Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09941
• Subject: NM_138956.3
• Aligned Length: 714
• Identities: 614
• Gaps: 18

Alignment

Query   1  ATGAGCAGCGGCTACAGCAGCCTGGAGGAGGACGCCGAGGACTTCTTCTTCACCGCCAGGACCTCCTTCTTCAG  74
           |||||||||||||||||||||||.||||||||   |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAGCAGCGGCTACAGCAGCCTCGAGGAGGA---CGAGGACTTTTTCTTCACCGCCAGGACCTCCTTCTTCAG  71

Query  75  GAGAGCGCCCCAGGGCAAGCCCCGCTCCGGCCAGCAAGATGTTGAGAAAGAGAAGGAAACCCACAGTTACCTCA  148
           |||||||||.|.|||||||.||||.||.||.||||..|||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||
Sbjct  72  GAGAGCGCCTCCGGGCAAGTCCCGTTCGGGTCAGCCGGATGTGGAGAAAGAGAAGGAAACGCACAATTACCTCA  145

Query 149  GCAAAGAGGAGATCAAAGAGAAAGTTCATAAATACAACTTAGCAGTCACAGACAAGTTGAAGATGACCTTGAAT  222
           ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||.||.|||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct 146  GCAAAGAGGAAATCAAAGAGAAAGTTCATAAATACAATTCAGCCGTTACAGACAAGCTGAAGATGACCTTAAAT  219

Query 223  TCAAATGGGATTTACACTGGCTTCATTAAAGTACAGATGGAACTCTGCAAACCTCCACAGACTTCTCCAAATTC  296
           ||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|.|||.|.|||||      
Sbjct 220  TCCAATGGGATCTACACTGGCTTCATTAAGGTGCAGATGGAACTCTGCAAACCTGCCCAGCCCTCTCC------  287

Query 297  TGGAAAACTCTCTCCCAGTAGCAATGGCTGTATGAATACACTTCATATCAGCAGCACAAACACTGTCGGGGAAG  370
                    |...|||||.|||..||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 288  ---------CGAGCCCAGCAGCGGTGGCTGCATGAACACGCTTCACATCAGCAGTACAAACACCGTGGGGGAAG  352

Query 371  TGATCGAGGCCCTGCTCAAAAAGTTTCTCGTGACTGAGAGCCCTGCCAAGTTTGCACTTTATAAGCGTTGTCAC  444
           ||||||||||.|||||||..||||||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 353  TGATCGAGGCTCTGCTCAGGAAGTTTCTGGTGACCGAGAGTCCCACCAAGTTTGCGCTTTATAAGCGTTGTCAC  426

Query 445  AGGGAAGACCAAGTCTACGCCTGCAAGCTCTCAGACCGGGAACATCCACTCTACCTGCGTTTGGTAGCAGGGCC  518
           .|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 427  CGGGAAGACCAAGTGTATGCCTGCAAGCTCTCCGACCGGGAGCACCCGCTGTACCTACGTTTGGTAGCAGGGCC  500

Query 519  CAGAACAGACACACTTAGTTTTGTTCTTCGTGAACATGAAATTGGAGAGTGGGAAGCCTTCAGCCTTCCAGAAC  592
           ||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct 501  CAGAACCGACACCCTTAGTTTTGTTCTTCGAGAGCATGAAATTGGAGAGTGGGAAGCTTTCAGCCTACCGGAGC  574

Query 593  TACAGAATTTCTTGCGCATCTTGGACAAGGAAGAAGATGAACAGCTGCAGAACCTGAAGAGGCGCTACACAGCC  666
           |.|||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct 575  TGCAGAACTTCCTGCGCATCTTGGACAAGGAAGAGGATGAGCAGCTGCAGAGCCTGAAGCGGCGCTACACAGCC  648

Query 667  TACAGGCAGAAGCTGGAAGAAGCCCTCCGTGTGGTGTGGAAGCCTGAT  714
           |||||||||||||||||.||||||||..|.|.||||||||||||.|..
Sbjct 649  TACAGGCAGAAGCTGGAGGAAGCCCTGGGCGAGGTGTGGAAGCCCGGC  696