Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09794
• Subject: XM_011522943.1
• Aligned Length: 1852
• Identities: 1680
• Gaps: 146

Alignment

Query    1  ATGCCGCCCCATGTGGTGCTCACCTTCCGGCGCCTGGGCTGCGCCTTGGCCTCCTGCCGGCTGGCGCCTGCGAG  74
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCCCCATGTGGTGCTCACCTTCCGGCGCCTGGGCTGCGCCTTGGCGTCCTGCCGGCTGGCGCCTGCGAG  74

Query   75  ACACAGAGGAAGTGGTCTTCTGCACACAGCCCCAGTGGCCCGCTCGGACAGGAGCGCCCCGGTGTTCACCCGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACACAGAGGAAGTGGTCTTCTGCACACAGCCCCAGTGGCCCGCTCGGACAGGAGCGCCCCGGTGTTCACCCGTG  148

Query  149  CCCTGGCCTTTGGGGACAGAATCGCCCTGGTTGACCAGCACGGCCGCCACACGTACAGGGAGCTTTATTCCCGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCTGGCCTTTGGGGACAGAATCGCCCTGGTTGACCAGCACGGCCGCCACACGTACAGGGAGCTTTATTCCCGC  222

Query  223  AGCCTTCGCCTGTCCCAGGAGATCTGCAGGCTCTGCGGGTGTGTCGGCGGGGACCTCCGGGAGGAGAGGGTCTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCCTTCGCCTGTCCCAGGAGATCTGCAGGCTCTGCGGGTGTGTCGGCGGGGACCTCCGGGAGGAGAGGGTCTC  296

Query  297  CTTCCTATGTGCTAACGACGCCTCCTACGTCGTGGCCCAGTGGGCCTCATGGATGAGCGGCGGTGTGGCAGTAC  370
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  297  CTTCCTATGCGCTAACGATGCCTCCTACGTCGTGGCCCAGTGGGCGTCATGGATGAGTGGCGGTGTGGCAGTCC  370

Query  371  CCCTCTACAGGAAGCATCCCGCGGCCCAGCTGGAGTATGTCATCTGCGACTCCCAGAGCTCTGTGGTCCTTGTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  371  CCCTCTACAGGAAGCATCCCGCGGCCCAGCTGGAGTATGTCATCTGCGACTCCCAGAGCTCTGTGGTCCTTGCC  444

Query  445  AGCCAGGAGTACCTGGAGCTCCTGAGCCCGGTGGTCAGGAAGCTGGGGGTCCCGCTGCTGCCGCTCACACCAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCCAGGAGTACCTGGAGCTCCTGAGCCCGGTGGTCAGGAAGCTGGGGGTCCCGCTGCTGCCGCTCACACCAGC  518

Query  519  CATCTACACTGGAGCAGTAGAGGAACCGGCAGAGGTCCCGGTCCCAGAGCAGGGATGGAGGAACAAGGGCGCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATCTACACTGGAGCAGTAGAGGAACCGGCAGAGGTCCCGGTCCCAGAGCAGGGATGGAGGAACAAGGGCGCCA  592

Query  593  TGATCATCTACACCAGTGGGACCACGGGGAGGCCCAAGGGCGTGCTGAGCACGCACCAAAACATCAGGGCTGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGATCATCTACACCAGTGGGACCACGGGGAGGCCCAAGGGCGTGCTGAGCACGCACCAAAACATCAGGGCTGTG  666

Query  667  GTGACCGGGCTGGTCCACAAGTGGGCATGGACCAAAGACGACGTGATCCTCCACGTGCTCCCGCTGCACCACGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGACCGGGCTGGTCCACAAGTGGGCATGGACCAAAGACGACGTGATCCTCCACGTGCTCCCGCTGCACCACGT  740

Query  741  CCATGGTGTGGTCAACGCGCTGCTCTGTCCTCTCTGGGTGGGAGCCACCTGTGTGATGATGCCTGAGTTCAGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCATGGTGTGGTCAACGCGCTGCTCTGTCCTCTCTGGGTGGGAGCCACCTGTGTGATGATGCCTGAGTTCAGCC  814

Query  815  CTCAGCAGGTTTGGGAAAAGTTCTTAAGTTCTGAAACGCCGCGGATCAATGTCTTTATGGCAGTGCCTACAATA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCAGCAGGTTTGGGAAAAGTTCTTAAGTTCTGAAACGCCGCGGATCAATGTCTTTATGGCAGTGCCTACAATA  888

Query  889  TACACCAAGCTGATGGAGTACTACGACAGGCATTTTACCCAGCCGCACGCCCAGGATTTCTTGCGTGCAGTTTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACACCAAGCTGATGGAGTACTACGACAGGCATTTTACCCAGCCGCACGCCCAGGATTTCTTGCGTGCAGTTTG  962

