Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09742
- Subject:
- NM_153081.3
- Aligned Length:
- 1420
- Identities:
- 1135
- Gaps:
- 86
Alignment
Query 1 ATGCCAGCTCCCCAGCGGAAGCACAGGCGTGGAGGCTTCTCTCACAGATGTTTCCCCACCCCGCAGACGGCGAT 74
||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
Query 75 GACCCCCCAGCCCGCCGGACCCCCGGATGGGGGCTGGGGCTGGGTGGTGGCGGCCGCAGCCTTCGCGATAAACG 148
|||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||||
Sbjct 3 GACCCCCAAGCCGGCCGGACCCCCGGACGGGGGCTGGGGCTGGGTGGTGGCGGCCGCAGCATTCGCCGTGAACG 76
Query 149 GGCTGTCCTACGGGCTGCTGCGCTCGCTGGGCCTTGCCTTCCCTGACCTTGCCGAGCACTTTGACCGAAGCGCC 222
||||.|||||||||||..|.|||||.||||||||||||.||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 77 GGCTCTCCTACGGGCTCTTACGCTCCCTGGGCCTTGCCCTCCCCGACCTCGCGGAGCACTTTGAACGAAGCGCC 150
Query 223 CAGGACACTGCGTGGATCAGCGCCCTGGCCCTGGCCGTGCAGCAGGCAGCCAGCCCTGTGGGCAGCGCCCTGAG 296
|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 151 CAGGACACTGCGTGGGTCAGCGCCCTGGCCTTGGCCGTGCAGCAGGCAGCCAGCCCAGTGGGCAGCGCCCTGAG 224
Query 297 CACGCGCTGGGGGGCCCGCCCCGTGGTGATGGTTGGGGGCGTCCTCGCCTCGCTGGGCTTCGTCTTCTCGGCTT 370
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 225 CACTCGCTGGGGGGCACGCCCCGTGGTGATGGTTGGGGGAGTCCTAACCTCGCTTGGCTTGGTCTTCTCGGCTT 298
Query 371 TCGCC---AGCGATCTGCTGCATCTCTACCTCGGCCTGGGCCTCCTCGCTGGCTTTGGTTGGGCCCTGGTGTTC 441
||||| ||| ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.
Sbjct 299 TCGCCCGAAGC---CTCCTGCACCTCTACCTCGGCCTGGGCCTCCTCGCTGGCTCTGGCTGGGCCCTGGTGTTT 369
Query 442 GCCCCCGCCCTAGGCACCCTCTCGCGTTACTTCTCCCGCCGTCGAGTCTTGGCGGTGGGGCTGGCGCTCACCGG 515
|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 370 GCCCCAGCCCTGGGTACCCTCTCTCGGTACTTCTCCCGCCGTCGGGTCTTGGCGGTAGGGTTGGCGCTCACCGG 443
Query 516 CAACGGGGCCTCCTCGCTGCTCCTGGCGCCCGCCTTGCAGCTTCTTCTCGATACTTTCGGCTGGCGGGGCGCTC 589
.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||.||..
Sbjct 444 TAATGGGGCATCCTCGCTGCTCCTGGCACCTGCCTTGCAGTTCCTCCTTGATACTTTCGGCTGGCGGGGTGCCT 517
Query 590 TGCTCCTCCTCGGCGCGATCACCCTCCACCTCACCCCCTGTGGCGCCCTGCTGCTACCCCTGGTCCTTCCTGGA 663
||||||||||.|||||..|||||||.||||||||.||||||||||||.||||...|||..|.|..||..||||.
