Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09906
• Subject: XM_005245827.3
• Aligned Length: 1902
• Identities: 1779
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGA  74

Query   75  GCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCC  148

Query  149  TGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTG  222

Query  223  GAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTT  296

Query  297  TGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCT  370

Query  371  CACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCC  444

Query  445  TTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAAT  518

Query  519  GGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTG  592

Query  593  TCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATT  666

Query  667  ATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGC  740

Query  741  TGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAAGAAGCGAGTGGGAGCCATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCTCTGA  814
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct  741  TGGAGCTGGCCTGACAG---------------------------------------------------------  757

Query  815  CGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCGCCGTCACGGGGTGGCTCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTTCAGT  888
                                                                           |||||||||||
Sbjct  758  ---------------------------------------------------------------GCACCTTCAGT  768

Query  889  GCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  GCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCT  842

Query  963  CGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  CGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGT  916

Query 1037  TGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  TGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGG  990

Query 1111  GGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  GGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCG  1064

Query 1185  ACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  ACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAG  1138

Query 1259  AGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  AGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGG  1212

Query 1333  GAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  GAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGT  1286

Query 1407  GTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCACGTCGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  GTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCGTGTCGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGA  1360

Query 1481  ACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  ACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTG  1434

Query 1555  GGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  GGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCC  1508

Query 1629  TCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509  TCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCG  1582

Query 1703  GAGACACCTCCAAANTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAA  1776
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583  GAGACACCTCCAAATTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAA  1656

Query 1777  GGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1657  GGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACT  1730

Query 1851  GGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC  1902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731  GGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC  1782