Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10010
- Subject:
- NM_011981.4
- Aligned Length:
- 1237
- Identities:
- 1032
- Gaps:
- 17
Alignment
Query 1 ATGATAGGCATGTTGGAAAGTCTTCAGCATGAATCAGATCTCCTTCAGCATGATCAAATTCATACTGGAGAGAA 74
||||||||.||.|||||||.|||.|||.|| ||||.||||||..||..|.||.|.|||||||.
Sbjct 1 ---------ATGTTGGAGAGCCTTCAGCCTGAGTCACAT---CTTCTGCATGACGAACCTGATCCCGGAGAGAG 62
Query 75 ACCTTATGAATGTAATGAATGTAGAAAAACTTTTAGCCTGAAGCAAAACCTTGTAGAGCATAAGAAAATGCATA 148
...||||||||||||||||||||...|.||.||.|||.||.|.||||||.|||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 63 TGTTTATGAATGTAATGAATGTAAGGAGACCTTCAGCTTGGAACAAAACTTTGTAGAACATAAGAAAACGCATA 136
Query 149 CTGGAGAGAAATCTCATGAATGCACTGAATGTGGTAAAGTGTGCTCTCGAGTCTCATCTCTTACTCTACACCTT 222
.|||||||||.||.|.|||.||.||.|..|||||..|||.||.|||.|.||.|||.||..|.||||||||.||.
Sbjct 137 GTGGAGAGAAGTCCCCTGAGTGTACAGGGTGTGGCGAAGAGTCCTCACAAGCCTCCTCATTAACTCTACATCTG 210
Query 223 AGAAGTCACACAGGAAAGAAGGCATATAAATGTAATAAATGTGGAAAAGCCTTCAGCCAGA-AGGAAAACTTCC 295
|||||||.|.||.|.|.|.||.|.||.||.|||....|||||||.||.||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 211 AGAAGTCGCCCAAGGAGGGAGTCCTACAAGTGTGGGGAATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGAGG-AAACTTCC 283
Query 296 TTTCTCATCAGAAACATCACACTGGAGAGAAACCTTATGAATGTGAAAAAGTTTCTATTCAGATGCCAACCATC 369
||||||||||||||||.||.||.|.|||||.|||...|||||.|.|.|||..|.|..|||..|||.||||||.|
Sbjct 284 TTTCTCATCAGAAACAACATACCGAAGAGAGACCCAGTGAATCTAAGAAAACTCCCGTTCCCATGACAACCACC 357
Query 370 ATCAGACACCAGAAAAATCATACAGGAACCAAACCCTATGCATGTAAGGAATGTGGCAAAGCCTTTAACGGCAA 443
.|.|||.|.||||.|| |.|||||.|..|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 358 GTTAGAAATCAGAGAA---ACACAGGGAATAAACCATACGCGTGTAAGGAGTGTGGGAAAGCCTTTAATGGCAA 428
Query 444 AGCATATCTCACTGAGCATGAGAAAATTCATACTGGAGAAAAACCATTTGAATGTAATCAGTGTGGAAGAGCCT 517
..|||||||||..||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 429 GTCATATCTCAAAGAACACGAGAAAATTCACACCGGAGAGAAACCGTTTGAATGTAGTCAGTGTGGAAGAGCCT 502
Query 518 TCAGCCAGAAGCAATACCTCATTAAACATCAGAACATCCATACTGGAAAGAAGCCCTTTAAATGTAGTGAGTGT 591
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|||.|||||.||.|||||.||||.|||||||
Sbjct 503 TCAGCCAGAAGCAATACCTCATTAAACACCAGAATATCCATAGTGGGAAGAAACCTTTTAAGTGTAATGAGTGT 576
Query 592 GGAAAAGCTTTTAGCCAGAAGGAAAACCTCATTATACATCAGAGAATCCATACTGGAGAGAAACCTTATGAATG 665
||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 577 GGTAAGGCTTTTAGCCAGAAAGAAAACCTCATTATACACCAGAGAATCCATACTGGAGAGAAGCCTTATGAATG 650
Query 666 TAAAGGGTGTGGGAAAGCTTTCATTCAGAAGTCAAGCCTCATTAGACACCAGAGAAGTCACACAGGAGAGAAAC 739
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 651 TAAAGGGTGTGGGAAAGCTTTCATTCAGAAATCAAGCCTCATCAGACACCAGAGAAGTCATACTGGAGAGAAAC 724
Query 740 CTTATACGTGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGTGGCAAGTCAAATCTCACAGAGCATGAGAAAATTCATATT 813
|.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 725 CGTATACATGTAAGGAATGTGGAAAAGCCTTCAGTGGCAAATCAAATCTGACTGAGCATGAGAAAATTCATATT 798
Query 814 GGAGAGAAACCCTACAAATGTAATGAATGTGGAACAATCTTCAGGCAGAAGCAATACCTCATTAAACATCACAA 887
||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 799 GGAGAGAAACCCTATAAGTGTAACGAATGTGGAACGATTTTCAGGCAGAAACAATACCTCATCAAACATCACAA 872
Query 888 TATTCATACAGGAGAGAAACCCTATGAATGTAATAAATGTGGAAAAGCCTTCTCTCGAATCACATCACTTATTG 961
||||||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 873 TATTCACACGGGTGAAAAGCCCTATGAGTGCAATAAGTGCGGGAAAGCCTTTTCTCGAATTACATCGCTCATTG 946
Query 962 TACATGTGAGAATTCATACAGGTGATAAGCCTTATGAGTGTAAGGTCTGTGGGAAAGCCTTCTGTCAAAGCTCA 1035
|.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 947 TCCATGTGAGAATTCACACAGGTGATAAACCCTATGAATGTAAAATCTGTGGGAAAGCCTTCTGTCAGAGTTCC 1020
Query 1036 TCTCTTACTGTGCATATGAGAAGCCATACAGGTGAGAAACCCTATGGTTGTAATGAATGTGGGAAAGCCTTTTC 1109
||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1021 TCTCTTACAGTGCATATGAGGAGCCATACGGGTGAGAAACCCTATGGCTGCAATGAATGTGGGAAGGCCTTTTC 1094
Query 1110 TCAGTTCTCAACCCTTGCTCTGCACATGAGAATCCATACTGGTGAAAAACCTTATCAGTGTAGTGAATGTGGGA 1183
||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1095 TCAGTTCTCAACTCTTGCTTTACACATGAGAATCCACACTGGGGAAAAGCCTTATCAGTGCAGTGAGTGTGGGA 1168
Query 1184 AAGCTTTCAGCCAAAAGTCGCATCACATTAGACACCAGAGAATTCATACCCAT 1236
|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|..|||
Sbjct 1169 AGGCTTTCAGCCAGAAGTCCCATCACATTAGACACCAGAGAATCCACATTCAT 1221