Query  963  TGAAGAAAAAATTAGGCTGATGGTCTCAGGCTCAGCTGCCCTGCCCCTCCCAGTGCTGGAGAAGTGGAAGAACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAAGAAAAAATTAGGCTGATGGTCTCAGGCTCAGCTGCCCTGCCCCTCCCAGTGCTGGAGAAGTGGAAGAACA  1036

Query 1037  TCACGGGCCACACCCTGCTGGAGCGGTATGGCATGACCGAGATCGGCATGGCTCTGTCCGGGCCCCTGACCACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCACGGGCCACACCCTGCTGGAGCGGTATGGCATGACCGAGATCGGCATGGCTCTGTCCGGGCCCCTGACCACT  1110

Query 1111  GCCATGCGCCTGCCAGGTTCCGTGGGGACCCCACTGCCTGGAGTACAGGTGCGCATTGTCTCAGAAAACCCACA  1184
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCGTGCGCCTGCCAGGTTCCGTGGGGACCCCACTGCCTGGAGTACAGGTGCGCATTGTCTCAGAAAACCCACA  1184

Query 1185  GAGGGAAGCCTGCTCCTACACCATCCACGCAGAGGGAGACGAGAGGGGGACCAAGGTGACCCCAGGGTTTGAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGGGAAGCCTGCTCCTACACCATCCACGCAGAGGGAGACGAGAGGGGGACCAAGGTGACCCCAGGGTTTGAAG  1258

Query 1259  AAAAGGAGGGGGAGCTGCTGGTGAGGGGACCCTCCGTGTTTCGAGAATACTGGAATAAACCAGAAGAAACTAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAAAGGAGGGGGAGCTGCTGGTGAGGGGACCCTCCGTGTTTCGAGAATACTGGAATAAACCAGAAGAAACTAAG  1332

Query 1333  AGTGCATTCACCCTGGATGGCTGGTTTAAGACAGGGGACACCGTGGTGTTTAAGGATGGCCAGTACTGGATCCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGTGCATTCACCCTGGATGGCTGGTTTAAGACAGGGGACACCGTGGTGTTTAAGGATGGCCAGTACTGGATCCG  1406

Query 1407  AGGCCGGACCTCAGTGGACATCATCAAGACTGGAGGCTACAAGGTCAGCGCCCTGGAGGTGGAGTGGCACCTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGGCCGGACCTCAGTGGACATCATCAAGACTGGAGGCTACAAGGTCAGCGCCCTGGAGGTGGAGTGGCACCTGC  1480

Query 1481  TGGCCCACCCCAGCATCACAGATGTGGCTGTGATTGGAGTTCCGGATATGACATGGGGCCAGCGGGTCACTGCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGCCCACCCCAGCATCACAGATGTGGCTGTGATTGGAGTTCCGGATATGACATGGGGCCAGCGGGTCACTGCT  1554

Query 1555  GTGGTGACCCTCCGAGAAGGACACTCACTGTCCCACAGGGAGCTCAAAGAGTGGGCCAG---------------  1613
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct 1555  GTGGTGACCCTCCGAGAAGGACACTCACTGTCCCACAGGGAGCTCAAAGAGTGGGCCAGGTTGAAAGAACACCC  1628

Query 1614  ---------------------------AAATGT---------------CCTGGCCCC--GTACGCGGTGCCCT-  1642
                                       ||||.|               |||.|||.|  |.|.|||| ||.|| 
Sbjct 1629  AACCAAGAGGAGAGAAAACAGCATTCTAAATATCGGAAGGAAACGAAACCTCGCCTCAGGCATGCGG-GCTCTG  1701

Query 1643  ------------------CGGAGCTGG-TGCTG------GTGGAG---------GAGATCCCGCGGAACCAGAT  1682
                              |||||  || |||||      |||.||         .||||      |||.|||||
Sbjct 1702  ACGGGCAGGATGGCGGCACGGAG--GGCTGCTGTATCCAGTGAAGTCAGCAGTTCAGAT------GAAACAGAT  1767

Query 1683  ------------GGGCA-AGATTGACAAGA---AGGC--------------GCTCATCAGGCACTTCCACCCCT  1726
                        .|.|| |.||||.|||||   |.||              .||.|.|||    |||       
Sbjct 1768  AACTCCCTTAAAAGACACAAATTGCCAAGACTGACGCAAACACTGAAACAGACTGAACAG----TTC-------  1830

Query 1727  CA  1728
              
Sbjct 1831  --  1830