Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10083
• Subject: NM_028142.4
• Aligned Length: 1157
• Identities: 994
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGGCAGCGCTGACAC-----TGAGGGGTGTCCGGGAGCTGCTGAAGCGTGTGGACCTCGCGACGGTCCCGCGG  69
            |||||.||||     |     |.||..||||.|||.||||||||||||..||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCGC-----CCGTCTTAAGATGTGTTCGGAAGCTGCTGAAGCTCGTGGACTTCACGCCGGTCCCGCGG  69

Query   70  AGACATCGATATAAGAAGAAATGGGCTGCCACAGAGCCCAAATTCCCTGCTGTTCGACTGGCTTTGCAGAATTT  143
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.||..|||||.|.||...|||.||.|||.||||||||||
Sbjct   70  AGATATCGATATAAGAAGAAATGGGCTACCACAGAACCACAATTCACGGCCAGTCGGCTTGCTCTGCAGAATTT  143

Query  144  TGACATGGCTTACAGTGTGCAGTTTGGAGATCTTTGGCCATCAATCCGTGTCAGTCTCCTCTCAGAGCAGAAGT  217
            |||||||.|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  144  TGACATGACCTACAGTGTACAGTTTGGGGATCTTTGGCCATCAATCCGTGTTAGTCTTCTCTCAGAGCAGAAGT  217

Query  218  ATGGTGCACTGGTCAATAACTTTGCTGCCTGGGATCATGTAAGTGCTAAGCTGGAGCAGCTGAGTGCCAAGGAT  291
            ||||||||.||||||||||.||||||||.||||||..|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  218  ATGGTGCATTGGTCAATAATTTTGCTGCTTGGGATAGTGTGAGTGCTAAGCTGGAGCAGCTGAGTGCCAAGGAC  291

Query  292  TTTGTGAATGAAGCCATCTCCCACTGGGAACTGCAGTCTGAGGGTGGCCAATCTGCAGCCCCATCCCCTGCCTC  365
            ||.||.|.||||||||||||.|||..|.|||||.||.|||||.||||||..|||.||.|.|||||||       
Sbjct  292  TTCGTCAGTGAAGCCATCTCTCACCAGAAACTGGAGCCTGAGAGTGGCCTCTCTCCAACTCCATCCC-------  358

Query  366  CTGGGCCTGCAGTCCGAACCTTCGATGCTTCACTTTTGACAGAGGGGATATCAGTCGCTTCCCTCCTGCCAGAC  439
              .||.||||||.||.||.||||||||||||||||||..|||||||||..||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  359  --TGGACTGCAGCCCAAATCTTCGATGCTTCACTTTTTCCAGAGGGGACGTCAGCCGCTTTCCTCCTGCCAGAC  430

Query  440  CTGGCAGCCTGGGTGTCATGGAGTACTACCTGATGGATGCTGCCTCCTTGCTGCCTGTTCTGGCCCTCGGCCTG  513
            .|||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  431  TTGGCAGCCTGGGTCTCATGGACTACTACCTGATGGATGCTGCCTCCTTGCTCCCTGTCCTGGCTCTTGGTCTG  504

Query  514  CAGCCTGGGGACATCGTGCTTGACCTATGTGCAGCTCCTGGGGGAAAGACACTAGCGTTGCTTCAGACTGGCTG  587
            ||||.|||.||||..||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct  505  CAGCATGGAGACACTGTGCTTGATCTGTGTGCTGCTCCTGGGGGCAAAACGCTGGCATTACTTCAGACGGGTTG  578

Query  588  TTGCCGCAATCTTGCTGCCAATGATCTCTCCCCGTCCCGAATAGCCAGACTACAGAAGATCCTTCACAGCTATG  661
            ||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|.|||||||.||.||||||.||||||.||||||||||.||||
Sbjct  579  TTGCCGTAATCTAGCTGCCAACGACCTCTCCACTTCCCGAACAGGCAGACTGCAGAAGGTCCTTCACAGTTATG  652

Query  662  TGCCTGAAGAGATCAGGGATGGAAATCAAGTTCGAGTTACCTCATGGGATGGCAGGAAATGGGGAGAACTGGAG  735
            |||||.||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  653  TGCCTCAAGATATTAGGGAAGGGAACCAAGTCCGAGTTACCTCATGGGATGGCAGGAAGTGGGGAGAACTGGAG  726

Query  736  GGGGACACCTATGACCGGGTGCTGGTGGATGTGCCCTGTACCACAGACCGCCACTCCCTTCATGAGGAGGAGAA  809
            ||||||||||||||..|||||.|.||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  727  GGGGACACCTATGATAGGGTGTTAGTAGATGTGCCATGTACCACGGACCGCCATTCCCTTCATGAGGAAGAGAA  800

Query  810  CAACATCTTTAAGCGGTCAAGGAAGAAGGAGCGACAGATATTGCCTGTGCTGCAAGTGCAGCTTCTTGCGGCTG  883
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  801  CAACATCTTTCAGCGGTCAAGGAAGAAGGAGCGACAGATGTTGCCTATGCTGCAGGTGCAGCTTCTTGCGGCTG  874

Query  884  GACTCCTTGCCACCAAACCAGGAGGCCATGTTGTCTATTCTACCTGCTCACTCTCACACTTACAGAACGAGTAT  957
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct  875  GACTCCTTGCCACCAAACCAGGAGGTCACGTTGTCTATTCAACTTGCTCACTGTCTCACTTACAGAATGAGTAT  948

Query  958  GTGGTGCAAGGTGCCATTGAGCTCCTGGCCAATCAATACAGCATCCAGGTACGGGTGGAAGATCTGACTCACTT  1031
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||.||||.|..||||||||.|||.|||||||
Sbjct  949  GTGGTGCAAGGTGCCATTGAGCTTCTGGCCAATCAATACAACATCAAGGTTCAAGTGGAAGACCTGTCTCACTT  1022

Query 1032  CCGAAGGGTTTTCATGGACACATTTTGTTTCTTCTCATCCTGTCAGGTTGGGGAGCTGGTAATACCAAACCTCA  1105
            |||||.|.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023  CCGAAAGCTTTTCATGGACACATTCTGTTTCTTCCCATCCTGCCAGGTTGGGGAGCTGGTAATACCAAACCTCA  1096

Query 1106  TGGCCAATTTTGGCCCCATGTACTTCTGCAAAATGCGTAGGCTGACA  1152
            |||.|||||||||.||.|||||||||||||||.|||.|||||||.||
Sbjct 1097  TGGTCAATTTTGGACCTATGTACTTCTGCAAACTGCATAGGCTGCCA  1143