Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09779
Subject:
XM_017014361.1
Aligned Length:
2325
Identities:
2321
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGATGGTTCAGCGACTGGGACTCATTTCACCTCCAGCAAGCCAGGTCTCTACAGCATGCAACCAGATCAGTCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGGTTCAGCGACTGGGACTCATTTCACCTCCAGCAAGCCAGGTCTCTACAGCATGCAACCAGATCAGTCC  74

Query   75  TAGCTTACAGAGGGCAATGAATGCAGCCAACCTGAATATACCTCCTTCAGATACCAGGTCCCTTATTTCGCGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAGCTTACAGAGGGCAATGAATGCAGCCAACCTGAATATACCTCCTTCAGATACCAGGTCCCTTATTTCGCGTG  148

Query  149  AGTCTTTGGCGTCCACGACCTTGAGTCTGACGGAAAGTCAGTCGGCCTCAAGCATGAAGCAGGAGTGGTCCCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGTCTTTGGCGTCCACGACCTTGAGTCTGACGGAAAGTCAGTCGGCCTCAAGCATGAAGCAGGAGTGGTCCCAG  222

Query  223  GGCTACAGGGCCCTCCCTTCGCTCTCCAACCACGGCTCTCAGAATGGCCTTGATCTAGGGGATCTCCTTAGCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCTACAGGGCCCTCCCTTCGCTCTCCAACCACGGCTCTCAGAATGGCCTTGATCTAGGGGATCTCCTTAGCCT  296

Query  297  TCCTCCCGGGACATCCATGTCCAGCAATAGTGTCTCTAACTCATTACCATCCTACCTTTTTGGCACGGAAAGTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCTCCCGGGACATCCATGTCCAGCAATAGTGTCTCTAACTCATTACCATCCTACCTTTTTGGCACGGAAAGTA  370

Query  371  GCCACTCTCCTTACCCTAGTCCTCGGCACTCATCCACCAGGTCCCACTCGGCCCGCTCCAAGAAGAGAGCGCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCACTCTCCTTACCCTAGTCCTCGGCACTCATCCACCAGGTCCCACTCGGCCCGCTCCAAGAAGAGAGCGCTG  444

Query  445  TCCTTGTCCCCGCTGTCCGATGGCATCGGGATAGATTTCAATACCATCATCCGCACGTCGCCCACGTCCTTGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCTTGTCCCCGCTGTCCGATGGCATCGGGATAGATTTCAATACCATCATCCGCACGTCGCCCACGTCCTTGGT  518

Query  519  GGCCTACATCAACGGGTCGAGGGCTTCGCCGGCCAACCTGTCCCCGCAGCCGGAGGTCTACGGGCATTTCCTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCTACATCAACGGGTCGAGGGCTTCGCCGGCCAACCTGTCCCCGCAGCCGGAGGTCTACGGGCATTTCCTGG  592

Query  593  GCGTGCGCGGCAGCTGCATTCCCCAGCCGCGCCCGGTGCCCGGCAGCCAGAAGGGCGTGCTGGTGGCCCCTGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCGTGCGCGGCAGCTGCATTCCCCAGCCGCGCCCGGTGCCCGGCAGCCAGAAGGGCGTGCTGGTGGCCCCTGGA  666

Query  667  GGCCTGGCGCTGCCGGCCTACGGCGAGGACGGGGCCCTGGAGCACGAGCGCATGCAACAGCTGGAGCACGGCGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCTGGCGCTGCCGGCCTACGGCGAGGACGGGGCCCTGGAGCACGAGCGCATGCAACAGCTGGAGCACGGCGG  740

Query  741  CCTGCAGCCAGGCCTGGTCAACCACATGGTGGTGCAGCATGGCCTGCCGGGCCCCGACAGCCAGCCGGCCGGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  741  CCTGCAGCCAGGCCTGGTCAACCACATGGTGGTGCAGCATGGCCTGCCGGGCCCCGACAGCCAGTCGGCCGGCC  814

Query  815  TGTTCAAGACCGAACGCCTGGAGGAGTTCCCGGGCAGCACCGTAGACCTACCCCCCGCGCCTCCGCTCCCTCCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTTCAAGACCGAACGCCTGGAGGAGTTCCCGGGCAGCACCGTAGACCTACCCCCCGCGCCTCCGCTCCCTCCT  888

Query  889  CTGCCGCCGCCCCAAGGCCCCCCACCCCCTTACCATGCCCATGCGCACCTTCACCACCCGGAGCTCGGGCCCCA  962
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGCCGCCGCCCCCAGGCCCCCCACCCCCTTACCATGCCCATGCGCACCTTCACCACCCGGAGCTCGGGCCCCA  962

Query  963  CGCCCAGCAGCTGGCCTTGCCCCAGGCCACCCTGGACGACGACGGGGAGATGGACGGCATCGGGGGCAAGCATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCCCAGCAGCTGGCCTTGCCCCAGGCCACCCTGGACGACGACGGGGAGATGGACGGCATCGGGGGCAAGCATT  1036

Query 1037  GCTACCGCTGGATCGACTGCAGCGCCCTGTACGACCAGCAGGAGGAGCTCGTGCGGCACATCGAGAAGGTCCAC  1110
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTGCCGCTGGATCGACTGCAGCGCCCTGTACGACCAGCAGGAGGAGCTCGTGCGGCACATCGAGAAGGTCCAC  1110

Query 1111  ATCGACCAGCGCAAAGGGGAGGACTTCACTTGCTTCTGGGCCGGTTGCCCTCGAAGATACAAGCCCTTCAACGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCGACCAGCGCAAAGGGGAGGACTTCACTTGCTTCTGGGCCGGTTGCCCTCGAAGATACAAGCCCTTCAACGC  1184

