Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09906
• Subject: XM_017000922.1
• Aligned Length: 1902
• Identities: 1572
• Gaps: 327

Alignment

Query    1  ATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCC  148
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCC  24

Query  149  TGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct   25  TGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACA--------------------------------------------  54

Query  223  GAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTT  296
                                                                                      
Sbjct   55  --------------------------------------------------------------------------  54

Query  297  TGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCT  370
                                                                                      
Sbjct   55  --------------------------------------------------------------------------  54

Query  371  CACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCC  444
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  -----------GGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCC  117

Query  445  TTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118  TTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAAT  191

Query  519  GGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  GGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTG  265

Query  593  TCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  TCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATT  339

Query  667  ATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  ATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGC  413

Query  741  TGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAAGAAGCGAGTGGGAGCCATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCTCTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  TGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAAGAAGCGAGTGGGAGCCATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCTCTGA  487

Query  815  CGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCGCCGTCACGGGGTGGCTCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTTCAGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  CGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCGCCGTCACGGGGTGGCTCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTTCAGT  561

Query  889  GCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  GCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCT  635

Query  963  CGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  CGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGT  709

Query 1037  TGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  TGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGG  783

Query 1111  GGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  GGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCG  857

Query 1185  ACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  ACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAG  931

Query 1259  AGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  AGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGG  1005

Query 1333  GAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  GAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGT  1079

Query 1407  GTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCACGTCGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  GTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCGTGTCGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGA  1153

Query 1481  ACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  ACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTG  1227

Query 1555  GGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228  GGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCC  1301

Query 1629  TCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302  TCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCG  1375

Query 1703  GAGACACCTCCAAANTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAA  1776
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376  GAGACACCTCCAAATTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAA  1449

Query 1777  GGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450  GGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACT  1523

Query 1851  GGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC  1902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524  GGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC  1575