Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09779
- Subject:
- XM_005251387.4
- Aligned Length:
- 2325
- Identities:
- 2120
- Gaps:
- 201
Alignment
Query 1 ATGATGGTTCAGCGACTGGGACTCATTTCACCTCCAGCAAGCCAGGTCTCTACAGCATGCAACCAGATCAGTCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TAGCTTACAGAGGGCAATGAATGCAGCCAACCTGAATATACCTCCTTCAGATACCAGGTCCCTTATTTCGCGTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGTCTTTGGCGTCCACGACCTTGAGTCTGACGGAAAGTCAGTCGGCCTCAAGCATGAAGCAGGAGTGGTCCCAG 222
|||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------ATGAAGCAGGAGTGGTCCCAG 21
Query 223 GGCTACAGGGCCCTCCCTTCGCTCTCCAACCACGGCTCTCAGAATGGCCTTGATCTAGGGGATCTCCTTAGCCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22 GGCTACAGGGCCCTCCCTTCGCTCTCCAACCACGGCTCTCAGAATGGCCTTGATCTAGGGGATCTCCTTAGCCT 95
Query 297 TCCTCCCGGGACATCCATGTCCAGCAATAGTGTCTCTAACTCATTACCATCCTACCTTTTTGGCACGGAAAGTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96 TCCTCCCGGGACATCCATGTCCAGCAATAGTGTCTCTAACTCATTACCATCCTACCTTTTTGGCACGGAAAGTA 169
Query 371 GCCACTCTCCTTACCCTAGTCCTCGGCACTCATCCACCAGGTCCCACTCGGCCCGCTCCAAGAAGAGAGCGCTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 170 GCCACTCTCCTTACCCTAGTCCTCGGCACTCATCCACCAGGTCCCACTCGGCCCGCTCCAAGAAGAGAGCGCTG 243
Query 445 TCCTTGTCCCCGCTGTCCGATGGCATCGGGATAGATTTCAATACCATCATCCGCACGTCGCCCACGTCCTTGGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 TCCTTGTCCCCGCTGTCCGATGGCATCGGGATAGATTTCAATACCATCATCCGCACGTCGCCCACGTCCTTGGT 317
Query 519 GGCCTACATCAACGGGTCGAGGGCTTCGCCGGCCAACCTGTCCCCGCAGCCGGAGGTCTACGGGCATTTCCTGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 318 GGCCTACATCAACGGGTCGAGGGCTTCGCCGGCCAACCTGTCCCCGCAGCCGGAGGTCTACGGGCATTTCCTGG 391
Query 593 GCGTGCGCGGCAGCTGCATTCCCCAGCCGCGCCCGGTGCCCGGCAGCCAGAAGGGCGTGCTGGTGGCCCCTGGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 392 GCGTGCGCGGCAGCTGCATTCCCCAGCCGCGCCCGGTGCCCGGCAGCCAGAAGGGCGTGCTGGTGGCCCCTGGA 465
Query 667 GGCCTGGCGCTGCCGGCCTACGGCGAGGACGGGGCCCTGGAGCACGAGCGCATGCAACAGCTGGAGCACGGCGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 466 GGCCTGGCGCTGCCGGCCTACGGCGAGGACGGGGCCCTGGAGCACGAGCGCATGCAACAGCTGGAGCACGGCGG 539
Query 741 CCTGCAGCCAGGCCTGGTCAACCACATGGTGGTGCAGCATGGCCTGCCGGGCCCCGACAGCCAGCCGGCCGGCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 540 CCTGCAGCCAGGCCTGGTCAACCACATGGTGGTGCAGCATGGCCTGCCGGGCCCCGACAGCCAGTCGGCCGGCC 613
Query 815 TGTTCAAGACCGAACGCCTGGAGGAGTTCCCGGGCAGCACCGTAGACCTACCCCCCGCGCCTCCGCTCCCTCCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 614 TGTTCAAGACCGAACGCCTGGAGGAGTTCCCGGGCAGCACCGTAGACCTACCCCCCGCGCCTCCGCTCCCTCCT 687
Query 889 CTGCCGCCGCCCCAAGGCCCCCCACCCCCTTACCATGCCCATGCGCACCTTCACCACCCGGAGCTCGGGCCCCA 962
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 688 CTGCCGCCGCCCCCAGGCCCCCCACCCCCTTACCATGCCCATGCGCACCTTCACCACCCGGAGCTCGGGCCCCA 761
Query 963 CGCCCAGCAGCTGGCCTTGCCCCAGGCCACCCTGGACGACGACGGGGAGATGGACGGCATCGGGGGCAAGCATT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 CGCCCAGCAGCTGGCCTTGCCCCAGGCCACCCTGGACGACGACGGGGAGATGGACGGCATCGGGGGCAAGCATT 835
Query 1037 GCTACCGCTGGATCGACTGCAGCGCCCTGTACGACCAGCAGGAGGAGCTCGTGCGGCACATCGAGAAGGTCCAC 1110
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 836 GCTGCCGCTGGATCGACTGCAGCGCCCTGTACGACCAGCAGGAGGAGCTCGTGCGGCACATCGAGAAGGTCCAC 909
Query 1111 ATCGACCAGCGCAAAGGGGAGGACTTCACTTGCTTCTGGGCCGGTTGCCCTCGAAGATACAAGCCCTTCAACGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 910 ATCGACCAGCGCAAAGGGGAGGACTTCACTTGCTTCTGGGCCGGTTGCCCTCGAAGATACAAGCCCTTCAACGC 983
