Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09683
• Subject: XM_011533419.2
• Aligned Length: 2145
• Identities: 1484
• Gaps: 660

Alignment

Query    1  ATGGCAGCAGATGAAAGCTCACAGAACACTTTGCGGCTCCAGTTCAAGGCAATGCAGGAGATGCAGCACAAACG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTTACAGAAGCAGATGGAGAAAAAGAGGGAAAAAGAACTGAGCCTCAAAAGCAGAGCTGACGACCAAGAGGAGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCTTGGAGGTTTCAGATGGCCTCAGCCTTCTCCACGCAGGGGAGCCAAACTCGAAAAATAGCTTTGAGAAGAGG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTGCTTGAAGATGAGATTGAACACCTTCGAAATGAGCTCAGGGAAACGGTGGACGAGAACGGGCGATTGTATAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GCTGCTGAAGGAAAGGGACTTTGAAATCAAACACCTCAAAAAGAAAATAGAAGAGGACAGATTTGCCTTCACAG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GGACAGCCGGTGTAGCCGGAGACGTGGTCGCCACCAAAATTGTGGAGCTATCAAAAAAGAACCGGCTGTTGATG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GCAGAATCAGAGGGTGCAAAAACCAGGGTGAAGCAGCTGACCAATCGCATCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTGCA  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  GACAGCCCTGACCAGGCTGTCAGCCAAGGGGGCCACCGACGCAGGAGCCAAGCCACCGAGGGCCCAGATGGGAG  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  ACAGAGCATTGCTGGAGACCCCAGAGGTGAAGGCCCTGCAGGACAGGCTGGTGGCCACCAACTTGAAGATGAGT  666
                                                                                ||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------ATGAGT  6

Query  667  GACCTCCGAAACCAGATCCAGTCTGTGAAGCAGGAGCTGCGGATGGCACAGAAGGTTTTGGCCAGAGAGGTTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    7  GACCTCCGAAACCAGATCCAGTCTGTGAAGCAGGAGCTGCGGATGGCACAGAAGGTTTTGGCCAGAGAGGTTGG  80

Query  741  GGAAGACATCAACGTTCAGCAGCTCCTATCTTCGCCAGGGACCTGGAGGGGTCGGGCTCAACAAATTCTTGTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   81  GGAAGACATCAACGTTCAGCAGCTCCTATCTTCGCCAGGGACCTGGAGGGGTCGGGCTCAACAAATTCTTGTTT  154

Query  815  TGCAGAGCAAGGTTCAAGAGCTTGAGAAGCAATTGGGCCAGGCCCGGAGCCAGTCTGCGGGAACAGCCAGTGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  155  TGCAGAGCAAGGTTCAAGAGCTTGAGAAGCAATTGGGCCAGGCCCGGAGCCAGTCTGCGGGAACAGCCAGTGAT  228

Query  889  GAGTTGTCTGTCTATCCAGACCCAAGGAAGCTGTCGGCACAGGAGAAAAACCTGCTGAGGATCCGCAGCCTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  229  GAGTTGTCTGTCTATCCAGACCCAAGGAAGCTGTCGGCACAGGAGAAAAACCTGCTGAGGATCCGCAGCCTGGA  302

Query  963  AAGGGAAAAACAGGAAGGCTTGGAGAAACTTGCCAGTGAACGGGATGTCCTCCAGAGAGAGCTTGAAGAGCTAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  303  AAGGGAAAAACAGGAAGGCTTGGAGAAACTTGCCAGTGAACGGGATGTCCTCCAGAGAGAGCTTGAAGAGCTAA  376

Query 1037  AAAAGAAGTTCGAGGGCATGAGGTCTCGGAACAAGCTGCTGTCAAGTGAGATGAAGACCCTCAAGAGTCAGATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  377  AAAAGAAGTTCGAGGGCATGAGGTCTCGGAACAAGCTGCTGTCAAGTGAGATGAAGACCCTCAAGAGTCAGATG  450

Query 1111  GGAACCCTGGTGGTGAAGGGCCGGCATGATGACGAGCTCATCGACGCCCTCATGGACCAGCTGAAGCAGCTACA  1184
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  451  GGAACCCTGGTGGAGAAGGGCCGGCATGATGACGAGCTCATCGACGCCCTCATGGACCAGCTGAAGCAGCTACA  524

Query 1185  GGAGATCCTAGGCAGCCTGAGTCTGCAGGAGGAGAAAACGCGAGTGTCCCAGCACCACCTGGACCAGCAACTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  525  GGAGATCCTAGGCAGCCTGAGTCTGCAGGAGGAGAAAACGCGAGTGTCCCAGCACCACCTGGACCAGCAACTGA  598