Sbjct 518 TGCTCCTCCTTGGCGCTGTCACCCTTCACCTCACACCCTGTGGCGCCTTGCTAAGACCTTTAGCTCTCTCTGGT 591
Query 664 GACCCCCCAGCCCCACCGCGTAGTCCCCTAGCTGCCCTCGGCCTGAGTCTGTTCACACGCCGGGCCTTCTCAAT 737
|||||.|..||||||||.||.|..||||||||||||||.|||||..|||||||||..|||||||||||.|||.|
Sbjct 592 GACCCGCTGGCCCCACCTCGCACCCCCCTAGCTGCCCTTGGCCTAGGTCTGTTCAAGCGCCGGGCCTTTTCAGT 665
Query 738 CTTTGCTCTAGGCACAGCCCTGGTTGGGGGCGGGTACTTCGTTCCTTACGTGCACTTGGCTCCCCACGCTTTAG 811
|||||||.|.|||||.|||.||.|.||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||.|||.||.|||||||
Sbjct 666 CTTTGCTTTGGGCACCGCCTTGATCGGGGGCGGATACTTCGTCCCCTACGTTCATTTGGGTCCGCATGCTTTAG 739
Query 812 ACCGGGGCCTGGGGGGATACGGAGCAGCGCTGGTGGTGGCCGTGGCTGCGATGGGGGATGCGGGCGCCCGGCTG 885
|.|..|||.||||.||.||.||.||||||.|.||||||||.||.|||||..||||.|||||..|.|||||..||
Sbjct 740 ATCAAGGCATGGGTGGTTATGGGGCAGCGTTAGTGGTGGCTGTCGCTGCAGTGGGAGATGCCTGTGCCCGATTG 813
Query 886 GTCTGCGGGTGGCTGGCAGACCAAGGCTGGGTGCCCCTCCCGCGGCTGCTGGCCGTATTCGGGGCTCTGACTGG 959
|.|.||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||.||||..||.||.|||.||||||||||
Sbjct 814 GCCAGCGGATGGCTGGCAGACCAGGGCTGGGTGCCCCTTCCGAGGCTTCTGGTGGTGTTTGGGTCTCTGACTGG 887
Query 960 GCTGGGGCTGTGGGTGGTGGGGCTGGTGCCCGTGGTGGGCGGC-GAAGAGAGCTGGGGGGGTCCCCTGCTGGCC 1032
|.|.|||.|....|...||||.||.||||||...||||| |.| ||.|||.|.|||||||.|||.|||||||||
Sbjct 888 GTTAGGGGTACTAGCAATGGGACTAGTGCCCACTGTGGG-GACAGAGGAGGGTTGGGGGGCTCCTCTGCTGGCC 960
Query 1033 GCGGCTGTGGCCTATGGGCTGAGCGCGGGGAGTTACGCCCCGCTGGTTTTCGGTGTACTCCCCGGGCTGGTGGG 1106
||.||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 961 GCTGCTGGGGCCTATGGGCTGAGCGCTGGGAGTTATGCCCCACTGGTTTTCGGTGTGCTCCCGGGGCTGGTGGG 1034
Query 1107 CGTCGGAGGTGTGGTGCAGGCCACAGGGCTGGTGATGATGCTGATGAGCCTCGGGGGGCTCCTGGGCCCTCCCC 1180
|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1035 CATTGGAGGTGTGGTGCAGGCCACAGGGCTGGTGATGATGCTGATGAGCCTCGGGGGACTCCTGGGCCCTCCTC 1108
Query 1181 TGTCAGGCTTCCTAAGGGATGAGACAGGAGACTTCACCGCCTCTTTCCTCCTGTCTGGTTCTTTGATCCTCTCC 1254
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||..|||||||||||..|||...|.|||||.||||||||.
Sbjct 1109 TGTCAGGCTTCCTAAGGGATAAGACAGGAGACTTCAGTGCCTCTTTCCTGGTGTGCAGCTCTTTCATCCTCTCT 1182
Query 1255 GGCAGCTTCATCTACATAGGGTTGCCCAGGGCGCTGCCCTCCTGTGGTCCAGCCTCCCCTCCAGCCACGCCTCC 1328
|||||.|||||||||||.|||.|||||||.||.||.||||||||..||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1183 GGCAGTTTCATCTACATGGGGCTGCCCAGAGCCCTCCCCTCCTGCCGTCCAGCCTCACCTCCAGCAACCCCTCC 1256
Query 1329 CCCAGAGACGGGGGAGCTGCTTCCCGCTCCCCAGGCAGTCT---TGCTGTCCCCAGGAGGCCCTGGCTCCACTC 1399
.|||||||..|||||||||||.||.|.|||.|| ||||| ||||.|||.||||.||..|||||||||..|
Sbjct 1257 ACCAGAGAGAGGGGAGCTGCTCCCAGTTCCACA---AGTCTCCCTGCTTTCCGCAGGGGGTACTGGCTCCATCC 1327
Query 1400 TGGACACCACTTGT 1413
.|||.|||||||||
Sbjct 1328 GGGATACCACTTGT 1341