Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10022
• Subject: NM_001038499.1
• Aligned Length: 1719
• Identities: 1505
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGCACACCCTCACTGGCTTCTCCCTGGTCAGCCTGCTCAGCTTCGGCTACCTGTCCTGGGACTGGGCCAAGCC  74
            |||||..|.|||.|.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct    1  ATGCATGCTCTCTCAGGATTCTCCCTGGTCAGCCTACTCAGCTTGGGCTACCTGTCCTGGGATTGGGCTAAGCC  74

Query   75  GAGCTTCGTGGCCGACGGGCCCGGGGAGGCTGGCGAGCAGCCCTCGGCCGCTCCGCCCCAGCCTCCCCACATCA  148
            ..||.|.|||||.||.|||||.|..|||||||||||.|||||.||||..|||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct   75  CGGCCTTGTGGCTGATGGGCCTGCCGAGGCTGGCGATCAGCCTTCGGTGGCTCCACCGCAGCCTCCACACATTA  148

Query  149  TCTTCATCCTCACGGACGACCAAGGCTACCACGACGTGGGCTACCATGGTTCAGATATCGAGACCCCTACGCTG  222
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  TCTTCATCCTCACCGACGACCAAGGGTACCACGACGTGGGATACCATGGCTCGGATATCGAGACCCCAACGCTG  222

Query  223  GACAGGCTGGCGGCCAAGGGGGTCAAGTTGGAGAATTATTACATCCAGCCCATCTGCACGCCTTCGCGGAGCCA  296
            |||.||||.||.||..||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.||||.||
Sbjct  223  GACCGGCTAGCAGCTGAGGGCGTCAAACTGGAGAATTATTACATCCAGCCCATATGTACACCTTCGAGGAGTCA  296

Query  297  GCTCCTCACTGGCAGGTACCAGATCCACACAGGACTCCAGCATTCCATCATCCGCCCACAGCAGCCCAACTGCC  370
            .||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct  297  ACTCCTCACCGGCAGGTACCAGATCCATACAGGATTGCAGCACTCCATTATCCGCCCACGGCAGCCCAACTGTC  370

Query  371  TGCCCCTGGACCAGGTGACACTGCCACAGAAGCTGCAGGAGGCAGGTTATTCCACCCATATGGTGGGCAAGTGG  444
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  TGCCCCTGGACCAGGTGACGCTGCCCCAGAAGCTACAGGAGGCAGGCTACTCCACCCACATGGTGGGCAAGTGG  444

Query  445  CACCTGGGCTTCTACCGGAAGGAGTGTCTGCCCACCCGTCGGGGCTTCGACACCTTCCTGGGCTCGCTCACGGG  518
            ||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  445  CATCTGGGCTTCTACCGGAAGGAGTGCTTGCCTACCCGCCGGGGCTTCGACACCTTCCTGGGTTCCCTCACAGG  518

Query  519  CAATGTGGACTATTACACCTATGACAACTGTGATGGCCCAGGCGTGTGCGGCTTCGACCTGCACGAGGGTGAGA  592
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAATGTGGATTACTACACCTACGACAACTGTGATGGCCCAGGGGTTTGTGGGTTTGACCTGCACGAGGGTGAGA  592

Query  593  ATGTGGCCTGGGGGCTCAGCGGCCAGTACTCCACTATGCTTTACGCCCAGCGCGCCAGCCATATCCTGGCCAGC  666
            ..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  593  GCGTGGCCTGGGGGCTCAGCGGCCAGTACTCCACTATGCTCTACGCTCAGCGTGCAAGCCACATCCTGGCCAGC  666

Query  667  CACAGCCCTCAGCGTCCCCTCTTCCTCTATGTGGCCTTCCAGGCAGTACACACACCCCTGCAGTCCCCTCGTGA  740
            ||||..||.|||..|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct  667  CACAATCCCCAGAATCCCCTCTTTCTCTATGTGGCCTTCCAGGCAGTACACACGCCCCTACAGTCACCTCGAGA  740

Query  741  GTACCTGTACCGCTACCGCACCATGGGCAATGTGGCCCGGCGGAAGTACGCGGCCATGGTGACCTGCATGGATG  814
            .|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  ATACCTATACCGCTACCGCACGATGGGCAACGTAGCACGGCGCAAGTACGCAGCCATGGTGACCTGCATGGACG  814

Query  815  AGGCTGTGCGCAACATCACCTGGGCCCTCAAGCGCTACGGTTTCTACAACAACAGTGTCATCATCTTCTCCAGT  888
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  AGGCTGTGCGTAACATCACCTGGGCCCTCAAGCGCTATGGTTTCTATAACAACAGTGTCATTATCTTCTCCAGT  888