Query 1259  ACAGCGAGGCTCAGCGGAGCAACAGCCTAGTCGCCCAGCTGCAGGCCATGGTAGCTGAGCGGGAGGCCAAAGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  599  ACAGCGAGGCTCAGCGGAGCAACAGCCTAGTCGCCCAGCTGCAGGCCATGGTAGCTGAGCGGGAGGCCAAAGTG  672

Query 1333  CGACAGCTGGAGATGGAGATCGGACAACTCAATGTGCACTATCTTCGGAATAAAGGAGTGGGTGAGGGGTCCAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  673  CGACAGCTGGAGATGGAGATCGGACAACTCAATGTGCACTATCTTCGGAATAAAGGAGTGGGTGAGGGGTCCAG  746

Query 1407  TGGCCGCGAGGTCAGCCCTGCCTATACCCAGTTCCTGGAGGACCCAGGCCTGACCAAGTCCCCGGCCTCAGCAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  747  TGGCCGCGAGGTCAGCCCTGCCTATACCCAGTTCCTGGAGGACCCAGGCCTGACCAAGTCCCCGGCCTCAGCAG  820

Query 1481  GCGATCATGTTGGCAGGCTTGGATCTTCTCGCTCTGTGACCAGCCTGGGCCACACACTGGTGGAATCTGCTCTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  821  GCGATCATGTTGGCAGGCTTGGATCTTCTCGCTCTGTGACCAGCCTGGGCCACACACTGGTGGAATCTGCTCTC  894

Query 1555  ACGAGGCCTTCCCTGCCCAGTCCCCACAGGACCTCACCTAGGTTCTCGGACTCCCCAGAACAAAAAGGCTGGCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  895  ACGAGGCCTTCCCTGCCCAGTCCCCACAGGACCTCACCTAGGTTCTCGGACTCCCCAGAACAAAAAGGCTGGCA  968

Query 1629  GGCACAAGTGTCAGAGATCAAGGCCCTCTGGCAGGCTGCCGAGGTGGAGCGTGACCGGCTCACCGAGTTTGTCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  969  GGCACAAGTGTCAGAGATCAAGGCCCTCTGGCAGGCTGCCGAGGTGGAGCGTGACCGGCTCACCGAGTTTGTCA  1042

Query 1703  CTGTCCTGCAGAAACGGGTGGAGGAGAGCAACAGCAAGCTCCTGGAGTCAGAGAGGAAGCTGCAGGAGGAGCGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043  CTGTCCTGCAGAAACGGGTGGAGGAGAGCAACAGCAAGCTCCTGGAGTCAGAGAGGAAGCTGCAGGAGGAGCGA  1116

Query 1777  CACCGCACCGTGGTGCTGGAGCAACATCTGGAGAAGATACGCCTGGAGCCAGGGAAGGCATCAGCCTCCCAGAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117  CACCGCACCGTGGTGCTGGAGCAACATCTGGAGAAGATACGCCTGGAGCCAGGGAAGGCATCAGCCTCCCAGAG  1190

Query 1851  AGCAGCTCCCAGGACCAAAACAGGTCTGCCCACCTCTAACAACAGGCACAACCCAACCGGGAGCGAGAAGAAGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191  AGCAGCTCCCAGGACCAAAACAGGTCTGCCCACCTCTAACAACAGGCACAACCCAACCGGGAGCGAGAAGAAGG  1264

Query 1925  ACCCATCCTTTGCCCAGCTCTCCGATGTGCCCGTGGAATCCCAAATGGAAGAGCTGACAACCAGGCTGGCCATC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265  ACCCATCCTTTGCCCAGCTCTCCGATGTGCCCGTGGAATCCCAAATGGAAGAGCTGACAACCAGGCTGGCCATC  1338

Query 1999  CAGGTGGAGGAGAATGAAATGCTAAAGGCTGCCCTGGGCAGTGCCCTGCGGGGAAAGGAGGAGGACTTCCGGAT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339  CAGGTGGAGGAGAATGAAATGCTAAAGGCTGCCCTGGGCAGTGCCCTGCGGGGAAAGGAGGAGGACTTCCGGAT  1412

Query 2073  GTACCATGAGATCCTGGGCCAGGTGAAAAGTGTCTTCCTGCAGGCCCTGCGGCAGCAGAAGACAGGCAAGCAA  2145
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1413  GTACCATGAGATCCTGGGCCAGGTGAAAAGTGTCTTCCTGCAGGCCCTGCGGCAGCAGAAGACAGGCAAGCAA  1485