Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09611
• Subject: XM_011537966.2
• Aligned Length: 2733
• Identities: 2595
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGGAGGTAAATTGTTTAACACTAAAAGACCTGATCAGCCCCAGGCAGCCCAGACTAGATTTTGCAGTTGAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGTAAATTGTTTAACACTAAAAGACCTGATCAGCCCCAGGCAGCCCAGACTAGATTTTGCAGTTGAAGA  74

Query   75  TGGGGAAAATGCACAAAAGGAAAATATATTTGTTGATCGATCAAGGATGGCCCCGAAGACTCCAATAAAAAATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGGGAAAATGCACAAAAGGAAAATATATTTGTTGATCGATCAAGGATGGCCCCGAAGACTCCAATAAAAAATG  148

Query  149  AACCAATTGATTTATCGAAGCAAAAAAAATTTACTCCAGAAAGAAATCCCATTACTCCAGTTAAGCTTGTTGAC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  149  AACCAATTGATTTATCGAAGCAAAAAAAATTTACTCCAGAAAGAAATCCCATTACTCCAGTTAAGTTTGTTGAC  222

Query  223  AGACAGCAAGCGGAACCATGGACACCCACAGCTAACCTGAAGATGCTCATTAGTGCTGCCAGCCCAGATATAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGACAGCAAGCGGAACCATGGACACCCACAGCTAACCTGAAGATGCTCATTAGTGCTGCCAGCCCAGATATAAG  296

Query  297  GGACCGGGAGAAGAAAAAGGGACTATTCCGACCCATTGAAAACAAGGACGATGCATTTACAGATTCTCTACAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACCGGGAGAAGAAAAAGGGACTATTCCGACCCATTGAAAACAAGGACGATGCATTTACAGATTCTCTACAGC  370

Query  371  TTGATGTTGTTGGGGACAGTGCTGTGGACGAATTTGAAAAGCAAAGGCCAAGCAGAAAACAGAAAAGTTTAGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGATGTTGTTGGGGACAGTGCTGTGGACGAATTTGAAAAGCAAAGGCCAAGCAGAAAACAGAAAAGTTTAGGA  444

Query  445  CTCCTGTGCCAGAAGTTTCTAGCTCGCTATCCAAGTTATCCCTTGTCAACTGAGAAAACTACCATCTCCCTAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCCTGTGCCAGAAGTTTCTAGCTCGCTATCCAAGTTATCCCTTGTCAACTGAGAAAACTACCATCTCCCTAGA  518

Query  519  TGAAGTTGCTGTCAGTCTTGGTGTGGAAAGGAGACGCATCTATGACATTGTAAATGTGCTGGAGTCGCTGCATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAGTTGCTGTCAGTCTTGGTGTGGAAAGGAGACGCATCTATGACATTGTAAATGTGCTGGAGTCGCTGCATC  592

Query  593  TGGTCAGCCGGGTGGCTAAGAATCAGTATGGCTGGCATGGACGGCACAGCCTGCCAAAAACCCTGAGGAACCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGTCAGCCGGGTGGCTAAGAATCAGTATGGCTGGCATGGACGGCACAGCCTGCCAAAAACCCTGAGGAACCTC  666

Query  667  CAGAGACTAGGAGAGGAGCAGAAATATGAAGAGCAAATGGCCTACCTCCAACAGAAAGAGCTGGACCTGATAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGAGACTAGGAGAGGAGCAGAAATATGAAGAGCAAATGGCCTACCTCCAACAGAAAGAGCTGGACCTGATAGA  740

Query  741  TTATAAATTTGGAGAACGTAAAAAAGATGGTGATCCAGATTCCCAGGAACAACAGTTACTGGATTTCTCTGAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTATAAATTTGGAGAACGTAAAAAAGATGGTGATCCAGATTCCCAGGAACAACAGTTACTGGATTTCTCTGAAC  814

Query  815  CCGACTGTCCCTCTTCATCTGCAAACAGTAGAAAAGACAAGTCTCTGAGAATTATGAGCCAGAAGTTTGTCATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCGACTGTCCCTCTTCATCTGCAAACAGTAGAAAAGACAAGTCTCTGAGAATTATGAGCCAGAAGTTTGTCATG  888

Query  889  CTGTTCCTCGTCTCCAAAACCAAGATTGTCACTCTGGATGTGGCTGCCAAAATACTGATAGAAGAAAGCCAAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTTCCTCGTCTCCAAAACCAAGATTGTCACTCTGGATGTGGCTGCCAAAATACTGATAGAAGAAAGCCAAGA  962

