Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09611
- Subject:
- XM_011537969.2
- Aligned Length:
- 2776
- Identities:
- 2385
- Gaps:
- 389
Alignment
Query 1 ATGGAGGTAAATTGTTTAACACTAAAAGACCTGATCAGCCCCAGGCAGCCCAGACTAGATTTTGCAGTTGAAGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGGGGAAAATGCACAAAAGGAAAATATATTTGTTGATCGATCAAGGATGGCCCCGAAGACTCCAATAAAAAATG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AACCAATTGATTTATCGAAGCAAAAAAAATTTACTCCAGAAAGAAATCCCATTACTCCAGTTAAGCTTGTTGAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AGACAGCAAGCGGAACCATGGACACCCACAGCTAACCTGAAGATGCTCATTAGTGCTGCCAGCCCAGATATAAG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGACCGGGAGAAGAAAAAGGGACTATTCCGACCCATTGAAAACAAGGACGATGCATTTACAGATTCTCTAC--- 367
|||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------ATGCATTTACAGATTCTCTACAGG 24
Query 368 ----------------------------------------AGCTTGATGTTGTTGGGGACAGTGCTGTGGACGA 401
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 GTAATGTTTTTTGTGTCTGAAGAAGCTCTTCCCTATTCCAAGCTTGATGTTGTTGGGGACAGTGCTGTGGACGA 98
Query 402 ATTTGAAAAGCAAAGGCCAAGCAGAAAACAGAAAAGTTTAGGACTCCTGTGCCAGAAGTTTCTAGCTCGCTATC 475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 ATTTGAAAAGCAAAGGCCAAGCAGAAAACAGAAAAGTTTAGGACTCCTGTGCCAGAAGTTTCTAGCTCGCTATC 172
Query 476 CAAGTTATCCCTTGTCAACTGAGAAAACTACCATCTCCCTAGATGAAGTTGCTGTCAGTCTTGGTGTGGAAAGG 549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173 CAAGTTATCCCTTGTCAACTGAGAAAACTACCATCTCCCTAGATGAAGTTGCTGTCAGTCTTGGTGTGGAAAGG 246
Query 550 AGACGCATCTATGACATTGTAAATGTGCTGGAGTCGCTGCATCTGGTCAGCCGGGTGGCTAAGAATCAGTATGG 623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 247 AGACGCATCTATGACATTGTAAATGTGCTGGAGTCGCTGCATCTGGTCAGCCGGGTGGCTAAGAATCAGTATGG 320
Query 624 CTGGCATGGACGGCACAGCCTGCCAAAAACCCTGAGGAACCTCCAGAGACTAGGAGAGGAGCAGAAATATGAAG 697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321 CTGGCATGGACGGCACAGCCTGCCAAAAACCCTGAGGAACCTCCAGAGACTAGGAGAGGAGCAGAAATATGAAG 394
Query 698 AGCAAATGGCCTACCTCCAACAGAAAGAGCTGGACCTGATAGATTATAAATTTGGAGAACGTAAAAAAGATGGT 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 AGCAAATGGCCTACCTCCAACAGAAAGAGCTGGACCTGATAGATTATAAATTTGGAGAACGTAAAAAAGATGGT 468
Query 772 GATCCAGATTCCCAGGAACAACAGTTACTGGATTTCTCTGAACCCGACTGTCCCTCTTCATCTGCAAACAGTAG 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 GATCCAGATTCCCAGGAACAACAGTTACTGGATTTCTCTGAACCCGACTGTCCCTCTTCATCTGCAAACAGTAG 542
Query 846 AAAAGACAAGTCTCTGAGAATTATGAGCCAGAAGTTTGTCATGCTGTTCCTCGTCTCCAAAACCAAGATTGTCA 919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543 AAAAGACAAGTCTCTGAGAATTATGAGCCAGAAGTTTGTCATGCTGTTCCTCGTCTCCAAAACCAAGATTGTCA 616
Query 920 CTCTGGATGTGGCTGCCAAAATACTGATAGAAGAAAGCCAAGATGCCCCGGACCATAGTAAATTTAAAACAAAG 993
