Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09831
• Subject: NM_001290341.2
• Aligned Length: 1182
• Identities: 1147
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGTTTTGGACGTTTAAAGAATGGTTCTGGTTGGAAAGATT  41
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTTCACACCACTGCCAGAAGAGCTGCCAGAATGTTTTGGACGTTTAAAGAATGGTTCTGGTTGGAAAGATT  74

Query   42  CTGGCTTCCTCCAACAATAAAGTGGTCAGATCTTGAGGATCACGATGGACTCGTCTTTGTAAAACCTTCTCATT  115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGGCTTCCTCCAACAATAAAGTGGTCAGATCTTGAGGATCACGATGGACTCGTCTTTGTAAAACCTTCTCATT  148

Query  116  TATACGTGACAATTCCATATGCTTTTCTCTTGCTGATTATCAGGCGTGTATTTGAAAAATTTGTTGCTTCACCT  189
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TATACGTGACAATTCCATATGCTTTTCTCTTGCTGATTATCAGACGTGTATTTGAAAAATTTGTTGCTTCACCT  222

Query  190  CTAGCAAAATCATTTGGCATTAAAGAGACAGTTCGAAAGGTTACACCAAATACTGTCTTAGAGAATTTTTTCAA  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTAGCAAAATCATTTGGCATTAAAGAGACAGTTCGAAAGGTTACACCAAATACTGTCTTAGAGAATTTTTTCAA  296

Query  264  ACATTCCACAAGGCAACCATTGCAAACTGATATTTATGGACTGGCAAAGAAGTGTAACTTGACGGAGCGCCAGG  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACATTCCACAAGGCAACCATTGCAAACTGATATTTATGGACTGGCAAAGAAGTGTAACTTGACGGAGCGCCAGG  370

Query  338  TGGAAAGATGGTTTAGGAGTCGGCGGAATCAAGAGAGGCCTTCCAGGCTGAAGAAATTCCAGGAAGCTTGCTGG  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAAAGATGGTTTAGGAGTCGGCGGAATCAAGAGAGGCCTTCCAGGCTGAAGAAATTCCAGGAAGCTTGCTGG  444

Query  412  AGATTTGCATTTTACTTAATGATCACTGTTGCTGGAATTGCGTTTCTTTATGATAAACCTTGGCTATATGACTT  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGATTTGCATTTTACTTAATGATCACTGTTGCTGGAATTGCGTTTCTTTATGATAAACCTTGGCTATATGACTT  518

Query  486  ATGGGAGGTTTGGAATGGCTATCCCAAACAGCCCCTGCTGCCATCCCAGTACTGGTACTACATTTTAGAAATGA  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATGGGAGGTTTGGAATGGCTATCCCAAACAGCCCCTGCTGCCATCCCAGTACTGGTACTACATTTTAGAAATGA  592

Query  560  GTTTTTATTGGTCTCTGTTATTTAGACTTGGCTTTGATGTCAAGAGAAAGGATTTTCTAGCTCATATCATCCAC  633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTTTTTATTGGTCTCTGTTATTTAGACTTGGCTTTGATGTCAAGAGAAAGGATTTTCTAGCTCATATCATCCAC  666

Query  634  CACCTGGCTGCTATTAGTCTGATGAGCTTCTCTTGGTGTGCTAATTATATTCGCAGTGGGACCCTCGTGATGAT  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACCTGGCTGCTATTAGTCTGATGAGCTTCTCTTGGTGTGCTAATTATATTCGCAGTGGGACCCTCGTGATGAT  740

Query  708  TGTACACGATGTGGCTGACATTTGGCTGGAGTCTGCTAAGATGTTTTCTTATGCTGGATGGACGCAGACCTGTA  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTACACGATGTGGCTGACATTTGGCTGGAGTCTGCTAAGATGTTTTCTTATGCTGGATGGACGCAGACCTGTA  814

Query  782  ACACCCTGTTTTTCATCTTCTCCACCATATTTTTCATCAGCCGCCTCATTGTTTTTCCTTTCTGGATTTTATAT  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACACCCTGTTTTTCATCTTCTCCACCATATTTTTCATCAGCCGCCTCATTGTTTTTCCTTTCTGGATTTTATAT  888

Query  856  TGCACGCTGATCTTGCCTATGTATCACCTCGAGCCTTTCTTTTCATACATCTTCCTCAACCTACAGCTCATGAT  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCACGCTGATCTTGCCTATGTATCACCTCGAGCCTTTCTTTTCATACATCTTCCTCAACCTACAGCTCATGAT  962

Query  930  CTTGCAGGTCCTTCACCTTTACTGGGGTTATTACATCTTGAAGATGCTCAACAGATGTATATTCATGAAGAGCA  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTGCAGGTCCTTCACCTTTACTGGGGTTATTACATCTTGAAGATGCTCAACAGATGTATATTCATGAAGAGCA  1036

Query 1004  TCCAGGATGTGAGGAGTGATGACGAGGATTATGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGCTACCAAAGGC  1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCAGGATGTGAGGAGTGATGACGAGGATTATGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGCTACCAAAGGC  1110

Query 1078  AAAGAGATGGATTGTTTAAAGAACGGCCTCGGGGCTGAGAGGCACCTCATTCCCAATGGCCAGCATGGCCAT  1149
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGAGATGGATTGTTTAAAGAACGGCCTCAGGGCTGAGAGGCACCTCATTCCCAATGGCCAGCATGGCCAT  1182