Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09882
- Subject:
- NM_178675.4
- Aligned Length:
- 1227
- Identities:
- 1105
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGATCCCCCCTGAGCAGCCGCAGCAGCAGCTGCAGCCGCCGTCGCCA---GCCCCGCCGAACCATGTGGTGAC 71
|||||.|||||.||||..|||||||..||.||||||||.||..|.||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATTCCCCCCGAGCCTCCGCAGCCCCAACTGCAGCCACCACCTCCACCGGCCCCGCCGAACCATGTGGTGAC 74
Query 72 CACCATCGAGAACCTGCCGGCCGAGGGCAGCGGCGGCGGCGGGAGCCTGTCCGCCTCCTCCCGGGCTGGCGTGC 145
||||||||||||||||||.||.||||||| |||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 75 CACCATCGAGAACCTGCCAGCTGAGGGCA---GCGGCGGCGTGAGCCTGTCCGCCTCCTCCCGGGCTAGCATGC 145
Query 146 GCCAGAGGATCCGCAAAGTGCTGAACAGGGAGATGTTAATCTCTGTGGCCCTAGGCCAGGTGTTATCCCTCCTT 219
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 146 GCCAGAGGATCCGCAAAGTGCTGAACAGGGAGATGTTAATCTCTGTGGCTTTGGGTCAAGTGTTATCCCTTCTC 219
Query 220 ATTTGTGGAATTGGCTTGACTAGCAAGTATCTGTCAGAAGATTTCCACGCCAACACACCAGTCTTCCAGAGTTT 293
.|||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 220 GTTTGTGGAATTGGCTTGACGAGCAAGTACCTGGCAGAGGATTTTCATGCGAACACACCAGTCTTCCAGAGCTT 293
Query 294 CCTCAATTACATTCTTCTCTTCTTGGTCTATACCACCACACTAGCCGTCAGACAAGGAGAAGAAAACCTCCTGG 367
.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 TCTGAACTACATCCTCCTCTTCTTGGTATACACCACCACCCTAGCTGTCCGACAAGGAGAAGAAAACCTCCTGG 367
Query 368 CAATTTTACGACGAAGATGGTGGAAGTACATGATTTTGGGACTCATAGACCTGGAAGCAAATTATCTGGTGGTC 441
||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 368 CAATTTTACGACGAAGATGGTGGAAGTATATGATCCTTGGACTCATAGACTTGGAAGCTAATTACCTGGTGGTC 441
Query 442 AAGGCTTACCAATACACAAATCTGACCAGTATCCAGCTCCTGGACTGTTTTGTGATCCCAGTCGTGATTTTGCT 515
|||||||||||.|||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 442 AAGGCTTACCAGTACACAACTCTGACCAGTGTCCAGCTCCTGGACTGTTTTGTGATCCCGGTGGTGATTTTGCT 515
Query 516 CTCCTGGTTCTTCCTGCTGATCCGGTACAAGGCTGTGCATTTCATCGGCATCGTTGTCTGCATCCTGGGAATGG 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 516 CTCCTGGTTCTTCCTGCTGATCCGGTACAAGGCTGTGCATTTCATCGGCATCGTAGTCTGCATCCTGGGTATGG 589
Query 590 GCTGCATGGTGGGAGCAGATGTGCTTGTGGGAAGACATCAGGGAGCAGGGGAAAATAAGCTGGTAGGGGACCTT 663
||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 590 GCTGCATGGTGGGAGCGGATGTGCTCGTGGGAAGGCACCAGGGAGCAGGAGAAAATAAGCTGGTAGGAGACCTT 663
Query 664 CTGGTCTTAGGAGGAGCCACACTCTATGGTATTTCTAACGTCTGGGAAGAATACATCATCCGAACTCTGAGCCG 737
||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||||.|||.||||||||.||||||||
Sbjct 664 CTGGTCTTAGGAGGAGCCACCCTGTACGGGATCTCAAATGTCTGGGAAGAATCCATTATCCGAACCCTGAGCCG 737
Query 738 AGTGGAATTCCTGGGAATGATTGGTCTCTTTGGAGCATTTTTCAGTGGAATTCAATTAGCTATAATGGAGCATA 811
.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 738 TGTGGAGTTCCTGGGAATGATTGGTCTCTTTGGTGCATTTTTCAGTGGAATTCAATTAGCCATCATGGAACACA 811
Query 812 AGGAACTGTTGAAGGTGCCCTGGGACTGGCAAATAGGACTGCTCTACGTTGGCTTTAGTGCCTGCATGTTTGGT 885
||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 AGGAACTGTTAAAGGTACCATGGGATTGGCAAATAGGACTGCTCTATGTTGGCTTTAGTGCCTGCATGTTTGGT 885
Query 886 CTCTACAGCTTTATGCAAGTCGTCATAAAGAAAACCAGTGCCACTTCAGTCAACCTCTCCTTGCTCACAGCAGA 959
||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||..|||||||||||||
Sbjct 886 CTCTACAGCTTTATGCCAGTTGTCATAAAGAAAACGAGTGCCACCTCGGTCAACCTTTCTCTGCTCACAGCAGA 959
Query 960 CTTGTACAGCCTGTTCTGTGGATTGTTTCTCTTCCACTACAAGTTTTCAGGACTTTATCTCCTGTCTTTCTTCA 1033
..||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 960 TCTGTACAGCCTGTTCTGTGGACTCTTTCTCTTCCACTACAAGTTTTCAGGTCTTTACCTCCTGTCTTTCTTCA 1033
Query 1034 CCATCCTCATTGGGCTGGTGCTCTACTCCTCCACCTCCACCTACATAGCCCAGGACCCCCGAGTGTATAAGCAG 1107
||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1034 CCATCCTCATCGGGCTGGTGCTGTATTCCTCCACCTCTACATACATAGCCCAGGATCCCCGAGTGTACAAGCAG 1107
Query 1108 TTCCGCAATCCTTCAGGACCTGTTGTGGACTTACCGACCACAGCTCAGGTGGAACCCTCAGTCACCTACACCAG 1181
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.|||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1108 TTCCGCAATCCTTCAGGACCTGTCGTGGACTTACCCAGCACGGCTCAGGTAGAGCCTTCAGTCACCTACACCAG 1181
Query 1182 CCTGGGCCAGGAGACCGAAGAGGAGCCTCATGTTCGTGTGGCC 1224
|||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1182 CCTGGGCCAGGAGACAGAAGAAGAGCCCCATGTACGTGTGGCC 1224