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 CTCTGGATGTGGCTGCCAAAATACTGATAGAAGAAAGCCAAGATGCCCCAGACCATAGTAAATTTAAAACAAAG 690
Query 994 GTACGACGCCTCTATGACATAGCCAATGTTCTGACCAGCTTGGCTCTGATAAAGAAAGTGCATGTAACAGAAGA 1067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 GTACGACGCCTCTATGACATAGCCAATGTTCTGACCAGCTTGGCTCTGATAAAGAAAGTGCATGTAACAGAAGA 764
Query 1068 GCGAGGTCGTAAACCAGCCTTCAAGTGGATCGGGCCTGTGGACTTCAGCTCAAGTGATGAAGAACTGGTGGATG 1141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765 GCGAGGTCGTAAACCAGCCTTCAAGTGGATCGGGCCTGTGGACTTCAGCTCAAGTGATGAAGAACTGGTGGATG 838
Query 1142 TTTCTGCATCTGTCTTACCAGAATTGAAAAGAGAAACATATGGCCAGATTCAAGTCTGTGCAAAACAGAAGCTG 1215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 TTTCTGCATCTGTCTTACCAGAATTGAAAAGAGAAACATATGGCCAGATTCAAGTCTGTGCAAAACAGAAGCTG 912
Query 1216 GCTCGCCATGGTTCTTTTAACACAGTTCAGGCTTCTGAGAGGATCCAGAGGAAAGTGAACTCAGAACCGAGCAG 1289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 913 GCTCGCCATGGTTCTTTTAACACAGTTCAGGCTTCTGAGAGGATCCAGAGGAAAGTGAACTCAGAACCGAGCAG 986
Query 1290 CCCGTACAGAGAAGAACAAGGATCAGGTGGCTACTCTTTAGAAATTGGAAGCCTGGCAGCTGTCTATAGACAGA 1363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 987 CCCGTACAGAGAAGAACAAGGATCAGGTGGCTACTCTTTAGAAATTGGAAGCCTGGCAGCTGTCTATAGACAGA 1060
Query 1364 AAATAGAAGACAATTCACAGGGAAAAGCCTTTGCCAGTAAGAGAGTGGTGCCTCCATCAAGCAGCTTGGACCCT 1437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061 AAATAGAAGACAATTCACAGGGAAAAGCCTTTGCCAGTAAGAGAGTGGTGCCTCCATCAAGCAGCTTGGACCCT 1134
Query 1438 GTTGCTCCTTTCCCTGTCCTCTCTGTTGACCCAGAATATTGTGTTAATCCTTTAGCCCACCCAGTATTTTCTGT 1511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 GTTGCTCCTTTCCCTGTCCTCTCTGTTGACCCAGAATATTGTGTTAATCCTTTAGCCCACCCAGTATTTTCTGT 1208
Query 1512 TGCTCAGACGGACCTGCAGGCATTCTCCATGCAGAACGGTCTGAATGGACAAGTGGATGTCTCACTTGCTTCTG 1585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1209 TGCTCAGACGGACCTGCAGGCATTCTCCATGCAGAACGGTCTGAATGGACAAGTGGATGTCTCACTTGCTTCTG 1282
Query 1586 CAGCCTCTGCTGTGGAGAGCCTGAAGCCAGCACTCCTTGCTGGCCAGCCTCTAGTGTATGTGCCCTCTGCCTCA 1659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1283 CAGCCTCTGCTGTGGAGAGCCTGAAGCCAGCACTCCTTGCTGGCCAGCCTCTAGTGTATGTGCCCTCTGCCTCA 1356
Query 1660 CTGTTCATGCTGTATGGAAGTCTGCAGGAGGGACCAGCGTCAGGGTCAGGGTCAGAGAGGGATGACAGAAGCTC 1733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1357 CTGTTCATGCTGTATGGAAGTCTGCAGGAGGGACCAGCGTCAGGGTCAGGGTCAGAGAGGGATGACAGAAGCTC 1430
Query 1734 AGAAGCCCCAGCCACAGTAGAGCTGTCATCTGCACCCTCAGCTCAGAAGCGCCTCTGTGAGGAGAGGAAACCTC 1807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1431 AGAAGCCCCAGCCACAGTAGAGCTGTCATCTGCACCCTCAGCTCAGAAGCGCCTCTGTGAGGAGAGGAAACCTC 1504
Query 1808 AGGAGGAGGATGAGCCAGCCACTAAAAGGCAAAGTAGGGAATATGAAGACGGCCCGCTGTCGCTTGTCATGCCC 1881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1505 AGGAGGAGGATGAGCCAGCCACTAAAAGGCAAAGTAGGGAATATGAAGACGGCCCGCTGTCGCTTGTCATGCCC 1578