Query  889  GACAATGGTGGCCAGACTTTCTCGGGGGGCAGCAACTGGCCGCTCCGAGGACGCAAGGGCACTTATTGGGAAGG  962
            |||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  889  GACAATGGTGGCCAGACCTTCTCAGGGGGTAGCAACTGGCCCCTTCGAGGACGCAAGGGTACTTACTGGGAAGG  962

Query  963  TGGCGTGCGGGGCCTAGGCTTTGTCCACAGTCCCCTGCTCAAGCGAAAGCAACGGACAAGCCGGGCACTGATGC  1036
            |||.|||.|||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||..||||..||||||.||.|||||.|||.|.|
Sbjct  963  TGGTGTGAGGGGCCTGGGTTTTGTCCACAGCCCACTGCTCAAGAAAAAGAGACGGACCAGTCGGGCCCTGGTCC  1036

Query 1037  ACATCACTGACTGGTACCCGACCCTGGTGGGTCTGGCAGGTGGTACCACCTCAGCAGCCGATGGGCTAGATGGC  1110
            |.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1037  ATATCACAGACTGGTACCCAACACTGGTGGGTCTGGCAGGCGGTACTACATCAGCAGCTGATGGGCTGGATGGC  1110

Query 1111  TACGACGTGTGGCCGGCCATCAGCGAGGGCCGGGCCTCACCACGCACGGAGATCCTGCACAACATTGACCCACT  1184
            ||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1111  TATGATGTATGGCCAGCCATTAGTGAGGGCCGGGCCTCACCACGCACAGAGATCCTACACAACATCGACCCCCT  1184

Query 1185  CTACAACCATGCCCAGCATGGCTCCCTGGAGGGCGGCTTTGGCATCTGGAACACCGCCGTGCAGGCTGCCATCC  1258
            ||||||||||||||.||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1185  CTACAACCATGCCCGGCATGGATCCTTGGAGGGTGGCTTTGGGATCTGGAATACAGCAGTGCAGGCTGCTATCC  1258

Query 1259  GCGTGGGTGAGTGGAAGCTGCTGACAGGAGACCCCGGCTATGGCGATTGGATCCCACCGCAGACACTGGCCACC  1332
            |.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||.||
Sbjct 1259  GAGTTGGGGAGTGGAAGCTGCTCACTGGAGACCCAGGCTATGGTGACTGGATTCCACCTCAGACACTGGCCTCC  1332

Query 1333  TTCCCGGGTAGCTGGTGGAACCTGGAACGAATGGCCAGTGTCCGCCAGGCCGTGTGGCTCTTCAACATCAGTGC  1406
            |||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||..||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  TTCCCTGGCAGCTGGTGGAACCTGGAGCGGATGGCCAGCATCCGCCAGGCTGTGTGGCTCTTTAACATCAGTGC  1406

Query 1407  TGACCCTTATGAACGGGAGGACCTGGCTGGCCAGCGGCCTGATGTGGTCCGCACCCTGCTGGCTCGCCTGGCCG  1480
            |||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1407  TGACCCTTACGAACGAGAGGACCTGGCTGGCCAGCGACCCGATGTAGTCCGCACCCTTCTGGCTCGCCTGGCTG  1480

Query 1481  AATATAACCGCACAGCCATCCCGGTACGCTACCCAGCTGAGAACCCCCGGGCTCATCCTGACTTTAATGGGGGT  1554
            |.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATTATAACCGTACTGCCATCCCCGTGCGTTACCCAGCTGCGAACCCTCGGGCCCATCCTGACTTTAATGGGGGT  1554

Query 1555  GCTTGGGGGCCCTGGGCCAGT---GATGAGGAAGAGGAGGAAGAGGAAG-GGAGG--------GCTCGAAGCTT  1616
            |||||||||||||||||||||   ||.||||||||||||||.||||||| |||||        |||.||||.||
Sbjct 1555  GCTTGGGGGCCCTGGGCCAGTGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGGCAGAGCTAGAAGTTT  1628

Query 1617  CTCCCGGGGTCGTCGCAAGAAAAAATGCAAGATTTGCAAGCTTCGATCCTTTTTCCGTAAACTCAACACCAGGC  1690
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629  CTCCCGGGGTCGCCGCAAGAAGAAATGCAAGATTTGCAAGCTTCGATCTTTTTTCCGTAAACTCAATACCAGGC  1702

Query 1691  TAATGTCCCAACGGATC  1707
            |.||||||||.||||||
Sbjct 1703  TGATGTCCCACCGGATC  1719