Query 1185  CCGCTATAAACTGCTGATCCACATGAGAGTCCACTCTGGGGAGAAGCCCAACAAGTGTACGTTTGAAGGTTGCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCGCTATAAACTGCTGATCCACATGAGAGTCCACTCTGGGGAGAAGCCCAACAAGTGTACGTTTGAAGGTTGCG  1258

Query 1259  AGAAGGCCTTTTCAAGGCTTGAAAATCTCAAGATCCACTTGCGGAGCCACACAGGCGAGAAGCCGTATTTGTGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAAGGCCTTTTCAAGGCTTGAAAATCTCAAGATCCACTTGCGGAGCCACACAGGCGAGAAGCCGTATTTGTGC  1332

Query 1333  CAGCATCCGGGTTGTCAGAAGGCCTTCAGTAACTCCAGTGACCGCGCCAAACACCAGCGGACGCATCTGGACAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGCATCCGGGTTGTCAGAAGGCCTTCAGTAACTCCAGTGACCGCGCCAAACACCAGCGGACGCATCTGGACAC  1406

Query 1407  CAAACCTTATGCTTGTCAAATTCCAGGATGTACCAAACGCTACACAGACCCAAGTTCCCTAAGAAAGCATGTGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAACCTTATGCTTGTCAAATTCCAGGATGTACCAAACGCTACACAGACCCAAGTTCCCTAAGAAAGCATGTGA  1480

Query 1481  AGGCACATTCTTCCAAAGAGCAACAAGCAAGGAAAAAGTTGCGGTCCAGCACAGAGCTCCATCCAGACCTGCTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGCACATTCTTCCAAAGAGCAACAAGCAAGGAAAAAGTTGCGGTCCAGCACAGAGCTCCATCCAGACCTGCTC  1554

Query 1555  ACAGATTGCCTCACCGTGCAGTCCCTGCAGCCGGCCACTTCCCCTAGAGATGCTGCTGCTGAAGGGACCGTGGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACAGATTGCCTCACCGTGCAGTCCCTGCAGCCGGCCACTTCCCCTAGAGATGCTGCTGCTGAAGGGACCGTGGG  1628

Query 1629  ACGCTCCCCTGGACCCGGGCCTGACCTCTATTCAGCTCCCATTTTCTCCAGCAATTATTCAAGCCGAAGTGGAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACGCTCCCCTGGACCCGGGCCTGACCTCTATTCAGCTCCCATTTTCTCCAGCAATTATTCAAGCCGAAGTGGAA  1702

Query 1703  CAGCTGCTGGGGCCGTACCACCCCCACATCCTGTCAGTCACCCTTCTCCAGGACATAATGTACAGGGGAGCCCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGCTGCTGGGGCCGTACCACCCCCACATCCTGTCAGTCACCCTTCTCCAGGACATAATGTACAGGGGAGCCCT  1776

Query 1777  CACAACCCCTCCTCCCAGTTACCTCCACTCACAGCTGTGGACGCAGGAGCTGAGAGGTTTGCACCTTCTGCTCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CACAACCCCTCCTCCCAGTTACCTCCACTCACAGCTGTGGACGCAGGAGCTGAGAGGTTTGCACCTTCTGCTCC  1850

Query 1851  ATCTCCTCACCACATCAGCCCCCGGAGAGTTCCAGCTCCTTCTTCAATACTGCAAAGAACACAGCCTCCCTATA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATCTCCTCACCACATCAGCCCCCGGAGAGTTCCAGCTCCTTCTTCAATACTGCAAAGAACACAGCCTCCCTATA  1924

Query 1925  CCCAGCAGCCATCAGGTTCACACCTGAAGTCCTATCAGCCAGAAACAAACTCTTCTTTTCAACCAAATGGTATC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCCAGCAGCCATCAGGTTCACACCTGAAGTCCTATCAGCCAGAAACAAACTCTTCTTTTCAACCAAATGGTATC  1998

Query 1999  CATGTCCATGGATTTTATGGGCAGCTGCAGAAGTTCTGTCCCCCACACTACCCCGATTCCCAGAGAATTGTGCC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CATGTCCATGGATTTTATGGGCAGCTGCAGAAGTTCTGTCCCCCACACTACCCCGATTCCCAGAGAATTGTGCC  2072

Query 2073  GCCTGTCAGCTCCTGCAGTGTGGTGCCTTCGTTTGAGGACTGCCTAGTCCCTACATCCATGGGCCAGGCCAGTT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCCTGTCAGCTCCTGCAGTGTGGTGCCTTCGTTTGAGGACTGCCTAGTCCCTACATCCATGGGCCAGGCCAGTT  2146

Query 2147  TTGATGTTTTCCACAGAGCCTTCTCGACTCACTCGGGCATTACAGTGTATGATTTACCTTCAAGTTCCTCGAGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTGATGTTTTCCACAGAGCCTTCTCGACTCACTCGGGCATTACAGTGTATGATTTACCTTCAAGTTCCTCGAGC  2220

Query 2221  CTCTTTGGGGAGTCTCTCCGCAGCGGGGCTGAAGATGCTACCTTCTTGCAGATCAGCACCGTGGACCGCTGTCC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTCTTTGGGGAGTCTCTCCGCAGCGGGGCTGAAGATGCTACCTTCTTGCAGATCAGCACCGTGGACCGCTGTCC  2294

Query 2295  TAGCCAGCTCTCCTCTGTCTGCACCGAAGGC  2325
            ||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2295  TAGCCAGCTCTCCTCTGTCTACACCGAAGGC  2325