Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09906
• Subject: XM_017000916.1
• Aligned Length: 2094
• Identities: 1899
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGGACGCTGGTCAAGGGCAATTTGCATATTTCTCCAAAGAACCATCCAGAACCTGAGCAGCCTGTCTTCAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ACAGAGAGAGGCCCACGGCTGTTTCTTGAAATCTGGTGATCCAGGTCCTGTCCAGAAAGCTCGGGGTGTGGCAG  148

Query    1  --------------------------------------------ATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGG  30
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAAAAAACAACCAGGGAACTGCCTCGTACACACAGCGCTGGGAATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGG  222

Query   31  CTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGAGCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGAC  104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGAGCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGAC  296

Query  105  TGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCCTGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACA  178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCCTGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACA  370

Query  179  GCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTGGAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATG  252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTGGAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATG  444

Query  253  ACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTTTGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTT  326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTTTGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTT  518

Query  327  GAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCTCACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGG  400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCTCACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGG  592

Query  401  CCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCCTTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATG  474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCCTTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATG  666

Query  475  TTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAATGGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAA  548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAATGGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAA  740

Query  549  CCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTGTCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTG  622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTGTCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTG  814

Query  623  GAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATTATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGC  696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATTATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGC  888

Query  697  TCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGCTGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAA  770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGCTGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAA  962

Query  771  GAAGCGAGTGGGAGCCATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCTCTGACGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCG  844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAGCGAGTGGGAGCCATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCTCTGACGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCG  1036

Query  845  CCGTCACGGGGTGGCTCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTTCAGTGCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGT  918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCGTCACGGGGTGGCTCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTTCAGTGCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGT  1110

Query  919  GAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCTCGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGG  992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCTCGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGG  1184

Query  993  TCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGTTGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGC  1066
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGTTGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGC  1258

Query 1067  CAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGGGGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTT  1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGGGGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTT  1332

Query 1141  GGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCGACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCT  1214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCGACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCT  1406

Query 1215  GGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAGAGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACG  1288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAGAGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACG  1480

Query 1289  TCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGGGAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGG  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGGGAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGG  1554

Query 1363  ATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGTGTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCACGT  1436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 1555  ATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGTGTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCGTGT  1628

Query 1437  CGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGAACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCC  1510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGAACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCC  1702

Query 1511  ACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTGGGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAG  1584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTGGGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAG  1776

Query 1585  AAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCCTCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGG  1658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCCTCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGG  1850

Query 1659  CGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCGGAGACACCTCCAAANTGGCCATGTCCACAG  1732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1851  CGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCGGAGACACCTCCAAATTGGCCATGTCCACAG  1924

Query 1733  ACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAAGGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCT  1806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAAGGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCT  1998

Query 1807  GAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACTGGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCA  1880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACTGGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCA  2072

Query 1881  GGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC  1902
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC  2094