Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_10145
Subject:
NM_001291459.2
Aligned Length:
1647
Identities:
1642
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGACGTGGTAGAGGTCGCGGGCAGTTGGTGGGCACAAGAGCGAGAGGACATCATTATGAAATACGAAAAGGG  74
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Sbjct    1  ATGGACGTGGTAGAGGTCGCGGGCAGTTGGTGGGCACAAGAGCGAGAGGACATCATTATGAAATACGAAAAGGG  74

Query   75  ACACCGAGCTGGGCTGCCAGAGGACAAGGGGCCTAAGCCTTTTCGAAGCTACAACAACAACGTCGATCATTTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACACCGAGCTGGGCTGCCAGAGGACAAGGGGCCTAAGCCTTTTCGAAGCTACAACAACAACGTCGATCATTTGG  148

Query  149  GGATTGTACATGAGACGGAGCTGCCTCCTCTGACTGCGCGGGAGGCGAAGCAAATTCGGCGGGAGATCAGCCGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGATTGTACATGAGACGGAGCTGCCTCCTCTGACTGCGCGGGAGGCGAAGCAAATTCGGCGGGAGATCAGCCGA  222

Query  223  AAGAGCAAGTGGGTGGATATGCTGGGAGACTGGGAGAAATACAAAAGCAGCAGAAAGCTCATAGATCGAGCGTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGAGCAAGTGGGTGGATATGCTGGGAGACTGGGAGAAATACAAAAGCAGCAGAAAGCTCATAGATCGAGCGTA  296

Query  297  CAAGGGAATGCCCATGAACATCCGGGGCCCGATGTGGTCAGTCCTCCTGAACATTGAGGAAATGAAGTTGAAAA  370
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Sbjct  297  CAAGGGAATGCCCATGAACATCCGGGGCCCGATGTGGTCAGTCCTCCTGAACACTGAGGAAATGAAGTTGAAAA  370

Query  371  ACCCCGGAAGATACCAGATCATGAAGGAGAAGGGCAAGAGGTCATCTGAGCACATCCAGCGCATCGACCGGGAC  444
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Sbjct  371  ACCCCGGAAGATACCAGATCATGAAGGAGAAGGGCAAGAGGTCATCTGAGCACATCCAGCGCATCGACCGGGAC  444

Query  445  ATAAGCGGGACATTAAGGAAGCATATGTTCTTCAGGGATCGATACGGAACCAAGCAGCGGGAACTACTCCACAT  518
            .|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTAAGCGGGACATTAAGGAAGCATATATTCTTCAGGGATCGATACGGAACCAAGCAGCGGGAACTACTCCACAT  518

Query  519  CCTCCTGGCATATGAGGAGTATAACCCGGAGGTGGGCTACTGCAGGGACCTGAGCCACATCGCCGCCTTGTTCC  592
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Sbjct  519  CCTCCTGGCATATGAGGAGTATAACCCGGAGGTGGGCTACTGCAGGGACCTGAGCCACATCGCCGCCTTGTTCC  592

Query  593  TCCTCTATCTTCCTGAGGAGGATGCATTCTGGGCACTGGTGCAGCTGCTGGCCAGTGAGAGGCACTCCCTGCAG  666
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Sbjct  593  TCCTCTATCTTCCTGAGGAGGATGCATTCTGGGCACTGGTGCAGCTGCTGGCCAGTGAGAGGCACTCCCTGCAG  666

Query  667  GGATTTCACAGCCCAAATGGCGGGACCGTCCAGGGGCTCCAAGACCAACAGGAGCATGTGGTAGCCACGTCACA  740
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Sbjct  667  GGATTTCACAGCCCAAATGGCGGGACCGTCCAGGGGCTCCAAGACCAACAGGAGCATGTGGTAGCCACGTCACA  740

Query  741  ACCCAAGACCATGGGGCATCAGGACAAGAAAGATCTATGTGGGCAGTGTTCCCCGTTAGGCTGCCTCATCCGGA  814
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Sbjct  741  ACCCAAGACCATGGGGCATCAGGACAAGAAAGATCTATGTGGGCAGTGTTCCCCGTTAGGCTGCCTCATCCGGA  814