Query 1882 AAGAAACCCTCAGATTCCACAGACCTTGCCTCTCCCAAGACTATGGGTAACAGGGCATCTATACCCCTCAAAGA 1955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1579 AAGAAACCCTCAGATTCCACAGACCTTGCCTCTCCCAAGACTATGGGTAACAGGGCATCTATACCCCTCAAAGA 1652
Query 1956 CATTCATGTGAATGGCCAACTCCCTGCTGCAGAAGAGATTTCAGGAAAGGCAACAGCAAACTCTCTTGTTTCTT 2029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1653 CATTCATGTGAATGGCCAACTCCCTGCTGCAGAAGAGATTTCAGGAAAGGCAACAGCAAACTCTCTTGTTTCTT 1726
Query 2030 CTGAGTGGGGAAATCCTTCAAGAAATACAGATGTTGAAAAGCCTTCAAAAGAAAATGAAAGCACCAAAGAGCCT 2103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1727 CTGAGTGGGGAAATCCTTCAAGAAATACAGATGTTGAAAAGCCTTCAAAAGAAAATGAAAGCACCAAAGAGCCT 1800
Query 2104 TCTTTGCTACAATATCTTTGTGTGCAGTCTCCTGCAGGATTAAATGGTTTCAATGTACTTTTATCTGGCAGTCA 2177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 TCTTTGCTACAATATCTTTGTGTGCAGTCTCCTGCAGGATTAAATGGTTTCAATGTACTTTTATCTGGCAGTCA 1874
Query 2178 AACCCCCCCTACTGTGGGCCCGTCCTCAGGTCAGCTGCCGTCTTTCAGTGTCCCTTGCATGGTCTTACCATCTC 2251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1875 AACCCCCCCTACTGTGGGCCCGTCCTCAGGTCAGCTGCCGTCTTTCAGTGTCCCTTGCATGGTCTTACCATCTC 1948
Query 2252 CACCTCTGGGCCCTTTTCCTGTTCTCTATTCTCCTGCAATGCCGGGCCCGGTTTCTTCTACTCTTGGTGCTCTC 2325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1949 CACCTCTGGGCCCTTTTCCTGTTCTCTATTCTCCTGCAATGCCGGGCCCGGTTTCTTCTACTCTTGGTGCTCTC 2022
Query 2326 CCAAACACAGGACCTGTGAATTTCAGCTTGCCTGGCCTTGGATCAATAGCCCAGCTTCTCGTCGGCCCCACAGC 2399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2023 CCAAACACAGGACCTGTGAATTTCAGCTTGCCTGGCCTTGGATCAATAGCCCAGCTTCTCGTCGGCCCCACAGC 2096
Query 2400 TGTGGTTAATCCAAAGTCGTCCACACTCCCTTCTGCAGACCCTCAGCTTCAGAGTCAGCCCTCACTAAACCTAA 2473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097 TGTGGTTAATCCAAAGTCGTCCACACTCCCTTCTGCAGACCCTCAGCTTCAGAGTCAGCCCTCACTAAACCTAA 2170
Query 2474 GTCCAGTGATGTCAAGGTCACACAGTGTCGTCCAACAACCTGAGTCCCCCGTTTACGTGGGACATCCAGTCTCA 2547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2171 GTCCAGTGATGTCAAGGTCACACAGTGTCGTCCAACAACCTGAGTCCCCCGTTTACGTGGGACATCCAGTCTCA 2244
Query 2548 GTAGTAAAATTACATCAGTCACCAGTTCCAGTGACCCCCAAGAGCATCCAACGCACACATCGTGAGACGTTTTT 2621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2245 GTAGTAAAATTACATCAGTCACCAGTTCCAGTGACCCCCAAGAGCATCCAACGCACACATCGTGAGACGTTTTT 2318
Query 2622 CAAGACACCCGGCAGCCTTGGAGACCCTGTCCTGAAGAGAAGAGAAAGGAACCAGTCACGAAACACCAGCTCGG 2695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2319 CAAGACACCCGGCAGCCTTGGAGACCCTGTCCTGAAGAGAAGAGAAAGGAACCAGTCACGAAACACCAGCTCGG 2392
Query 2696 CCCAGAGGAGACTAGAAATCCCCAGAGGCGGCGCTGAC 2733
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2393 CCCAGAGGAGACTAGAAATCCCCAGCGGCGGCGCTGAC 2430