Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09906
- Subject:
- XM_017000917.1
- Aligned Length:
- 2079
- Identities:
- 1899
- Gaps:
- 177
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGCAATTTGCATATTTCTCCAAAGAACCATCCAGAACCTGAGCAGCCTGTCTTCAGACAGAGAGAGGCCCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGGCTGTTTCTTGAAATCTGGTGATCCAGGTCCTGTCCAGAAAGCTCGGGGTGTGGCAGTGAAAAAACAACCAG 148
Query 1 -----------------------------ATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCT 45
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGAACTGCCTCGTACACACAGCGCTGGGAATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCT 222
Query 46 CTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGAGCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTT 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGAGCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTT 296
Query 120 CGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCCTGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAG 193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCCTGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAG 370
Query 194 AGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTGGAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGC 267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTGGAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGC 444
Query 268 GGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTTTGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGAC 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTTTGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGAC 518
Query 342 GGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCTCACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTT 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCTCACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTT 592
Query 416 GCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCCTTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTG 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCCTTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTG 666
Query 490 AAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAATGGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAA 563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAATGGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAA 740
Query 564 GCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTGTCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCAC 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTGTCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCAC 814
Query 638 CCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATTATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATA 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATTATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATA 888
Query 712 GCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGCTGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAAGAAGCGAGTGGGAGC 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGCTGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAAGAAGCGAGTGGGAGC 962
Query 786 CATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCTCTGACGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCGCCGTCACGGGGTGGC 859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCTCTGACGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCGCCGTCACGGGGTGGC 1036
Query 860 TCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTTCAGTGCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTG 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTTCAGTGCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTG 1110
Query 934 GCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCTCGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGT 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCTCGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGT 1184
Query 1008 GGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGTTGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCA 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGTTGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCA 1258
Query 1082 GTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGGGGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCC 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGGGGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCC 1332
Query 1156 CACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCGACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCAT 1229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCGACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCAT 1406
Query 1230 CTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAGAGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTG 1303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAGAGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTG 1480
Query 1304 CGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGGGAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTAC 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGGGAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTAC 1554
Query 1378 TGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGTGTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCACGTCGCCGGCCTACAGCC 1451
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGTGTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCGTGTCGCCGGCCTACAGCC 1628
Query 1452 CGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGAACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCA 1525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGAACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCA 1702
Query 1526 AGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTGGGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTG 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTGGGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTG 1776
Query 1600 GCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCCTCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCA 1673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCCTCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCA 1850
Query 1674 GGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCGGAGACACCTCCAAANTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCC 1747
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCGGAGACACCTCCAAATTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCC 1924
Query 1748 AGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAAGGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATC 1821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAAGGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATC 1998
Query 1822 TGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACTGGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGG 1895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACTGGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGG 2072
Query 1896 GCTGGAC 1902
|||||||
Sbjct 2073 GCTGGAC 2079