Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10022
• Subject: XM_011246974.2
• Aligned Length: 1723
• Identities: 1264
• Gaps: 302

Alignment

Query    1  ATGCACACCCTCACTGGCTTCTCCCTGGTCAGCCTGCTCAGCTTCGGCTACCTGTCCTGGGACTGGGCCAAGCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAGCTTCGTGGCCGACGGGCCCGGGGAGGCTGGCGAGCAGCCCTCGGCCGCTCCGCCCCAGCCTCCCCACATCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCTTCATCCTCACGGACGACCAAGGCTACCACGACGTGGGCTACCATGGTTCAGATATCGAGACCCCTACGCTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GACAGGCTGGCGGCCAAGGGGGTCAAGTTGGAGAATTATTACATCCAG--CCCA-TCTGCACGCCTTCGCGGAG  293
                                                      ||.|||  |||| |||                
Sbjct    1  ------------------------------------------ATGCAGAACCCACTCT----------------  16

Query  294  CCAGCTCCTCACT-GGCAGGTACCAGATCCACACAGGACTCCAGCATTCCATCATCCGCCCACAGCAGCCCAAC  366
                 |||| ||| |.||.||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct   17  -----TCCT-ACTAGCCATGTACCAGATCCATACAGGATTGCAGCACTCCATTATCCGCCCACGGCAGCCCAAC  84

Query  367  TGCCTGCCCCTGGACCAGGTGACACTGCCACAGAAGCTGCAGGAGGCAGGTTATTCCACCCATATGGTGGGCAA  440
            ||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct   85  TGTCTGCCCCTGGACCAGGTGACGCTGCCCCAGAAGCTACAGGAGGCAGGCTACTCCACCCACATGGTGGGCAA  158

Query  441  GTGGCACCTGGGCTTCTACCGGAAGGAGTGTCTGCCCACCCGTCGGGGCTTCGACACCTTCCTGGGCTCGCTCA  514
            ||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  159  GTGGCATCTGGGCTTCTACCGGAAGGAGTGCTTGCCTACCCGCCGGGGCTTCGACACCTTCCTGGGTTCCCTCA  232

Query  515  CGGGCAATGTGGACTATTACACCTATGACAACTGTGATGGCCCAGGCGTGTGCGGCTTCGACCTGCACGAGGGT  588
            |.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  233  CAGGCAATGTGGATTACTACACCTACGACAACTGTGATGGCCCAGGGGTTTGTGGGTTTGACCTGCACGAGGGT  306

Query  589  GAGAATGTGGCCTGGGGGCTCAGCGGCCAGTACTCCACTATGCTTTACGCCCAGCGCGCCAGCCATATCCTGGC  662
            ||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  307  GAGAGCGTGGCCTGGGGGCTCAGCGGCCAGTACTCCACTATGCTCTACGCTCAGCGTGCAAGCCACATCCTGGC  380

Query  663  CAGCCACAGCCCTCAGCGTCCCCTCTTCCTCTATGTGGCCTTCCAGGCAGTACACACACCCCTGCAGTCCCCTC  736
            ||||||||..||.|||..|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  381  CAGCCACAATCCCCAGAATCCCCTCTTTCTCTATGTGGCCTTCCAGGCAGTACACACGCCCCTACAGTCACCTC  454

Query  737  GTGAGTACCTGTACCGCTACCGCACCATGGGCAATGTGGCCCGGCGGAAGTACGCGGCCATGGTGACCTGCATG  810
            |.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  455  GAGAATACCTATACCGCTACCGCACGATGGGCAACGTAGCACGGCGCAAGTACGCAGCCATGGTGACCTGCATG  528

Query  811  GATGAGGCTGTGCGCAACATCACCTGGGCCCTCAAGCGCTACGGTTTCTACAACAACAGTGTCATCATCTTCTC  884
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  529  GACGAGGCTGTGCGTAACATCACCTGGGCCCTCAAGCGCTATGGTTTCTATAACAACAGTGTCATTATCTTCTC  602

Query  885  CAGTGACAATGGTGGCCAGACTTTCTCGGGGGGCAGCAACTGGCCGCTCCGAGGACGCAAGGGCACTTATTGGG  958
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  603  CAGTGACAATGGTGGCCAGACCTTCTCAGGGGGTAGCAACTGGCCCCTTCGAGGACGCAAGGGTACTTACTGGG  676