Query  963  TGCCCCGGACCATAGTAAATTTAAAACAAAGGTACGACGCCTCTATGACATAGCCAATGTTCTGACCAGCTTGG  1036
            ||||||.|||||||||||||||||||                                                
Sbjct  963  TGCCCCAGACCATAGTAAATTTAAAA------------------------------------------------  988

Query 1037  CTCTGATAAAGAAAGTGCATGTAACAGAAGAGCGAGGTCGTAAACCAGCCTTCAAGTGGATCGGGCCTGTGGAC  1110
                                                                                      
Sbjct  989  --------------------------------------------------------------------------  988

Query 1111  TTCAGCTCAAGTGATGAAGAACTGGTGGATGTTTCTGCATCTGTCTTACCAGAATTGAAAAGAGAAACATATGG  1184
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  989  -------------ATGAAGAACTGGTGGATGTTTCTGCATCTGTCTTACCAGAATTGAAAAGAGAAACATATGG  1049

Query 1185  CCAGATTCAAGTCTGTGCAAAACAGAAGCTGGCTCGCCATGGTTCTTTTAACACAGTTCAGGCTTCTGAGAGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050  CCAGATTCAAGTCTGTGCAAAACAGAAGCTGGCTCGCCATGGTTCTTTTAACACAGTTCAGGCTTCTGAGAGGA  1123

Query 1259  TCCAGAGGAAAGTGAACTCAGAACCGAGCAGCCCGTACAGAGAAGAACAAGGATCAGGTGGCTACTCTTTAGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124  TCCAGAGGAAAGTGAACTCAGAACCGAGCAGCCCGTACAGAGAAGAACAAGGATCAGGTGGCTACTCTTTAGAA  1197

Query 1333  ATTGGAAGCCTGGCAGCTGTCTATAGACAGAAAATAGAAGACAATTCACAGGGAAAAGCCTTTGCCAGTAAGAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198  ATTGGAAGCCTGGCAGCTGTCTATAGACAGAAAATAGAAGACAATTCACAGGGAAAAGCCTTTGCCAGTAAGAG  1271

Query 1407  AGTGGTGCCTCCATCAAGCAGCTTGGACCCTGTTGCTCCTTTCCCTGTCCTCTCTGTTGACCCAGAATATTGTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1272  AGTGGTGCCTCCATCAAGCAGCTTGGACCCTGTTGCTCCTTTCCCTGTCCTCTCTGTTGACCCAGAATATTGTG  1345

Query 1481  TTAATCCTTTAGCCCACCCAGTATTTTCTGTTGCTCAGACGGACCTGCAGGCATTCTCCATGCAGAACGGTCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1346  TTAATCCTTTAGCCCACCCAGTATTTTCTGTTGCTCAGACGGACCTGCAGGCATTCTCCATGCAGAACGGTCTG  1419

Query 1555  AATGGACAAGTGGATGTCTCACTTGCTTCTGCAGCCTCTGCTGTGGAGAGCCTGAAGCCAGCACTCCTTGCTGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1420  AATGGACAAGTGGATGTCTCACTTGCTTCTGCAGCCTCTGCTGTGGAGAGCCTGAAGCCAGCACTCCTTGCTGG  1493

Query 1629  CCAGCCTCTAGTGTATGTGCCCTCTGCCTCACTGTTCATGCTGTATGGAAGTCTGCAGGAGGGACCAGCGTCAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494  CCAGCCTCTAGTGTATGTGCCCTCTGCCTCACTGTTCATGCTGTATGGAAGTCTGCAGGAGGGACCAGCGTCAG  1567

Query 1703  GGTCAGGGTCAGAGAGGGATGACAGAAGCTCAGAAGCCCCAGCCACAGTAGAGCTGTCATCTGCACCCTCAGCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1568  GGTCAGGGTCAGAGAGGGATGACAGAAGCTCAGAAGCCCCAGCCACAGTAGAGCTGTCATCTGCACCCTCAGCT  1641

Query 1777  CAGAAGCGCCTCTGTGAGGAGAGGAAACCTCAGGAGGAGGATGAGCCAGCCACTAAAAGGCAAAGTAGGGAATA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1642  CAGAAGCGCCTCTGTGAGGAGAGGAAACCTCAGGAGGAGGATGAGCCAGCCACTAAAAGGCAAAGTAGGGAATA  1715

