Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09588
- Subject:
- NM_145298.6
- Aligned Length:
- 1159
- Identities:
- 1008
- Gaps:
- 41
Alignment
Query 1 ATGAATCCACAGATCAGAAATCCGATGGAGCGGATGTATCGAGACACATTCTACGACAACTTTGAAAACGAACC 74
|||||.||.||..|||||||..|..|||||||.|||||||||||||||||||.|.||||||||.|.||...|||
Sbjct 1 ATGAAGCCTCACTTCAGAAACACAGTGGAGCGAATGTATCGAGACACATTCTCCTACAACTTTTATAATAGACC 74
Query 75 CATCCTCTATGGTCGGAGCTACACT-TGGCTGTGCTATGAAGTGAAAATAAAGAGGGGCCGCTCAAATCTCCTT 147
||||||.|.|.|||||| .|||..| |||||||||||.||||||||||.||| |||.|.|||||..|.||.|
Sbjct 75 CATCCTTTCTCGTCGGA-ATACCGTCTGGCTGTGCTACGAAGTGAAAACAAA---GGGTCCCTCAAGGCCCCGT 144
Query 148 TGGGACACAGGGGTCTTTCGAGGCCCGGTACTACCCAAACGTCAGTCGAATCACAGGCAGGAGGTGTATTTCCG 221
|.||||.||..|.|||||||||||| |||||||||.||.
Sbjct 145 TTGGACGCAAAGATCTTTCGAGGCC------------------------------------AGGTGTATTCCCA 182
Query 222 GTTTGAGAACCACGCAGAAATGTGCTTCTTATCTTGGTTCTGTGGCAACCGACTGCCTGCTAACAGGCGCTTCC 295
|..||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|.|.||||
Sbjct 183 GCCTGAGCACCACGCAGAAATGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGGCAACCAGCTGCCTGCTTACAAGTGTTTCC 256
Query 296 AGATCACCTGGTTTGTATCATGGAACCCCTGCCTGCCCTGTGTGGTGAAGGTGACCAAATTCTTGGCTGAGCAC 369
|||||||||||||||||||.||||.||||||||.|..||||||||.||||.||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 257 AGATCACCTGGTTTGTATCCTGGACCCCCTGCCCGGACTGTGTGGCGAAGCTGGCCGAATTCCTGGCTGAGCAC 330
Query 370 CCCAATGTCACCCTGACCATCTCTGCCGCCCGCCTCTACTACTACCGGGATAGAGATTGGCGGTGGGTGCTCCT 443
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||..||..|||.||||..
Sbjct 331 CCCAATGTCACCCTGACCATCTCCGCCGCCCGCCTCTACTACTACTGGGAAAGAGATTACCGAAGGGCGCTCTG 404
Query 444 CAGGCTGCATAAGGCAGGGGCCCGTGTGAAGATCATGGACTATGAAGACTTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTG 517
|||||||..|.|||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 CAGGCTGAGTCAGGCAGGGGCCCGCGTGAAGATTATGGACGATGAAGAATTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTG 478
Query 518 TGTGCAATGAAGGTCAGCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGCATCCCTGCACCGCACGCTA 591
|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 479 TGTACAGTGAAGGTCAGCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGCATTCCTGCACCGCACGCTA 552
Query 592 AAGGAGATTCTCAGAAACCCGATGGAGGCAATGTACCCACACATATTCTACTTCCACTTTAAAAACCTACTGAA 665
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 553 AAGGAGATTCTCAGAAACCCGATGGAGGCAATGTATCCACACATATTCTACTTCCACTTTAAAAACCTACGCAA 626
Query 666 AGCCTGTGGTCGGAACGAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTACAAAGCACCACTCAGCTGTCTTCCGGA 739
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||.|.|||
Sbjct 627 AGCCTATGGTCGGAACGAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTGTAAAGCACCACTCACCTGTCTCCTGGA 700
Query 740 AGAGGGGCGTCTTCCGAAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAGGTGCTTCCTCTCTTGGTTC 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 AGAGGGGCGTCTTCCGAAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAGGTGCTTCCTCTCTTGGTTC 774
Query 814 TGTGACGACATACTGTCTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGAGTG 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 TGTGACGACATACTGTCTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGAGTG 848
Query 888 TGCAGGGGAGGTGGCCGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATCTTCACCGCCCGCCTCTGCT 961
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 849 TGCAGGGGAGGTGGCCGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATCTTCACCGCCCGCCTCTACT 922
Query 962 ATTTCTGGGATACAGATTACCAGGAGGGGCTCTGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGCCTCCGTGAAGATCATGGGC 1035
|.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 923 ACTTCTGGGATACAGATTACCAGGAGGGGCTCCGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGCCTCCGTGGAGATCATGGGC 996
Query 1036 TACAAAGATTTTGTATCTTGTTGGAAAAACTTTGTGTACAGTGATGATGAGCCATTCAAGCCTTGGAAGGGACT 1109
||||||||||||..||.|||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 997 TACAAAGATTTTAAATATTGTTGGGAAAACTTTGTGTACAATGATGATGAGCCATTCAAGCCTTGGAAAGGACT 1070
Query 1110 ACAAACCAACTTTCGACTTCTGAAAAGAAGGCTACGGGAGATTCTCCAG 1158
|.||..||||||||.|.|.|||.|.||.|.|||.|.||||||||||.||
Sbjct 1071 AAAATACAACTTTCTATTCCTGGACAGCAAGCTGCAGGAGATTCTCGAG 1119