Query  815  TATTGATTGACGGGATCTCTCTCGGGCTCACCCTGCGCCTGTGGGACGTGTATCTGGTAGAAGGCGAACAGGCG  888
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Sbjct  815  TATTGATTGACGGGATCTCTCTCGGGCTCACCCTGCGCCTGTGGGACGTGTATCTGGTAGAAGGCGAACAGGCG  888

Query  889  TTGATGCCGATAACAAGAATCGCCTTTAAGGTTCAGCAGAAGCGCCTCACGAAGACGTCCAGGTGTGGCCCGTG  962
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Sbjct  889  TTGATGCCGATAACAAGAATCGCCTTTAAGGTTCAGCAGAAGCGCCTCACGAAGACGTCCAGGTGTGGCCCGTG  962

Query  963  GGCACGTTTTTGCAACCGGTTCGTTGATACCTGGGCCAGGGATGAGGACACTGTGCTCAAGCATCTTAGGGCCT  1036
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Sbjct  963  GGCACGTTTTTGCAACCGGTTCGTTGATACCTGGGCCAGGGATGAGGACACTGTGCTCAAGCATCTTAGGGCCT  1036

Query 1037  CTATGAAGAAACTAACAAGAAAGCAGGGGGACCTGCCACCCCCAGCCAAACCCGAGCAAGGGTCGTCGGCATCC  1110
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Sbjct 1037  CTATGAAGAAACTAACAAGAAAGCAGGGGGACCTGCAACCCCCAGCCAAACCCGAGCAAGGGTCGTCGGCATCC  1110

Query 1111  AGGCCTGTGCCGGCTTCACGTGGCGGGAAGACCCTCTGCAAGGGGGACAGGCAGGCCCCTCCAGGCCCACCAGC  1184
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Sbjct 1111  AGGCCTGTGCCGGCTTCACGTGGCGGGAAGACCCTCTGCAAGGGGGACAGGCAGGCCCCTCCAGGCCCACCAGC  1184

Query 1185  CCGGTTCCCGCGGCCCATTTGGTCAGCTTCCCCGCCACGGGCACCTCGTTCTTCCACACCCTGTCCTGGTGGGG  1258
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Sbjct 1185  CCGGTTCCCGCGGCCCATTTGGTCAGCTTCCCCGCCACGGGCACCTCGTTCTTCCACACCCTGTCCTGGTGGGG  1258

Query 1259  CTGTCCGGGAAGACACCTACCCTGTGGGCACTCAGGGTGTGCCCAGCCCGGCCCTGGCTCAGGGAGGACCTCAG  1332
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Sbjct 1259  CTGTCCGGGAAGACACCTACCCTGTGGGCACTCAGGGTGTGCCCAGCCCGGCCCTGGCTCAGGGAGGACCTCAG  1332

Query 1333  GGTTCCTGGAGATTCCTGCAGTGGAACTCCATGCCCCGCCTCCCAACGGACCTGGACGTAGAGGGCCCTTGGTT  1406
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Sbjct 1333  GGTTCCTGGAGATTCCTGCAGTGGAACTCCATGCCCCGCCTCCCAACGGACCTGGACGTAGAGGGCCCTTGGTT  1406

Query 1407  CCGCCATTATGATTTCAGACAGAGCTGCTGGGTCCGTGCCATATCCCAGGAGGACCAGCTGGCCCCCTGCTGGC  1480
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Sbjct 1407  CCGCCATTATGATTTCAGACAGAGCTGCTGGGTCCGTGCCATATCCCAGGAGGACCAGCTGGCCCCCTGCTGGC  1480

Query 1481  AGGCTGAACACCCTGCGGAGCGGGTGAGATCGGCTTTCGCTGCACCCAGCACTGATTCCGACCAGGGCACCCCC  1554
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Sbjct 1481  AGGCTGAACACCCTGCGGAGCGGGTGAGATCGGCTTTCGCTGCACCCAGCACTGATTCCGACCAGGGCACCCCC  1554

Query 1555  TTCAGAGCTAGGGACGAACAGCAGTGTGCTCCCACCTCAGGGCCTTGCCTCTGCGGCCTCCACTTGGAAAGTTC  1628
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Sbjct 1555  TTCAGAGCTAGGGACGAACAGCCGTGTGCTCCCACCTCAGGGCCTTGCCTCTGCGGCCTCCACTTGGAAAGTTC  1628

Query 1629  TCAGTTCCCTCCAGGCTTC  1647
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Sbjct 1629  TCAGTTCCCTCCAGGCTTC  1647