Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09805
• Subject: NM_152426.4
• Aligned Length: 1159
• Identities: 1008
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ATGAAGCCTCACTTCAGAAACACAGTGGAGCGAATGTATCGAGACACATTCTCCTACAACTTTTATAATAGACC  74
            |||||.||.||..|||||||..|..|||||||.|||||||||||||||||||.|.||||||||.|.||...|||
Sbjct    1  ATGAATCCACAGATCAGAAATCCGATGGAGCGGATGTATCGAGACACATTCTACGACAACTTTGAAAACGAACC  74

Query   75  CATCCTTTCTCGTCGGA-ATACCGTCTGGCTGTGCTACGAAGTGAAAACAAA---GGGTCCCTCAAGGCCCCGT  144
            ||||||.|.|.|||||| .|||..| |||||||||||.||||||||||.|||   |||.|.|||||..|.||.|
Sbjct   75  CATCCTCTATGGTCGGAGCTACACT-TGGCTGTGCTATGAAGTGAAAATAAAGAGGGGCCGCTCAAATCTCCTT  147

Query  145  TTGGACGCAAAGATCTTTCGAGGCC------------------------------------AGGTGTATTCCCA  182
            |.||||.||..|.||||||||||||                                    |||||||||.||.
Sbjct  148  TGGGACACAGGGGTCTTTCGAGGCCCGGTACTACCCAAACGTCAGTCGAATCACAGGCAGGAGGTGTATTTCCG  221

Query  183  GCCTGAGCACCACGCAGAAATGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGGCAACCAGCTGCCTGCTTACAAGTGTTTCC  256
            |..||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|.|.||||
Sbjct  222  GTTTGAGAACCACGCAGAAATGTGCTTCTTATCTTGGTTCTGTGGCAACCGACTGCCTGCTAACAGGCGCTTCC  295

Query  257  AGATCACCTGGTTTGTATCCTGGACCCCCTGCCCGGACTGTGTGGCGAAGCTGGCCGAATTCCTGTCTGAGCAC  330
            |||||||||||||||||||.||||.||||||||.|..||||||||.||||.||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct  296  AGATCACCTGGTTTGTATCATGGAACCCCTGCCTGCCCTGTGTGGTGAAGGTGACCAAATTCTTGGCTGAGCAC  369

Query  331  CCCAATGTCACCCTGACCATCTCCGCCGCCCGCCTCTACTACTACTGGGAAAGAGATTACCGAAGGGCGCTCTG  404
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||..||..|||.||||..
Sbjct  370  CCCAATGTCACCCTGACCATCTCTGCCGCCCGCCTCTACTACTACCGGGATAGAGATTGGCGGTGGGTGCTCCT  443

Query  405  CAGGCTGAGTCAGGCAGGGGCCCGTGTGAAGATTATGGACGATGAAGAATTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTG  478
            |||||||..|.||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  CAGGCTGCATAAGGCAGGGGCCCGTGTGAAGATCATGGACTATGAAGACTTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTG  517

Query  479  TGTACAGTGAAGGTCAGCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGCATTCCTGCACCGCACGCTA  552
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  518  TGTGCAATGAAGGTCAGCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGCATCCCTGCACCGCACGCTA  591

Query  553  AAGGAGATTCTCAGAAACCCGATGGAGGCAATGTATCCACACATATTCTACTTCCACTTTAAAAACCTACGCAA  626
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct  592  AAGGAGATTCTCAGAAACCCGATGGAGGCAATGTACCCACACATATTCTACTTCCACTTTAAAAACCTACTGAA  665

Query  627  AGCCTATGGTCGGAACGAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTGTAAAGCACCACTCACCTATCTCCTGGA  700
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.|||.|.|||
Sbjct  666  AGCCTGTGGTCGGAACGAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTACAAAGCACCACTCAGCTGTCTTCCGGA  739

Query  701  AGAGGGGCGTCTTCCGAAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAGGTGCTTCCTCTCTTGGTTC  774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AGAGGGGCGTCTTCCGAAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAGGTGCTTCCTCTCTTGGTTC  813

Query  775  TGTGACGACATACTGTCTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGAGTG  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  TGTGACGACATACTGTCTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGAGTG  887

Query  849  TGCAGGGGAGGTGGCCGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATCTTCACCGCCCGCCTCTACT  922
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  888  TGCAGGGGAGGTGGCCGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATCTTCACCGCCCGCCTCTGCT  961

Query  923  ACTTCTGGGATACAGATTACCAGGAGGGGCTCCGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGCCTCCGTGGAGATCATGGGC  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  962  ACTTCTGGGATACAGATTACCAGGAGGGGCTCTGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGCCTCCGTGAAGATCATGGGC  1035

Query  997  TACAAAGATTTTAAATATTGTTGGGAAAACTTTGTGTACAATGATGATGAGCCATTCAAGCCTTGGAAAGGACT  1070
            ||||||||||||..||.|||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1036  TACAAAGATTTTGTATCTTGTTGGAAAAACTTTGTGTACAGTGATGATGAGCCATTCAAGCCTTGGAAGGGACT  1109

Query 1071  AAAATACAACTTTCTATTCCTGGACAGCAAGCTGCAGGAGATTCTCGAG  1119
            |.||..||||||||.|.|.|||.|.||.|.|||.|.||||||||||.||
Sbjct 1110  ACAAACCAACTTTCGACTTCTGAAAAGAAGGCTACGGGAGATTCTCCAG  1158