Query  959  AAGGTGGCGTGCGGGGCCTAGGCTTTGTCCACAGTCCCCTGCTCAAGCGAAAGCAACGGACAAGCCGGGCACTG  1032
            |||||||.|||.|||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||..||||..||||||.||.|||||.|||
Sbjct  677  AAGGTGGTGTGAGGGGCCTGGGTTTTGTCCACAGCCCACTGCTCAAGAAAAAGAGACGGACCAGTCGGGCCCTG  750

Query 1033  ATGCACATCACTGACTGGTACCCGACCCTGGTGGGTCTGGCAGGTGGTACCACCTCAGCAGCCGATGGGCTAGA  1106
            .|.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  751  GTCCATATCACAGACTGGTACCCAACACTGGTGGGTCTGGCAGGCGGTACTACATCAGCAGCTGATGGGCTGGA  824

Query 1107  TGGCTACGACGTGTGGCCGGCCATCAGCGAGGGCCGGGCCTCACCACGCACGGAGATCCTGCACAACATTGACC  1180
            ||||||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct  825  TGGCTATGATGTATGGCCAGCCATTAGTGAGGGCCGGGCCTCACCACGCACAGAGATCCTACACAACATCGACC  898

Query 1181  CACTCTACAACCATGCCCAGCATGGCTCCCTGGAGGGCGGCTTTGGCATCTGGAACACCGCCGTGCAGGCTGCC  1254
            |.||||||||||||||||.||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  899  CCCTCTACAACCATGCCCGGCATGGATCCTTGGAGGGTGGCTTTGGGATCTGGAATACAGCAGTGCAGGCTGCT  972

Query 1255  ATCCGCGTGGGTGAGTGGAAGCTGCTGACAGGAGACCCCGGCTATGGCGATTGGATCCCACCGCAGACACTGGC  1328
            |||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  973  ATCCGAGTTGGGGAGTGGAAGCTGCTCACTGGAGACCCAGGCTATGGTGACTGGATTCCACCTCAGACACTGGC  1046

Query 1329  CACCTTCCCGGGTAGCTGGTGGAACCTGGAACGAATGGCCAGTGTCCGCCAGGCCGTGTGGCTCTTCAACATCA  1402
            |.|||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||..||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1047  CTCCTTCCCTGGCAGCTGGTGGAACCTGGAGCGGATGGCCAGCATCCGCCAGGCTGTGTGGCTCTTTAACATCA  1120

Query 1403  GTGCTGACCCTTATGAACGGGAGGACCTGGCTGGCCAGCGGCCTGATGTGGTCCGCACCCTGCTGGCTCGCCTG  1476
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1121  GTGCTGACCCTTACGAACGAGAGGACCTGGCTGGCCAGCGACCCGATGTAGTCCGCACCCTTCTGGCTCGCCTG  1194

Query 1477  GCCGAATATAACCGCACAGCCATCCCGGTACGCTACCCAGCTGAGAACCCCCGGGCTCATCCTGACTTTAATGG  1550
            ||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1195  GCTGATTATAACCGTACTGCCATCCCCGTGCGTTACCCAGCTGCGAACCCTCGGGCCCATCCTGACTTTAATGG  1268

Query 1551  GGGTGCTTGGGGGCCCTGGGCCAGT---GATGAGGAAGAGGAGGAAGAGGAAG-GGAGG--------GCTCGAA  1612
            |||||||||||||||||||||||||   ||.||||||||||||||.||||||| |||||        |||.|||
Sbjct 1269  GGGTGCTTGGGGGCCCTGGGCCAGTGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGGCAGAGCTAGAA  1342

Query 1613  GCTTCTCCCGGGGTCGTCGCAAGAAAAAATGCAAGATTTGCAAGCTTCGATCCTTTTTCCGTAAACTCAACACC  1686
            |.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1343  GTTTCTCCCGGGGTCGCCGCAAGAAGAAATGCAAGATTTGCAAGCTTCGATCTTTTTTCCGTAAACTCAATACC  1416

Query 1687  AGGCTAATGTCCCAACGGATC  1707
            |||||.||||||||.||||||
Sbjct 1417  AGGCTGATGTCCCACCGGATC  1437