Query 1185 CCGCTATAAACTGCTGATCCACATGAGAGTCCACTCTGGGGAGAAGCCCAACAAGTGTACGTTTGAAGGTTGCG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 984 CCGCTATAAACTGCTGATCCACATGAGAGTCCACTCTGGGGAGAAGCCCAACAAGTGTACGTTTGAAGGTTGCG 1057
Query 1259 AGAAGGCCTTTTCAAGGCTTGAAAATCTCAAGATCCACTTGCGGAGCCACACAGGCGAGAAGCCGTATTTGTGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 AGAAGGCCTTTTCAAGGCTTGAAAATCTCAAGATCCACTTGCGGAGCCACACAGGCGAGAAGCCGTATTTGTGC 1131
Query 1333 CAGCATCCGGGTTGTCAGAAGGCCTTCAGTAACTCCAGTGACCGCGCCAAACACCAGCGGACGCATCTGGACAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132 CAGCATCCGGGTTGTCAGAAGGCCTTCAGTAACTCCAGTGACCGCGCCAAACACCAGCGGACGCATCTGGACAC 1205
Query 1407 CAAACCTTATGCTTGTCAAATTCCAGGATGTACCAAACGCTACACAGACCCAAGTTCCCTAAGAAAGCATGTGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206 CAAACCTTATGCTTGTCAAATTCCAGGATGTACCAAACGCTACACAGACCCAAGTTCCCTAAGAAAGCATGTGA 1279
Query 1481 AGGCACATTCTTCCAAAGAGCAACAAGCAAGGAAAAAGTTGCGGTCCAGCACAGAGCTCCATCCAGACCTGCTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1280 AGGCACATTCTTCCAAAGAGCAACAAGCAAGGAAAAAGTTGCGGTCCAGCACAGAGCTCCATCCAGACCTGCTC 1353
Query 1555 ACAGATTGCCTCACCGTGCAGTCCCTGCAGCCGGCCACTTCCCCTAGAGATGCTGCTGCTGAAGGGACCGTGGG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354 ACAGATTGCCTCACCGTGCAGTCCCTGCAGCCGGCCACTTCCCCTAGAGATGCTGCTGCTGAAGGGACCGTGGG 1427
Query 1629 ACGCTCCCCTGGACCCGGGCCTGACCTCTATTCAGCTCCCATTTTCTCCAGCAATTATTCAAGCCGAAGTGGAA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428 ACGCTCCCCTGGACCCGGGCCTGACCTCTATTCAGCTCCCATTTTCTCCAGCAATTATTCAAGCCGAAGTGGAA 1501
Query 1703 CAGCTGCTGGGGCCGTACCACCCCCACATCCTGTCAGTCACCCTTCTCCAGGACATAATGTACAGGGGAGCCCT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502 CAGCTGCTGGGGCCGTACCACCCCCACATCCTGTCAGTCACCCTTCTCCAGGACATAATGTACAGGGGAGCCCT 1575
Query 1777 CACAACCCCTCCTCCCAGTTACCTCCACTCACAGCTGTGGACGCAGGAGCTGAGAGGTTTGCACCTTCTGCTCC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1576 CACAACCCCTCCTCCCAGTTACCTCCACTCACAGCTGTGGACGCAGGAGCTGAGAGGTTTGCACCTTCTGCTCC 1649
Query 1851 ATCTCCTCACCACATCAGCCCCCGGAGAGTTCCAGCTCCTTCTTCAATACTGCAAAGAACACAGCCTCCCTATA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1650 ATCTCCTCACCACATCAGCCCCCGGAGAGTTCCAGCTCCTTCTTCAATACTGCAAAGAACACAGCCTCCCTATA 1723
Query 1925 CCCAGCAGCCATCAGGTTCACACCTGAAGTCCTATCAGCCAGAAACAAACTCTTCTTTTCAACCAAATGGTATC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1724 CCCAGCAGCCATCAGGTTCACACCTGAAGTCCTATCAGCCAGAAACAAACTCTTCTTTTCAACCAAATGGTATC 1797
Query 1999 CATGTCCATGGATTTTATGGGCAGCTGCAGAAGTTCTGTCCCCCACACTACCCCGATTCCCAGAGAATTGTGCC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 CATGTCCATGGATTTTATGGGCAGCTGCAGAAGTTCTGTCCCCCACACTACCCCGATTCCCAGAGAATTGTGCC 1871
Query 2073 GCCTGTCAGCTCCTGCAGTGTGGTGCCTTCGTTTGAGGACTGCCTAGTCCCTACATCCATGGGCCAGGCCAGTT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1872 GCCTGTCAGCTCCTGCAGTGTGGTGCCTTCGTTTGAGGACTGCCTAGTCCCTACATCCATGGGCCAGGCCAGTT 1945
Query 2147 TTGATGTTTTCCACAGAGCCTTCTCGACTCACTCGGGCATTACAGTGTATGATTTACCTTCAAGTTCCTCGAGC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1946 TTGATGTTTTCCACAGAGCCTTCTCGACTCACTCGGGCATTACAGTGTATGATTTACCTTCAAGTTCCTCGAGC 2019
Query 2221 CTCTTTGGGGAGTCTCTCCGCAGCGGGGCTGAAGATGCTACCTTCTTGCAGATCAGCACCGTGGACCGCTGTCC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2020 CTCTTTGGGGAGTCTCTCCGCAGCGGGGCTGAAGATGCTACCTTCTTGCAGATCAGCACCGTGGACCGCTGTCC 2093
Query 2295 TAGCCAGCTCTCCTCTGTCTGCACCGAAGGC 2325
||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2094 TAGCCAGCTCTCCTCTGTCTACACCGAAGGC 2124