATCTTCCTGCTTGGT  666
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  -----GGGGCAGACGTCAAGGCCACCACCAAAGATGGGGACACAGTGTTCACCTGCATCATCTTCCTGCTTGGT  579

Query  667  GAGACCGTGGGAGGGGACAAAGAGGAGGCCCAGATGATCAACCGCTTCTGCTTCCAAGTCACACGGCTGCTGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  GAGACCGTGGGAGGGGACAAAGAGGAGGCCCAGATGATCAACCGCTTCTGCTTCCAAGTCACACGGCTGCTGCT  653

Query  741  GGCACACGGGGCCGACCCCAGCGAGTGCCCAGCCCACGAGTCCCTCACCCACATCTGCCTGAAGAGCTTTAAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  GGCACACGGGGCCGACCCCAGCGAGTGCCCAGCCCACGAGTCCCTCACCCACATCTGCCTGAAGAGCTTTAAAC  727

Query  815  TGCACTTCCCTCTCCTGCGCTTCCTCCTGGAGTCCGGAGCTGCCTACAACTGCTCCCTGCACGGTGCGTCCTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  TGCACTTCCCTCTCCTGCGCTTCCTCCTGGAGTCCGGAGCCGCCTACAACTGCTCCCTGCACGGTGCGTCCTGC  801

Query  889  TGGTCTGGCTTTCACATCATCTTTGAGAGGCTCTGTTCCCACCCAGGCTGCACGGAAGACGAGAGCCATGCGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  TGGTCTGGCTTTCACATCATCTTTGAGAGGCTCTGTTCCCACCCAGGCTGCACGGAAGACGAGAGCCATGCGGA  875

Query  963  CCTCCTGCGCAAAGCTGAGACTGTCCTGGATCTCATGGTGACCAACTCTCAGAAACTCCAGCTGCCCGAAAACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  CCTCCTGCGCAAAGCTGAGACTGTCCTGGATCTCATGGTGACCAACTCTCAGAAACTCCAGCTGCCCGAAAACT  949

Query 1037  TCGATATCCACCCTGTGGGCAGCCTGGCGGAAAAGATCCAGGCCCTCCACTTCTCCTTGAGGCAGCTGGAGAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  TCGATATCCACCCTGTGGGCAGCCTGGCGGAAAAGATCCAGGCCCTCCACTTCTCCTTGAGGCAGCTGGAGAGC  1023

Query 1111  TATCCCCCGCCCCTCAAGCACCTGTGCCGTGTGGCCATCCGGCTCTACCTTCAGCCGTGGCCTGTGGATGTGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  TATCCCCCGCCCCTCAAGCACCTGTGCCGTGTGGCCATCCGGCTCTACCTTCAGCCGTGGCCTGTGGATGTGAA  1097

Query 1185  GGTCAAAGCCCTGCCTCTGCCCGACAGGCTGAAGTGGTACCTCCTTAGCGAGCACAGTGGCTCCGTGGAAGATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  GGTCAAAGCCCTGCCTCTGCCCGACAGGCTGAAGTGGTACCTCCTTAGCGAGCACAGTGGCTCCGTGGAAGATG  1171

Query 1259  ACATC  1263
            |||||
Sbjct 1172  ACATC  1176