Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09964
Subject:
NM_001007570.2
Aligned Length:
954
Identities:
817
Gaps:
0

Alignment

Query   1  ATGGGTAATGGTGTGAAGGAAGGCCCGGTGCGATTGCATGAGGATGCTGAGGCTGTCCTGTCCTCGTCCGTCTC  74
           |||||||||||||||.||||||||.|||||||..|||..|||||||||||.||.||||||.|...|.|||||||
Sbjct   1  ATGGGTAATGGTGTGCAGGAAGGCTCGGTGCGCCTGCGAGAGGATGCTGAAGCCGTCCTGGCTGGGGCCGTCTC  74

Query  75  ATCAAAGCGTGACCACAGGCAAGTGCTCAGCTCCCTGCTGCCTGGGGCCCTGGCTGGTGCCCTTGCCAAAACAG  148
           .||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  75  CTCGAAGAGAGACCACAGGCAAGTGCTCAGCTCCCTGCTGTCTGGAGCCCTGGCTGGTGCACTTGCCAAGACAG  148

Query 149  CGGTAGCTCCCCTGGACCGAACCAAAATCATCTTCCAAGTGTCTTCAAAAAGATTTTCTGCCAAGGAGGCCTTC  222
           |.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CAGTAGCCCCCCTGGACCGGACCAAGATCATCTTCCAAGTGTCTTCAAAAAGATTTTCTGCCAAGGAGGCCTTC  222

Query 223  CGGGTCCTCTACTACACCTACCTCAACGAGGGATTTCTCAGCTTGTGGCGCGGGAACTCGGCCACCATGGTGCG  296
           |||.|||||||||.||||||||||||.|||||.||.||||||.|.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 223  CGGCTCCTCTACTTCACCTACCTCAATGAGGGCTTCCTCAGCCTTTGGCGTGGGAACTCAGCCACCATGGTGCG  296

Query 297  CGTGGTGCCCTACGCCGCCATCCAGTTCAGCGCACACGAGGAGTACAAGCGCATCCTGGGCAGCTACTATGGCT  370
           .|||.|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 297  AGTGATTCCTTATGCAGCCATCCAGTTCAGCGCACACGAAGAATACAAGCGCATCCTGGGCCACTACTATGGCT  370

Query 371  TCCGTGGAGAAGCCCTGCCCCCTTGGCCTCGCCTCTTCGCCGGCGCACTGGCTGGAACGACAGCCGCTTCACTG  444
           |.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.||.|||||..||||.|||||.||.||.|||||.||.
Sbjct 371  TTCGTGGAGAAGCCCTGCCCCCATGGCCACGCCTCCTGGCTGGCGCCTTGGCAGGAACCACTGCGGCTTCCCTC  444

Query 445  ACCTACCCCCTGGACCTGGTCAGAGCGCGGATGGCCGTAACCCCGAAGGAAATGTACAGCAACATCTTTCATGT  518
           ||.|||||..||||||||||.|||||..|||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ACGTACCCTTTGGACCTGGTTAGAGCAAGGATGGCTGTGACGCCTAAGGAAATGTACAGCAACATCTTTCATGT  518

Query 519  CTTCATCCGCATCTCGAGAGAAGAGGGGCTGAAGACTCTCTACCATGGATTTATGCCCACCGTGCTGGGGGTCA  592
           |||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||....||.||.|..|||||.||||||||.||||
Sbjct 519  CTTCATCCGAATCTCGAGAGAGGAAGGACTGAAGACCCTCTATTTCGGGTTCACCCCCACTGTGCTGGGTGTCA  592

Query 593  TTCCCTACGCTGGCCTGAGCTTCTTCACCTATGAGACGCTCAAGAGCTTGCACAGAGAGTACAGCGGCCGCCGG  666
           |||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||.|.||.||||||.|||||.||||||||||.|||||||.|
Sbjct 593  TTCCCTATGCGGGACTCAGCTTCTTCACGTACGAGTCACTGAAGAGCCTGCACCGAGAGTACAGTGGCCGCCCG  666

Query 667  CAGCCCTACCCCTTCGAGCGCATGATCTTCGGCGCCTGCGCTGGCCTCATCGGGCAGTCGGCCTCGTACCCGCT  740
           ||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 667  CAGCCCTACCCCTTTGAGCGCATGGTCTTCGGGGCCTGTGCTGGCCTTATCGGGCAATCGGCCTCCTACCCTCT  740

Query 741  GGATGTGGTGCGGCGGCGCATGCAGACGGCCGGCGTCACGGGCTACCCGCGCGCCTCCATCGCCCGCACGCTGC  814
           |||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||.|||.||.||.|||||||....||||.||.|
Sbjct 741  GGACGTGGTGCGGCGGCGCATGCAGACAGCAGGTGTCACGGGCCACCAGCACGGCTCCATCCTGAGCACACTAC  814

Query 815  GCACCATCGTGCGGGAGGAGGGCGCCGTGCGCGGCCTCTACAAAGGCTTGAGCATGAACTGGGTCAAGGGTCCC  888
           ||.||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||.|.|||||.||.
Sbjct 815  GCTCCATTGTACGTGAGGAGGGCGCGGTGCGGGGCCTCTACAAGGGCCTGAGCATGAACTGGCTGAAGGGCCCA  888

Query 889  ATCGCCGTGGGCATCAGCTTCACCACCTTCGACCTCATGCAGATCATGCTGCGGCACCTGCAGAGC  954
           ||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|..|||||||||
Sbjct 889  ATTGCCGTGGGGATCAGCTTCACCACTTTCGACCTCATGCAGATCCTGCTGCGCCGGCTGCAGAGC  954