Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09944
• Subject: XM_017019211.1
• Aligned Length: 1320
• Identities: 974
• Gaps: 345

Alignment

Query    1  ATGCGGCGCTACCTGCGCGTCGTGGTGCTGTGTGTGGCCTGCGGCTTCTGCTCGCTCCTTTACGCTTTCAGCCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTCGCCGTGTCCCTGGAAGAAGGAACGGGCGGCGGTGGCGGGAAGCCGCAGGCCGCGGTGGCTTCCTGGCTCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGGGCGGCGGACGCGGCGCCGTGAGAGGCGCCGGCGTCGCGGGCCCCGCAGCGCATCCCGGCGTGTCGGACAGG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TGTAAAGATTTCTCTCTGTGTTACTGGAATCCCTATTGGATGCTGCCCTCTGATGTTTGTGGAATGAACTGCTT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TTGGGAAGCGGCTTTTAGGTACAGTCTGAAAATACAGCCTGTTGAGAAAATGCATCTAGCTGTAGTTGCCTGTG  370
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGCATCTAGCTGTAGTTGCCTGTG  25

Query  371  GTGAAAGACTGGAAGAAACTATGACCATGTTGAAGTCAGCTATCATTTTCAGCATCAAACCTCTTCAATTCCAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   26  GTGAAAGACTGGAAGAAACTATGACCATGTTGAAGTCAGCTATCATTTTCAGCATCAAACCTCTTCAATTCCAT  99

Query  445  ATTTTTGCTGAAGATCAGCTACATCATAGCTTTAAAGGCAGACTTGACAACTGGTCATTTCTACAAACATTTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  ATTTTTGCTGAAGATCAGCTACATCATAGCTTTAAAGGCAGACTTGACAACTGGTCATTTCTACAAACATTTAA  173

Query  519  TTATACGTTATACCCCATAACCTTTCCAAGTGAGAATGCAGCAGAGTGGAAAAAACTCTTTAAACCATGTGCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  TTATACGTTATACCCCATAACCTTTCCAAGTGAGAATGCAGCAGAGTGGAAAAAACTCTTTAAACCATGTGCTT  247

Query  593  CGCAGAGATTGTTCTTGCCGTTAATCCTGAAAGAAGTTAACTCACTATTGTATGTCGACACTGATATCCTTTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  CGCAGAGATTGTTCTTGCCGTTAATCCTGAAAGAAGTTGACTCACTATTGTATGTCGACACTGATATCCTTTTT  321

Query  667  TTACGACCAGTTGATGATATTTGGTCTTTACTAAAGAAATTTAATTCCACACAAATTGCTGCAATGGCACCAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  TTACGACCAGTTGATGATATTTGGTCTTTACTAAAGAAATTTAATTCCACACAAATTGCTGCAATGGCACCAGA  395

Query  741  ACATGAGGAACCTCGAATAGGATGGTATAATCGCTTTGCTAGGCATCCATATTATGGAAAAACTGGAGTAAACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  ACATGAGGAACCTCGAATAGGATGGTATAATCGCTTTGCTAGGCATCCATATTATGGAAAAACTGGAGTAAACT  469

Query  815  CTGGAGTTATGTTGATGAACATGACTCGAATGAGAAGGAAGTATTTCAAGAATGATATGACAACTGTACGACTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  CTGGAGTTATGTTGATGAACATGACTCGAATGAGAAGGAAGTATTTCAAGAATGATATGACAACTGTACGACTA  543

Query  889  CAATGGGGAGATATACTTATGCCATTGCTTAAAAAATACAAACTAAACATCACATGGGGTGATCAAGATCTATT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  CAATGGGGAGATATACTTATGCCATTGCTTAAAAAATACAAACTAAACATCACATGGGGTGATCAAGATCTATT  617

Query  963  GAATATCGTGTTTTTTCATAATCCAGAAAGCCTTTTTGTTTTTCCGTGTCAATGGAATTATCGACCAGATCATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  GAATATCGTGTTTTTTCATAATCCAGAAAGCCTTTTTGTTTTTCCGTGTCAATGGAATTATCGACCAGATCATT  691

Query 1037  GTATATATGGAAGCAATTGCCAAGAAGCAGAAGAAGGAGGAATCTTTATTCTTCATGGGAACAGAGGTGTTTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  GTATATATGGAAGCAATTGCCAAGAAGCAGAAGAAGGAGGAATCTTTATTCTTCATGGGAACAGAGGTGTTTAC  765

Query 1111  CATGACGATAAGCAACCAGCATTTAGAGCTGTTTATGAAGCACTGAGAAATTGTTCTTTTGAAGATGACAACAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  CATGACGATAAGCAACCAGCATTTAGAGCTGTTTATGAAGCACTGAGAAATTGTTCTTTTGAAGATGACAACAT  839

Query 1185  CCGTTCCTTATTAAAACCTTTAGAACTGGAACTACAAAAAACAGTGCATACATACTGTGGAAAAATTTACAAAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  CCGTTCCTTATTAAAACCTTTAGAACTGGAACTACAAAAAACAGTGCATACATACTGTGGAAAAATTTACAAAA  913

Query 1259  TATTTATCAAACAACTAGCAAAAAGTGTAAGAGATCGTTATGCCAGATCACCAAAGGAAAAG  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  914  TATTTATCAAACAACTAGCAAAAAGTGTAAGAGATCGTTATGCCAGATCACCAAAGGAAAAG  975