Query 1851  TGAAGACGGCCCGCTGTCGCTTGTCATGCCCAAGAAACCCTCAGATTCCACAGACCTTGCCTCTCCCAAGACTA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1716  TGAAGACGGCCCGCTGTCGCTTGTCATGCCCAAGAAACCCTCAGATTCCACAGACCTTGCCTCTCCCAAGACTA  1789

Query 1925  TGGGTAACAGGGCATCTATACCCCTCAAAGACATTCATGTGAATGGCCAACTCCCTGCTGCAGAAGAGATTTCA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1790  TGGGTAACAGGGCATCTATACCCCTCAAAGACATTCATGTGAATGGCCAACTCCCTGCTGCAGAAGAGATTTCA  1863

Query 1999  GGAAAGGCAACAGCAAACTCTCTTGTTTCTTCTGAGTGGGGAAATCCTTCAAGAAATACAGATGTTGAAAAGCC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1864  GGAAAGGCAACAGCAAACTCTCTTGTTTCTTCTGAGTGGGGAAATCCTTCAAGAAATACAGATGTTGAAAAGCC  1937

Query 2073  TTCAAAAGAAAATGAAAGCACCAAAGAGCCTTCTTTGCTACAATATCTTTGTGTGCAGTCTCCTGCAGGATTAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1938  TTCAAAAGAAAATGAAAGCACCAAAGAGCCTTCTTTGCTACAATATCTTTGTGTGCAGTCTCCTGCAGGATTAA  2011

Query 2147  ATGGTTTCAATGTACTTTTATCTGGCAGTCAAACCCCCCCTACTGTGGGCCCGTCCTCAGGTCAGCTGCCGTCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2012  ATGGTTTCAATGTACTTTTATCTGGCAGTCAAACCCCCCCTACTGTGGGCCCGTCCTCAGGTCAGCTGCCGTCT  2085

Query 2221  TTCAGTGTCCCTTGCATGGTCTTACCATCTCCACCTCTGGGCCCTTTTCCTGTTCTCTATTCTCCTGCAATGCC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2086  TTCAGTGTCCCTTGCATGGTCTTACCATCTCCACCTCTGGGCCCTTTTCCTGTTCTCTATTCTCCTGCAATGCC  2159

Query 2295  GGGCCCGGTTTCTTCTACTCTTGGTGCTCTCCCAAACACAGGACCTGTGAATTTCAGCTTGCCTGGCCTTGGAT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160  GGGCCCGGTTTCTTCTACTCTTGGTGCTCTCCCAAACACAGGACCTGTGAATTTCAGCTTGCCTGGCCTTGGAT  2233

Query 2369  CAATAGCCCAGCTTCTCGTCGGCCCCACAGCTGTGGTTAATCCAAAGTCGTCCACACTCCCTTCTGCAGACCCT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2234  CAATAGCCCAGCTTCTCGTCGGCCCCACAGCTGTGGTTAATCCAAAGTCGTCCACACTCCCTTCTGCAGACCCT  2307

Query 2443  CAGCTTCAGAGTCAGCCCTCACTAAACCTAAGTCCAGTGATGTCAAGGTCACACAGTGTCGTCCAACAACCTGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2308  CAGCTTCAGAGTCAGCCCTCACTAAACCTAAGTCCAGTGATGTCAAGGTCACACAGTGTCGTCCAACAACCTGA  2381

Query 2517  GTCCCCCGTTTACGTGGGACATCCAGTCTCAGTAGTAAAATTACATCAGTCACCAGTTCCAGTGACCCCCAAGA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2382  GTCCCCCGTTTACGTGGGACATCCAGTCTCAGTAGTAAAATTACATCAGTCACCAGTTCCAGTGACCCCCAAGA  2455

Query 2591  GCATCCAACGCACACATCGTGAGACGTTTTTCAAGACACCCGGCAGCCTTGGAGACCCTGTCCTGAAGAGAAGA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2456  GCATCCAACGCACACATCGTGAGACGTTTTTCAAGACACCCGGCAGCCTTGGAGACCCTGTCCTGAAGAGAAGA  2529

Query 2665  GAAAGGAACCAGTCACGAAACACCAGCTCGGCCCAGAGGAGACTAGAAATCCCCAGAGGCGGCGCTGAC  2733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2530  GAAAGGAACCAGTCACGAAACACCAGCTCGGCCCAGAGGAGACTAGAAATCCCCAGCGGCGGCGCTGAC  2598